Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4640544	4640625	82	34 [0]	[0] 24	creA	conserved hypothetical protein

CGTATTAAAAACGGCAAAGCTCAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTAA  >  W3110S.gb/4640479‑4640543                                                                 | cGTATTAAAAACGGCAAAGCTCAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTaa  <  1:2266591/65‑1 (MQ=255) cGTATTAAAAACGGCAAAGCTCAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTaa  <  1:998566/65‑1 (MQ=255) cGTATTAAAAACGGCAAAGCTCAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTaa  <  1:954394/65‑1 (MQ=255) cGTATTAAAAACGGCAAAGCTCAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTaa  <  1:899668/65‑1 (MQ=255) cGTATTAAAAACGGCAAAGCTCAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTaa  <  1:713040/65‑1 (MQ=255) cGTATTAAAAACGGCAAAGCTCAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTaa  <  1:555707/65‑1 (MQ=255) cGTATTAAAAACGGCAAAGCTCAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTaa  <  1:506697/65‑1 (MQ=255) cGTATTAAAAACGGCAAAGCTCAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTaa  <  1:474743/65‑1 (MQ=255) cGTATTAAAAACGGCAAAGCTCAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTaa  <  1:367330/65‑1 (MQ=255) cGTATTAAAAACGGCAAAGCTCAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTaa  <  1:333154/65‑1 (MQ=255) cGTATTAAAAACGGCAAAGCTCAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTaa  <  1:2465012/65‑1 (MQ=255) cGTATTAAAAACGGCAAAGCTCAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTaa  <  1:2340439/65‑1 (MQ=255) cGTATTAAAAACGGCAAAGCTCAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTaa  <  1:2266225/65‑1 (MQ=255) cGTATTAAAAACGGCAAAGCTCAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTaa  <  1:2259195/65‑1 (MQ=255) cGTATTAAAAACGGCAAAGCTCAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTaa  <  1:2158723/65‑1 (MQ=255) cGTATTAAAAACGGCAAAGCTCAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTaa  <  1:1043738/65‑1 (MQ=255) cGTATTAAAAACGGCAAAGCTCAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTaa  <  1:1104094/65‑1 (MQ=255) cGTATTAAAAACGGCAAAGCTCAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTaa  <  1:1245178/65‑1 (MQ=255) cGTATTAAAAACGGCAAAGCTCAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTaa  <  1:127610/65‑1 (MQ=255) cGTATTAAAAACGGCAAAGCTCAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTaa  <  1:1376523/65‑1 (MQ=255) cGTATTAAAAACGGCAAAGCTCAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTaa  <  1:1524506/65‑1 (MQ=255) cGTATTAAAAACGGCAAAGCTCAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTaa  <  1:1527764/65‑1 (MQ=255) cGTATTAAAAACGGCAAAGCTCAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTaa  <  1:2091042/65‑1 (MQ=255) cGTATTAAAAACGGCAAAGCTCAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTaa  <  1:221478/65‑1 (MQ=255)  gTATTAAAAACGGCAAAGCTCAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTaa  <  1:2488135/64‑1 (MQ=255)  gTATTAAAAACGGCAAAGCTCAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTaa  <  1:1917627/64‑1 (MQ=255)  gTATTAAAAACGGCAAAGCTCAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTaa  <  1:1045270/64‑1 (MQ=255)    aTTAAAAACGGCAAAGCTCAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTaa  <  1:1408151/62‑1 (MQ=255)       ataaaCGGCAAAGGTCAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTaa  <  1:1012814/57‑1 (MQ=255)               cAAAGCTCAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTaa  <  1:514658/51‑1 (MQ=255)                     tCAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTaa  <  1:2379380/45‑1 (MQ=255)                      cAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTaa  <  1:2510179/44‑1 (MQ=255)                          gCGAGTTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTaa  <  1:564514/40‑1 (MQ=255)                          gCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTaa  <  1:1400934/40‑1 (MQ=255)                                                                 | CGTATTAAAAACGGCAAAGCTCAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTAA  >  W3110S.gb/4640479‑4640543

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑