Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	572306	572309	4	47 [0]	[0] 26	ninE	conserved hypothetical protein

CACTGCTCGGATATACCGCCAGCTTGGTTGATAAAAAATGGTTGCGACTGGCAGCAAGGAGGAGT  >  W3110S.gb/572241‑572305                                                                 | cacTGCTCTGATATACCGCCAGCTTGGTTGATAAAAAATGGTTGCGACTGGCAGCAAGGAGGAGt  >  1:2368006/1‑65 (MQ=255) cacTGCTCGGATATACCGCCAGCTTGGTTGATAAAAAATGGTTGCGACTGGCAGCAAGGAGGAGt  >  1:637503/1‑65 (MQ=255) cacTGCTCGGATATACCGCCAGCTTGGTTGATAAAAAATGGTTGCGACTGGCAGCAAGGAGGAGt  >  1:2441518/1‑65 (MQ=255) cacTGCTCGGATATACCGCCAGCTTGGTTGATAAAAAATGGTTGCGACTGGCAGCAAGGAGGAGt  >  1:2462955/1‑65 (MQ=255) cacTGCTCGGATATACCGCCAGCTTGGTTGATAAAAAATGGTTGCGACTGGCAGCAAGGAGGAGt  >  1:2466441/1‑65 (MQ=255) cacTGCTCGGATATACCGCCAGCTTGGTTGATAAAAAATGGTTGCGACTGGCAGCAAGGAGGAGt  >  1:2470840/1‑65 (MQ=255) cacTGCTCGGATATACCGCCAGCTTGGTTGATAAAAAATGGTTGCGACTGGCAGCAAGGAGGAGt  >  1:2511511/1‑65 (MQ=255) cacTGCTCGGATATACCGCCAGCTTGGTTGATAAAAAATGGTTGCGACTGGCAGCAAGGAGGAGt  >  1:2516960/1‑65 (MQ=255) cacTGCTCGGATATACCGCCAGCTTGGTTGATAAAAAATGGTTGCGACTGGCAGCAAGGAGGAGt  >  1:311452/1‑65 (MQ=255) cacTGCTCGGATATACCGCCAGCTTGGTTGATAAAAAATGGTTGCGACTGGCAGCAAGGAGGAGt  >  1:339971/1‑65 (MQ=255) cacTGCTCGGATATACCGCCAGCTTGGTTGATAAAAAATGGTTGCGACTGGCAGCAAGGAGGAGt  >  1:429068/1‑65 (MQ=255) cacTGCTCGGATATACCGCCAGCTTGGTTGATAAAAAATGGTTGCGACTGGCAGCAAGGAGGAGt  >  1:510771/1‑65 (MQ=255) cacTGCTCGGATATACCGCCAGCTTGGTTGATAAAAAATGGTTGCGACTGGCAGCAAGGAGGAGt  >  1:946356/1‑65 (MQ=255) cacTGCTCGGATATACCGCCAGCTTGGTTGATAAAAAATGGTTGCGACTGGCAGCAAGGAGGAGt  >  1:63862/1‑65 (MQ=255) cacTGCTCGGATATACCGCCAGCTTGGTTGATAAAAAATGGTTGCGACTGGCAGCAAGGAGGAGt  >  1:661848/1‑65 (MQ=255) cacTGCTCGGATATACCGCCAGCTTGGTTGATAAAAAATGGTTGCGACTGGCAGCAAGGAGGAGt  >  1:66779/1‑65 (MQ=255) cacTGCTCGGATATACCGCCAGCTTGGTTGATAAAAAATGGTTGCGACTGGCAGCAAGGAGGAGt  >  1:669705/1‑65 (MQ=255) cacTGCTCGGATATACCGCCAGCTTGGTTGATAAAAAATGGTTGCGACTGGCAGCAAGGAGGAGt  >  1:706251/1‑65 (MQ=255) cacTGCTCGGATATACCGCCAGCTTGGTTGATAAAAAATGGTTGCGACTGGCAGCAAGGAGGAGt  >  1:70750/1‑65 (MQ=255) cacTGCTCGGATATACCGCCAGCTTGGTTGATAAAAAATGGTTGCGACTGGCAGCAAGGAGGAGt  >  1:724732/1‑65 (MQ=255) cacTGCTCGGATATACCGCCAGCTTGGTTGATAAAAAATGGTTGCGACTGGCAGCAAGGAGGAGt  >  1:765782/1‑65 (MQ=255) cacTGCTCGGATATACCGCCAGCTTGGTTGATAAAAAATGGTTGCGACTGGCAGCAAGGAGGAGt  >  1:839350/1‑65 (MQ=255) cacTGCTCGGATATACCGCCAGCTTGGTTGATAAAAAATGGTTGCGACTGGCAGCAAGGAGGAGt  >  1:844757/1‑65 (MQ=255) cacTGCTCGGATATACCGCCAGCTTGGTTGATAAAAAATGGTTGCGACTGGCAGCAAGGAGGAGt  >  1:1009775/1‑65 (MQ=255) cacTGCTCGGATATACCGCCAGCTTGGTTGATAAAAAATGGTTGCGACTGGCAGCAAGGAGGAGt  >  1:164575/1‑65 (MQ=255) cacTGCTCGGATATACCGCCAGCTTGGTTGATAAAAAATGGTTGCGACTGGCAGCAAGGAGGAGt  >  1:1085224/1‑65 (MQ=255) cacTGCTCGGATATACCGCCAGCTTGGTTGATAAAAAATGGTTGCGACTGGCAGCAAGGAGGAGt  >  1:1135708/1‑65 (MQ=255) cacTGCTCGGATATACCGCCAGCTTGGTTGATAAAAAATGGTTGCGACTGGCAGCAAGGAGGAGt  >  1:1137255/1‑65 (MQ=255) cacTGCTCGGATATACCGCCAGCTTGGTTGATAAAAAATGGTTGCGACTGGCAGCAAGGAGGAGt  >  1:1208987/1‑65 (MQ=255) cacTGCTCGGATATACCGCCAGCTTGGTTGATAAAAAATGGTTGCGACTGGCAGCAAGGAGGAGt  >  1:1306693/1‑65 (MQ=255) cacTGCTCGGATATACCGCCAGCTTGGTTGATAAAAAATGGTTGCGACTGGCAGCAAGGAGGAGt  >  1:1434981/1‑65 (MQ=255) cacTGCTCGGATATACCGCCAGCTTGGTTGATAAAAAATGGTTGCGACTGGCAGCAAGGAGGAGt  >  1:144683/1‑65 (MQ=255) cacTGCTCGGATATACCGCCAGCTTGGTTGATAAAAAATGGTTGCGACTGGCAGCAAGGAGGAGt  >  1:1512583/1‑65 (MQ=255) cacTGCTCGGATATACCGCCAGCTTGGTTGATAAAAAATGGTTGCGACTGGCAGCAAGGAGGAGt  >  1:1572176/1‑65 (MQ=255) cacTGCTCGGATATACCGCCAGCTTGGTTGATAAAAAATGGTTGCGACTGGCAGCAAGGAGGAGt  >  1:1594146/1‑65 (MQ=255) cacTGCTCGGATATACCGCCAGCTTGGTTGATAAAAAATGGTTGCGACTGGCAGCAAGGAGGAGt  >  1:1635447/1‑65 (MQ=255) cacTGCTCGGATATACCGCCAGCTTGGTTGATAAAAAATGGTTGCGACTGGCAGCAAGGAGGAGt  >  1:2416533/1‑65 (MQ=255) cacTGCTCGGATATACCGCCAGCTTGGTTGATAAAAAATGGTTGCGACTGGCAGCAAGGAGGAGt  >  1:1662511/1‑65 (MQ=255) cacTGCTCGGATATACCGCCAGCTTGGTTGATAAAAAATGGTTGCGACTGGCAGCAAGGAGGAGt  >  1:1835935/1‑65 (MQ=255) cacTGCTCGGATATACCGCCAGCTTGGTTGATAAAAAATGGTTGCGACTGGCAGCAAGGAGGAGt  >  1:2020791/1‑65 (MQ=255) cacTGCTCGGATATACCGCCAGCTTGGTTGATAAAAAATGGTTGCGACTGGCAGCAAGGAGGAGt  >  1:2046222/1‑65 (MQ=255) cacTGCTCGGATATACCGCCAGCTTGGTTGATAAAAAATGGTTGCGACTGGCAGCAAGGAGGAGt  >  1:2049338/1‑65 (MQ=255) cacTGCTCGGATATACCGCCAGCTTGGTTGATAAAAAATGGTTGCGACTGGCAGCAAGGAGGAGt  >  1:217261/1‑65 (MQ=255) cacTGCTCGGATATACCGCCAGCTTGGTTGATAAAAAATGGTTGCGACTGGCAGCAAGGAGGAGt  >  1:2191888/1‑65 (MQ=255) cacTGCTCGGATATACCGCCAGCTTGGTTGATAAAAAATGGTTGCGACTGGCAGCAAGGAGGAGt  >  1:219675/1‑65 (MQ=255) cacTGCTCGGATATACCGCCAGCTTGGTTGATAAAAAATGGTTGCGACTGGCAGCAAGGAGGAGt  >  1:2250460/1‑65 (MQ=255) cacTGCTCGGATATACCGCCAGCTTGGTTGATAAAAAATGGTTGCGACTGGCAGCAAGGAGGAGt  >  1:2301230/1‑65 (MQ=255)                                                                 | CACTGCTCGGATATACCGCCAGCTTGGTTGATAAAAAATGGTTGCGACTGGCAGCAAGGAGGAGT  >  W3110S.gb/572241‑572305

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑