Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	357297	357298	2	12 [0]	[0] 11	cynR	DNA‑binding transcriptional dual regulator

TCGCCTCAATGACCACCTGTGGATGTAGCCCCGCTTTCTCGCAGTA  >  W3110S.gb/357251‑357296                                              | tCGCCTCAATGACCACCTGTGGATGTAGCCCCGCTTTCTCGCagta  >  1:1064596/1‑46 (MQ=255) tCGCCTCAATGACCACCTGTGGATGTAGCCCCGCTTTCTCGCagta  >  1:1218530/1‑46 (MQ=255) tCGCCTCAATGACCACCTGTGGATGTAGCCCCGCTTTCTCGCagta  >  1:1344447/1‑46 (MQ=255) tCGCCTCAATGACCACCTGTGGATGTAGCCCCGCTTTCTCGCagta  >  1:1416016/1‑46 (MQ=255) tCGCCTCAATGACCACCTGTGGATGTAGCCCCGCTTTCTCGCagta  >  1:1739490/1‑46 (MQ=255) tCGCCTCAATGACCACCTGTGGATGTAGCCCCGCTTTCTCGCagta  >  1:1808731/1‑46 (MQ=255) tCGCCTCAATGACCACCTGTGGATGTAGCCCCGCTTTCTCGCagta  >  1:1959354/1‑46 (MQ=255) tCGCCTCAATGACCACCTGTGGATGTAGCCCCGCTTTCTCGCagta  >  1:2210118/1‑46 (MQ=255) tCGCCTCAATGACCACCTGTGGATGTAGCCCCGCTTTCTCGCagta  >  1:224213/1‑46 (MQ=255) tCGCCTCAATGACCACCTGTGGATGTAGCCCCGCTTTCTCGCagta  >  1:2288666/1‑46 (MQ=255) tCGCCTCAATGACCACCTGTGGATGTAGCCCCGCTTTCTCGCagta  >  1:466995/1‑46 (MQ=255) tCGCCTCAATGACCACCTGTGGATGTAGCCCCGCTTTCTCGCagta  >  1:787359/1‑46 (MQ=255)                                              | TCGCCTCAATGACCACCTGTGGATGTAGCCCCGCTTTCTCGCAGTA  >  W3110S.gb/357251‑357296

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑