Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	479819	479853	35	32 [0]	[0] 27	ybaJ	hypothetical protein

GTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCAACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTC  >  W3110S.gb/479755‑479818                                                                | gTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCAACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTc  <  1:228931/64‑1 (MQ=255) gTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCAACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTc  <  1:90223/64‑1 (MQ=255) gTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCAACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTc  <  1:803650/64‑1 (MQ=255) gTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCAACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTc  <  1:749030/64‑1 (MQ=255) gTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCAACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTc  <  1:675864/64‑1 (MQ=255) gTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCAACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTc  <  1:578925/64‑1 (MQ=255) gTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCAACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTc  <  1:526350/64‑1 (MQ=255) gTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCAACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTc  <  1:373995/64‑1 (MQ=255) gTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCAACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTc  <  1:353635/64‑1 (MQ=255) gTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCAACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTc  <  1:343991/64‑1 (MQ=255) gTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCAACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTc  <  1:282436/64‑1 (MQ=255) gTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCAACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTc  <  1:2506232/64‑1 (MQ=255) gTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCAACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTc  <  1:241877/64‑1 (MQ=255) gTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCAACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTc  <  1:2364675/64‑1 (MQ=255) gTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCAACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTc  <  1:1143043/64‑1 (MQ=255) gTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCAACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTc  <  1:1664474/64‑1 (MQ=255) gTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCAACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTc  <  1:1227106/64‑1 (MQ=255) gTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCAACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTc  <  1:1480707/64‑1 (MQ=255) gTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCAACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTc  <  1:1568190/64‑1 (MQ=255) gTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCAACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTc  <  1:1583514/64‑1 (MQ=255) gTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCAACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTc  <  1:1631952/64‑1 (MQ=255) gTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCAACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTc  <  1:2285176/64‑1 (MQ=255) gTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCAACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTc  <  1:1854935/64‑1 (MQ=255) gTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCAACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTc  <  1:1861128/64‑1 (MQ=255) gTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCAACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTc  <  1:191854/64‑1 (MQ=255) gTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCAACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTc  <  1:2024323/64‑1 (MQ=255) gTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCAACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTc  <  1:2059412/64‑1 (MQ=255) gTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCAACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTc  <  1:2279334/64‑1 (MQ=255)  tGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCAACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTc  <  1:1772797/63‑1 (MQ=255)  tGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCAACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTc  <  1:670075/63‑1 (MQ=255)  tGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCAACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTc  <  1:154963/63‑1 (MQ=255)                        aTCAGTTCATTCAACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTc  <  1:831512/41‑1 (MQ=255)                                                                | GTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCAACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTC  >  W3110S.gb/479755‑479818

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑