Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 400981 401003 23 88 [2] [0] 16 phoA alkaline phosphatase

ACTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACAAAGCACTA  >  W3110S.gb/400916‑400986
                                                                |      
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:2520802/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:458679/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:427373/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:423558/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:399528/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:343356/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:336188/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:327952/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:288891/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:274015/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:2531345/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:541286/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:2504505/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:2497739/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:2471229/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:2466014/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:2465695/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:239707/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:238587/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:1011370/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:2209686/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:743771/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:992071/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:98487/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:982792/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:975851/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:942447/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:936441/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:909188/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:817379/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:806530/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:789300/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:2275057/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:717434/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:712102/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:70315/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:677343/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:647071/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:637402/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:629646/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:585972/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:549555/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:1463158/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:1682580/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:2190048/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:1665416/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:157800/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:1570293/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:1536272/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:1535572/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:1503896/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:1494982/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:1468444/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:1681253/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:1452457/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:1386782/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:1348311/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:1283234/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:1274314/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:1191466/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:1165799/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:1137504/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:1080892/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:1708293/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:2186438/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:2170505/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:2168411/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:2159166/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:2084869/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:2083935/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:2076348/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:2055293/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:1990313/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:1974535/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:1914849/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:1911933/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:1873182/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:1798788/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:1768766/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:176497/65‑1 (MQ=255)
aCTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:1685015/65‑1 (MQ=255)
 cTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:1479945/64‑1 (MQ=255)
 cTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:811767/64‑1 (MQ=255)
       gTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACAAAGCACTa  <  1:334394/64‑1 (MQ=255)
             ttGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:1491242/52‑1 (MQ=255)
              tGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:1941005/51‑1 (MQ=255)
                 ttttATTTTTTAATGTATTTGTACATGTAGAAAATAAAGTGAAACAAAGCACTa  <  1:413748/54‑1 (MQ=255)
                    tATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACaaa        <  1:620597/45‑1 (MQ=255)
                                                                |      
ACTTATAGTCGCTTTGTTTTTATTTTTTAATGTATTTGTACATGGAGAAAATAAAGTGAAACAAAGCACTA  >  W3110S.gb/400916‑400986

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: