Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1057491	1057514	24	72 [0]	[0] 22	torT	periplasmic sensory protein associated with the TorRS two‑component regulatory system

CGCCGCTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAAGAG  >  W3110S.gb/1057425‑1057490                                                                  | cgccgcTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACAT‑AGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:937972/65‑1 (MQ=255)  gccgcTTACCTTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:955495/65‑1 (MQ=255)  gccgcTTACCTTGGAGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:550532/65‑1 (MQ=255)  gccgcTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:2488045/65‑1 (MQ=255)  gccgcTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:419154/65‑1 (MQ=255)  gccgcTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:363428/65‑1 (MQ=255)  gccgcTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:349987/65‑1 (MQ=255)  gccgcTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:347174/65‑1 (MQ=255)  gccgcTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:29055/65‑1 (MQ=255)  gccgcTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:256430/65‑1 (MQ=255)  gccgcTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:2515116/65‑1 (MQ=255)  gccgcTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:2505505/65‑1 (MQ=255)  gccgcTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:498528/65‑1 (MQ=255)  gccgcTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:2452705/65‑1 (MQ=255)  gccgcTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:2411580/65‑1 (MQ=255)  gccgcTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:2386169/65‑1 (MQ=255)  gccgcTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:238439/65‑1 (MQ=255)  gccgcTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:2374319/65‑1 (MQ=255)  gccgcTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:1079380/65‑1 (MQ=255)  gccgcTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:46396/65‑1 (MQ=255)  gccgcTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:483138/65‑1 (MQ=255)  gccgcTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:236431/65‑1 (MQ=255)  gccgcTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:515/65‑1 (MQ=255)  gccgcTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:556068/65‑1 (MQ=255)  gccgcTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:57381/65‑1 (MQ=255)  gccgcTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:706708/65‑1 (MQ=255)  gccgcTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:746232/65‑1 (MQ=255)  gccgcTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:766915/65‑1 (MQ=255)  gccgcTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:777594/65‑1 (MQ=255)  gccgcTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:789493/65‑1 (MQ=255)  gccgcTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:817701/65‑1 (MQ=255)  gccgcTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:824353/65‑1 (MQ=255)  gccgcTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:914456/65‑1 (MQ=255)  gccgcTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:938584/65‑1 (MQ=255)  gccgcTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:963749/65‑1 (MQ=255)  gccgcTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:1278841/65‑1 (MQ=255)  gccgcTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:1488651/65‑1 (MQ=255)  gccgcTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:138431/65‑1 (MQ=255)  gccgcTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:1358198/65‑1 (MQ=255)  gccgcTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:134241/65‑1 (MQ=255)  gccgcTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:1337800/65‑1 (MQ=255)  gccgcTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:1322626/65‑1 (MQ=255)  gccgcTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:131313/65‑1 (MQ=255)  gccgcTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:1289179/65‑1 (MQ=255)  gccgcTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:128396/65‑1 (MQ=255)  gccgcTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:2272134/65‑1 (MQ=255)  gccgcTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:1268187/65‑1 (MQ=255)  gccgcTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:1248252/65‑1 (MQ=255)  gccgcTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:1214606/65‑1 (MQ=255)  gccgcTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:1184278/65‑1 (MQ=255)  gccgcTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:1182993/65‑1 (MQ=255)  gccgcTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:1182149/65‑1 (MQ=255)  gccgcTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:1181410/65‑1 (MQ=255)  gccgcTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:1166854/65‑1 (MQ=255)  gccgcTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:2027578/65‑1 (MQ=255)  gccgcTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:2344121/65‑1 (MQ=255)  gccgcTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:2271656/65‑1 (MQ=255)  gccgcTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:2183711/65‑1 (MQ=255)  gccgcTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:2131591/65‑1 (MQ=255)  gccgcTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:2106672/65‑1 (MQ=255)  gccgcTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:202256/65‑1 (MQ=255)  gccgcTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:1945274/65‑1 (MQ=255)  gccgcTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:1886181/65‑1 (MQ=255)  gccgcTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:1871484/65‑1 (MQ=255)  gccgcTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:1717034/65‑1 (MQ=255)   ccgcTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:150687/64‑1 (MQ=255)    cgcTTACCGTGGTGGCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:1676869/63‑1 (MQ=255)              ggtgTCGTTTTATCTTTCACATCAGGGGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:260204/53‑1 (MQ=255)                  tCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:2129011/49‑1 (MQ=255)                      tttATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:2198780/45‑1 (MQ=255)                       ttATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:241484/44‑1 (MQ=255)                          tCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAagag  <  1:1764898/41‑1 (MQ=255)                                                                  | CGCCGCTTACCGTGGTGTCGTTTTATCTTTCACATCAGGTGTATCGCGGGCTGAAGCGGGGAAGAG  >  W3110S.gb/1057425‑1057490

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑