Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4470636	4470683	48	34 [0]	[0] 7	treB	fused trehalose(maltose)‑specific enzyme IIBC component of PTS

GGGCGGCTTTTTTTACCTGCTCTTTATCAACCTGCGCCTGTCCGGTTGACGCAATCAGTGCTTGA  >  W3110S.gb/4470571‑4470635                                                                 | tgtcggcTTTTTTTACCTGCTCTTTATCAACCTGCGCCTGTCCGGTTGACGCAATCAGTGCTTGa  <  1:909496/62‑1 (MQ=255) gggCGGCTTTTTTTAGCTGCTCTTTATCAACCTGCGCCTGTCCGGTTGACGCAATCAGTGCTTGa  <  1:924258/65‑1 (MQ=255) gggCGGCTTTTTTTACCTGCTCTTTATCAACCTGCGCCTGTCCGGTTGACGCAATCAGTGCTTGa  <  1:304158/65‑1 (MQ=255) gggCGGCTTTTTTTACCTGCTCTTTATCAACCTGCGCCTGTCCGGTTGACGCAATCAGTGCTTGa  <  1:1000096/65‑1 (MQ=255) gggCGGCTTTTTTTACCTGCTCTTTATCAACCTGCGCCTGTCCGGTTGACGCAATCAGTGCTTGa  <  1:193961/65‑1 (MQ=255) gggCGGCTTTTTTTACCTGCTCTTTATCAACCTGCGCCTGTCCGGTTGACGCAATCAGTGCTTGa  <  1:2059448/65‑1 (MQ=255) gggCGGCTTTTTTTACCTGCTCTTTATCAACCTGCGCCTGTCCGGTTGACGCAATCAGTGCTTGa  <  1:2073977/65‑1 (MQ=255) gggCGGCTTTTTTTACCTGCTCTTTATCAACCTGCGCCTGTCCGGTTGACGCAATCAGTGCTTGa  <  1:2118520/65‑1 (MQ=255) gggCGGCTTTTTTTACCTGCTCTTTATCAACCTGCGCCTGTCCGGTTGACGCAATCAGTGCTTGa  <  1:23439/65‑1 (MQ=255) gggCGGCTTTTTTTACCTGCTCTTTATCAACCTGCGCCTGTCCGGTTGACGCAATCAGTGCTTGa  <  1:2533372/65‑1 (MQ=255) gggCGGCTTTTTTTACCTGCTCTTTATCAACCTGCGCCTGTCCGGTTGACGCAATCAGTGCTTGa  <  1:299516/65‑1 (MQ=255) gggCGGCTTTTTTTACCTGCTCTTTATCAACCTGCGCCTGTCCGGTTGACGCAATCAGTGCTTGa  <  1:1921598/65‑1 (MQ=255) gggCGGCTTTTTTTACCTGCTCTTTATCAACCTGCGCCTGTCCGGTTGACGCAATCAGTGCTTGa  <  1:399782/65‑1 (MQ=255) gggCGGCTTTTTTTACCTGCTCTTTATCAACCTGCGCCTGTCCGGTTGACGCAATCAGTGCTTGa  <  1:446915/65‑1 (MQ=255) gggCGGCTTTTTTTACCTGCTCTTTATCAACCTGCGCCTGTCCGGTTGACGCAATCAGTGCTTGa  <  1:511446/65‑1 (MQ=255) gggCGGCTTTTTTTACCTGCTCTTTATCAACCTGCGCCTGTCCGGTTGACGCAATCAGTGCTTGa  <  1:771823/65‑1 (MQ=255) gggCGGCTTTTTTTACCTGCTCTTTATCAACCTGCGCCTGTCCGGTTGACGCAATCAGTGCTTGa  <  1:97196/65‑1 (MQ=255) gggCGGCTTTTTTTACCTGCTCTTTATCAACCTGCGCCTGTCCGGTTGACGCAATCAGTGCTTGa  <  1:1272589/65‑1 (MQ=255) gggCGGCTTTTTTTACCTGCTCTTTATCAACCTGCGCCTGTCCGGTTGACGCAATCAGTGCTTGa  <  1:1090582/65‑1 (MQ=255) gggCGGCTTTTTTTACCTGCTCTTTATCAACCTGCGCCTGTCCGGTTGACGCAATCAGTGCTTGa  <  1:111932/65‑1 (MQ=255) gggCGGCTTTTTTTACCTGCTCTTTATCAACCTGCGCCTGTCCGGTTGACGCAATCAGTGCTTGa  <  1:119989/65‑1 (MQ=255) gggCGGCTTTTTTTACCTGCTCTTTATCAACCTGCGCCTGTCCGGTTGACGCAATCAGTGCTTGa  <  1:1215188/65‑1 (MQ=255) gggCGGCTTTTTTTACCTGCTCTTTATCAACCTGCGCCTGTCCGGTTGACGCAATCAGTGCTTGa  <  1:1245855/65‑1 (MQ=255) gggCGGCTTTTTTTACCTGCTCTTTATCAACCTGCGCCTGTCCGGTTGACGCAATCAGTGCTTGa  <  1:1248851/65‑1 (MQ=255) gggCGGCTTTTTTTACCTGCTCTTTATCAACCTGCGCCTGTCCGGTTGACGCAATCAGTGCTTGa  <  1:1258083/65‑1 (MQ=255) gggCGGCTTTTTTTACCTGCTCTTTATCAACCTGCGCCTGTCCGGTTGACGCAATCAGTGCTTGa  <  1:1270083/65‑1 (MQ=255) gggCGGCTTTTTTTACCTGCTCTTTATCAACCTGCGCCTGTCCGGTTGACGCAATCAGTGCTTGa  <  1:1918599/65‑1 (MQ=255) gggCGGCTTTTTTTACCTGCTCTTTATCAACCTGCGCCTGTCCGGTTGACGCAATCAGTGCTTGa  <  1:153764/65‑1 (MQ=255) gggCGGCTTTTTTTACCTGCTCTTTATCAACCTGCGCCTGTCCGGTTGACGCAATCAGTGCTTGa  <  1:1552227/65‑1 (MQ=255) gggCGGCTTTTTTTACCTGCTCTTTATCAACCTGCGCCTGTCCGGTTGACGCAATCAGTGCTTGa  <  1:1567038/65‑1 (MQ=255) gggCGGCTTTTTTTACCTGCTCTTTATCAACCTGCGCCTGTCCGGTTGACGCAATCAGTGCTTGa  <  1:167910/65‑1 (MQ=255) gggCGGCTTTTTTTACCTGCTCTTTATCAACCTGCGCCTGTCCGGTTGACGCAATCAGTGCTTGa  <  1:1811147/65‑1 (MQ=255) gggCGGCTTTTTTTACCTGCTCTTTATCAACCTGCGCCTGTCCGGTTGACGCAATCAGTGCTTGa  <  1:1840765/65‑1 (MQ=255) gggCGGCTTTTTTTACCTGCTCTTTATCAACCTGCGCCTGTCCGGTTGACGCAATCAGTGCTGGa  <  1:2480/65‑1 (MQ=255)                                                                 | GGGCGGCTTTTTTTACCTGCTCTTTATCAACCTGCGCCTGTCCGGTTGACGCAATCAGTGCTTGA  >  W3110S.gb/4470571‑4470635

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑