Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4596881	4596894	14	32 [0]	[0] 11	tsr	methyl‑accepting chemotaxis protein I, serine sensor receptor

CAGGACGGTTTCGAGAAGCAGTATGTGGCTTACATGGAGCAAAACGATCGGCTCCATGATATCGC  >  W3110S.gb/4596816‑4596880                                                                 | cAGGACGGTTTCGAGAAGCAGTATGTGGCTTACATGGAGCAAAACGATCGGCTCCATGATATCGc  >  1:1892767/1‑65 (MQ=255) cAGGACGGTTTCGAGAAGCAGTATGTGGCTTACATGGAGCAAAACGATCGGCTCCATGATATCGc  >  1:953521/1‑65 (MQ=255) cAGGACGGTTTCGAGAAGCAGTATGTGGCTTACATGGAGCAAAACGATCGGCTCCATGATATCGc  >  1:940043/1‑65 (MQ=255) cAGGACGGTTTCGAGAAGCAGTATGTGGCTTACATGGAGCAAAACGATCGGCTCCATGATATCGc  >  1:939860/1‑65 (MQ=255) cAGGACGGTTTCGAGAAGCAGTATGTGGCTTACATGGAGCAAAACGATCGGCTCCATGATATCGc  >  1:618548/1‑65 (MQ=255) cAGGACGGTTTCGAGAAGCAGTATGTGGCTTACATGGAGCAAAACGATCGGCTCCATGATATCGc  >  1:28871/1‑65 (MQ=255) cAGGACGGTTTCGAGAAGCAGTATGTGGCTTACATGGAGCAAAACGATCGGCTCCATGATATCGc  >  1:2522633/1‑65 (MQ=255) cAGGACGGTTTCGAGAAGCAGTATGTGGCTTACATGGAGCAAAACGATCGGCTCCATGATATCGc  >  1:2424137/1‑65 (MQ=255) cAGGACGGTTTCGAGAAGCAGTATGTGGCTTACATGGAGCAAAACGATCGGCTCCATGATATCGc  >  1:2356486/1‑65 (MQ=255) cAGGACGGTTTCGAGAAGCAGTATGTGGCTTACATGGAGCAAAACGATCGGCTCCATGATATCGc  >  1:2309002/1‑65 (MQ=255) cAGGACGGTTTCGAGAAGCAGTATGTGGCTTACATGGAGCAAAACGATCGGCTCCATGATATCGc  >  1:2281806/1‑65 (MQ=255) cAGGACGGTTTCGAGAAGCAGTATGTGGCTTACATGGAGCAAAACGATCGGCTCCATGATATCGc  >  1:225767/1‑65 (MQ=255) cAGGACGGTTTCGAGAAGCAGTATGTGGCTTACATGGAGCAAAACGATCGGCTCCATGATATCGc  >  1:2228832/1‑65 (MQ=255) cAGGACGGTTTCGAGAAGCAGTATGTGGCTTACATGGAGCAAAACGATCGGCTCCATGATATCGc  >  1:2146859/1‑65 (MQ=255) cAGGACGGTTTCGAGAAGCAGTATGTGGCTTACATGGAGCAAAACGATCGGCTCCATGATATCGc  >  1:2093525/1‑65 (MQ=255) cAGGACGGTTTCGAGAAGCAGTATGTGGCTTACATGGAGCAAAACGATCGGCTCCATGATATCGc  >  1:20752/1‑65 (MQ=255) cAGGACGGTTTCGAGAAGCAGTATGTGGCTTACATGGAGCAAAACGATCGGCTCCATGATATCGc  >  1:1069732/1‑65 (MQ=255) cAGGACGGTTTCGAGAAGCAGTATGTGGCTTACATGGAGCAAAACGATCGGCTCCATGATATCGc  >  1:1846451/1‑65 (MQ=255) cAGGACGGTTTCGAGAAGCAGTATGTGGCTTACATGGAGCAAAACGATCGGCTCCATGATATCGc  >  1:1834201/1‑65 (MQ=255) cAGGACGGTTTCGAGAAGCAGTATGTGGCTTACATGGAGCAAAACGATCGGCTCCATGATATCGc  >  1:1807312/1‑65 (MQ=255) cAGGACGGTTTCGAGAAGCAGTATGTGGCTTACATGGAGCAAAACGATCGGCTCCATGATATCGc  >  1:1787085/1‑65 (MQ=255) cAGGACGGTTTCGAGAAGCAGTATGTGGCTTACATGGAGCAAAACGATCGGCTCCATGATATCGc  >  1:1749917/1‑65 (MQ=255) cAGGACGGTTTCGAGAAGCAGTATGTGGCTTACATGGAGCAAAACGATCGGCTCCATGATATCGc  >  1:1746918/1‑65 (MQ=255) cAGGACGGTTTCGAGAAGCAGTATGTGGCTTACATGGAGCAAAACGATCGGCTCCATGATATCGc  >  1:1689761/1‑65 (MQ=255) cAGGACGGTTTCGAGAAGCAGTATGTGGCTTACATGGAGCAAAACGATCGGCTCCATGATATCGc  >  1:163736/1‑65 (MQ=255) cAGGACGGTTTCGAGAAGCAGTATGTGGCTTACATGGAGCAAAACGATCGGCTCCATGATATCGc  >  1:1572941/1‑65 (MQ=255) cAGGACGGTTTCGAGAAGCAGTATGTGGCTTACATGGAGCAAAACGATCGGCTCCATGATATCGc  >  1:1527928/1‑65 (MQ=255) cAGGACGGTTTCGAGAAGCAGTATGTGGCTTACATGGAGCAAAACGATCGGCTCCATGATATCGc  >  1:1487309/1‑65 (MQ=255) cAGGACGGTTTCGAGAAGCAGTATGTGGCTTACATGGAGCAAAACGATCGGCTCCATGATATCGc  >  1:1424432/1‑65 (MQ=255) cAGGACGGTTTCGAGAAGCAGTATGTGGCTTACATGGAGCAAAACGATCGGCTCCATGATATCGc  >  1:1235635/1‑65 (MQ=255) cAGGACGGTTTCGAGAAGCAGTATGTGGCTTACATGGAGCAAAACGATCGGCTCCATGATATCGc  >  1:1072615/1‑65 (MQ=255) cAGGACGGTTTCGAGAAGCAGTATGTGGCTTACATGGAGCAAAACGATCGGCTCCATGATATCGc  >  1:107073/1‑65 (MQ=255)                                                                 | CAGGACGGTTTCGAGAAGCAGTATGTGGCTTACATGGAGCAAAACGATCGGCTCCATGATATCGC  >  W3110S.gb/4596816‑4596880

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑