Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4552579	4552609	31	29 [0]	[0] 10	fimF	minor component of type 1 fimbriae

GCTATGTCAGGGATAACGGCTGTAGTGTGGCCGCTGAATCAACCAATTTTACTGTTGATCTGAT  >  W3110S.gb/4552515‑4552578                                                                | gCTATGTCAGGGATAACGGCTGTAGTGTGGCCGCTGAATCAACCAATTTTACTGTTGATCTGAt  >  1:2041551/1‑64 (MQ=255) gCTATGTCAGGGATAACGGCTGTAGTGTGGCCGCTGAATCAACCAATTTTACTGTTGATCTGAt  >  1:921533/1‑64 (MQ=255) gCTATGTCAGGGATAACGGCTGTAGTGTGGCCGCTGAATCAACCAATTTTACTGTTGATCTGAt  >  1:870565/1‑64 (MQ=255) gCTATGTCAGGGATAACGGCTGTAGTGTGGCCGCTGAATCAACCAATTTTACTGTTGATCTGAt  >  1:849203/1‑64 (MQ=255) gCTATGTCAGGGATAACGGCTGTAGTGTGGCCGCTGAATCAACCAATTTTACTGTTGATCTGAt  >  1:774199/1‑64 (MQ=255) gCTATGTCAGGGATAACGGCTGTAGTGTGGCCGCTGAATCAACCAATTTTACTGTTGATCTGAt  >  1:632910/1‑64 (MQ=255) gCTATGTCAGGGATAACGGCTGTAGTGTGGCCGCTGAATCAACCAATTTTACTGTTGATCTGAt  >  1:58444/1‑64 (MQ=255) gCTATGTCAGGGATAACGGCTGTAGTGTGGCCGCTGAATCAACCAATTTTACTGTTGATCTGAt  >  1:541106/1‑64 (MQ=255) gCTATGTCAGGGATAACGGCTGTAGTGTGGCCGCTGAATCAACCAATTTTACTGTTGATCTGAt  >  1:312077/1‑64 (MQ=255) gCTATGTCAGGGATAACGGCTGTAGTGTGGCCGCTGAATCAACCAATTTTACTGTTGATCTGAt  >  1:310094/1‑64 (MQ=255) gCTATGTCAGGGATAACGGCTGTAGTGTGGCCGCTGAATCAACCAATTTTACTGTTGATCTGAt  >  1:2424732/1‑64 (MQ=255) gCTATGTCAGGGATAACGGCTGTAGTGTGGCCGCTGAATCAACCAATTTTACTGTTGATCTGAt  >  1:2391853/1‑64 (MQ=255) gCTATGTCAGGGATAACGGCTGTAGTGTGGCCGCTGAATCAACCAATTTTACTGTTGATCTGAt  >  1:228280/1‑64 (MQ=255) gCTATGTCAGGGATAACGGCTGTAGTGTGGCCGCTGAATCAACCAATTTTACTGTTGATCTGAt  >  1:2127443/1‑64 (MQ=255) gCTATGTCAGGGATAACGGCTGTAGTGTGGCCGCTGAATCAACCAATTTTACTGTTGATCTGAt  >  1:1161169/1‑64 (MQ=255) gCTATGTCAGGGATAACGGCTGTAGTGTGGCCGCTGAATCAACCAATTTTACTGTTGATCTGAt  >  1:2008636/1‑64 (MQ=255) gCTATGTCAGGGATAACGGCTGTAGTGTGGCCGCTGAATCAACCAATTTTACTGTTGATCTGAt  >  1:1903660/1‑64 (MQ=255) gCTATGTCAGGGATAACGGCTGTAGTGTGGCCGCTGAATCAACCAATTTTACTGTTGATCTGAt  >  1:1824275/1‑64 (MQ=255) gCTATGTCAGGGATAACGGCTGTAGTGTGGCCGCTGAATCAACCAATTTTACTGTTGATCTGAt  >  1:1749373/1‑64 (MQ=255) gCTATGTCAGGGATAACGGCTGTAGTGTGGCCGCTGAATCAACCAATTTTACTGTTGATCTGAt  >  1:172652/1‑64 (MQ=255) gCTATGTCAGGGATAACGGCTGTAGTGTGGCCGCTGAATCAACCAATTTTACTGTTGATCTGAt  >  1:1721520/1‑64 (MQ=255) gCTATGTCAGGGATAACGGCTGTAGTGTGGCCGCTGAATCAACCAATTTTACTGTTGATCTGAt  >  1:169820/1‑64 (MQ=255) gCTATGTCAGGGATAACGGCTGTAGTGTGGCCGCTGAATCAACCAATTTTACTGTTGATCTGAt  >  1:1550021/1‑64 (MQ=255) gCTATGTCAGGGATAACGGCTGTAGTGTGGCCGCTGAATCAACCAATTTTACTGTTGATCTGAt  >  1:1512137/1‑64 (MQ=255) gCTATGTCAGGGATAACGGCTGTAGTGTGGCCGCTGAATCAACCAATTTTACTGTTGATCTGAt  >  1:1479998/1‑64 (MQ=255) gCTATGTCAGGGATAACGGCTGTAGTGTGGCCGCTGAATCAACCAATTTTACTGTTGATCTGAt  >  1:1393742/1‑64 (MQ=255) gCTATGTCAGGGATAACGGCTGTAGTGTGGCCGCTGAATCAACCAATTTTACTGTTGATCTGAt  >  1:1355725/1‑64 (MQ=255) gCTATGTCAGGGATAACGGCTGTAGTGTGGCCGCTGAATCAACCAATTTTACTGTTGATCTGAt  >  1:1344314/1‑64 (MQ=255) gCTATGTCAGGGATAACGGCTGTAGTGTGGCCGCTGAATCAACCAATTTTAATGTTGATCTGAt  >  1:2484325/1‑64 (MQ=255)                                                                | GCTATGTCAGGGATAACGGCTGTAGTGTGGCCGCTGAATCAACCAATTTTACTGTTGATCTGAT  >  W3110S.gb/4552515‑4552578

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑