Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	522648	522749	102	12 [0]	[0] 4	rhsD	rhsD element protein

CGTGGCGTGCTCGGTGTGTCCGGGCGGGATGACTTCGGGCAACCCGGTAAATCCGCTGCTGGGGG  >  W3110S.gb/522583‑522647                                                                 | cgtggcgtgCTCGGTGTGTCCGGGCGGGATGACTTCGGGCAACCCGGTAAATCCGCTGCTggggg  <  1:1293284/65‑1 (MQ=255) cgtggcgtgCTCGGTGTGTCCGGGCGGGATGACTTCGGGCAACCCGGTAAATCCGCTGCTggggg  <  1:1783309/65‑1 (MQ=255) cgtggcgtgCTCGGTGTGTCCGGGCGGGATGACTTCGGGCAACCCGGTAAATCCGCTGCTggggg  <  1:1842919/65‑1 (MQ=255) cgtggcgtgCTCGGTGTGTCCGGGCGGGATGACTTCGGGCAACCCGGTAAATCCGCTGCTggggg  <  1:1885495/65‑1 (MQ=255) cgtggcgtgCTCGGTGTGTCCGGGCGGGATGACTTCGGGCAACCCGGTAAATCCGCTGCTggggg  <  1:2041416/65‑1 (MQ=255) cgtggcgtgCTCGGTGTGTCCGGGCGGGATGACTTCGGGCAACCCGGTAAATCCGCTGCTggggg  <  1:2378469/65‑1 (MQ=255) cgtggcgtgCTCGGTGTGTCCGGGCGGGATGACTTCGGGCAACCCGGTAAATCCGCTGCTggggg  <  1:2390187/65‑1 (MQ=255) cgtggcgtgCTCGGTGTGTCCGGGCGGGATGACTTCGGGCAACCCGGTAAATCCGCTGCTggggg  <  1:474485/65‑1 (MQ=255) cgtggcgtgCTCGGTGTGTCCGGGCGGGATGACTTCGGGCAACCCGGTAAATCCGCTGCTggggg  <  1:741319/65‑1 (MQ=255) cgtggcgtgCTCGGTGTGTCCGGGCGGGATGACTTCGGGCAACCCGGTAAATCCGCTGCTggggg  <  1:870686/65‑1 (MQ=255) cgtggcgtgCTCGGTGTGTCCGGGCGGGATGACTTCGGGCAACCCGGTAAATCCGCTGCTggggg  <  1:877053/65‑1 (MQ=255) cgtggcgtgCTCGGTGTGTCCGGGCGGGATGACTTCGGGCAACCCGGTAAATCCGCTGCTggggg  <  1:908973/65‑1 (MQ=255)                                                                 | CGTGGCGTGCTCGGTGTGTCCGGGCGGGATGACTTCGGGCAACCCGGTAAATCCGCTGCTGGGGG  >  W3110S.gb/522583‑522647

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑