Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	401813	401830	18	32 [3]	[0] 35	phoA	alkaline phosphatase

AGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGTTTGCTGACG  >  W3110S.gb/401748‑401820                                                                 |         aGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGtt          >  1:1010766/1‑65 (MQ=255) aGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGtt          >  1:764452/1‑65 (MQ=255) aGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGtt          >  1:707126/1‑65 (MQ=255) aGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGtt          >  1:472266/1‑65 (MQ=255) aGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGtt          >  1:2512296/1‑65 (MQ=255) aGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGtt          >  1:2449667/1‑65 (MQ=255) aGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGtt          >  1:2434209/1‑65 (MQ=255) aGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGtt          >  1:2384701/1‑65 (MQ=255) aGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGtt          >  1:2374138/1‑65 (MQ=255) aGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGtt          >  1:2283089/1‑65 (MQ=255) aGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGtt          >  1:2236782/1‑65 (MQ=255) aGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGtt          >  1:212940/1‑65 (MQ=255) aGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGtt          >  1:2126555/1‑65 (MQ=255) aGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGtt          >  1:1949868/1‑65 (MQ=255) aGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGtt          >  1:1763238/1‑65 (MQ=255) aGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGtt          >  1:1662760/1‑65 (MQ=255) aGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGtt          >  1:1010473/1‑65 (MQ=255) aGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGtt          >  1:107914/1‑65 (MQ=255) aGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGtt          >  1:1107608/1‑65 (MQ=255) aGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGtt          >  1:111526/1‑65 (MQ=255) aGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGtt          >  1:1278076/1‑65 (MQ=255) aGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGtt          >  1:135429/1‑65 (MQ=255) aGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGtt          >  1:1358312/1‑65 (MQ=255) aGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGtt          >  1:1387489/1‑65 (MQ=255) aGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGtt          >  1:1429451/1‑65 (MQ=255) aGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGtt          >  1:156170/1‑65 (MQ=255) aGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGtt          >  1:159064/1‑65 (MQ=255) aGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGtt          >  1:1594082/1‑65 (MQ=255) aGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGtt          >  1:1759261/1‑65 (MQ=255)          gcCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGTTTGCTGACg  <  1:1460646/64‑1 (MQ=255)          gcCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGTTTGCTGACg  <  1:691271/64‑1 (MQ=255)          gcCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGTTTGCTGACg  <  1:920283/64‑1 (MQ=255)                                                                 |         AGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGTTTGCTGACG  >  W3110S.gb/401748‑401820

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑