Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1067555	1067590	36	30 [0]	[3] 19	wrbA	predicted flavoprotein in Trp regulation

AGCTTTCGCTTCTTGAGTTGGCATGCGTATCCTCCTGTTGAAGATTAGCCGTTAAGTTTAACTGC  >  W3110S.gb/1067490‑1067554                                                                 | aGCTTTCGCTTCTTGAGTTGGCATGCGTATCCTCCTGTTGAAGATTAGCCGTTAAGTTTAACTGc  <  1:234299/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCGCTTCTTGAGTTGGCATGCGTATCCTCCTGTTGAAGATTAGCCGTTAAGTTTAACTGc  <  1:96832/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCGCTTCTTGAGTTGGCATGCGTATCCTCCTGTTGAAGATTAGCCGTTAAGTTTAACTGc  <  1:85787/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCGCTTCTTGAGTTGGCATGCGTATCCTCCTGTTGAAGATTAGCCGTTAAGTTTAACTGc  <  1:726766/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCGCTTCTTGAGTTGGCATGCGTATCCTCCTGTTGAAGATTAGCCGTTAAGTTTAACTGc  <  1:724701/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCGCTTCTTGAGTTGGCATGCGTATCCTCCTGTTGAAGATTAGCCGTTAAGTTTAACTGc  <  1:707301/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCGCTTCTTGAGTTGGCATGCGTATCCTCCTGTTGAAGATTAGCCGTTAAGTTTAACTGc  <  1:658530/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCGCTTCTTGAGTTGGCATGCGTATCCTCCTGTTGAAGATTAGCCGTTAAGTTTAACTGc  <  1:605028/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCGCTTCTTGAGTTGGCATGCGTATCCTCCTGTTGAAGATTAGCCGTTAAGTTTAACTGc  <  1:540377/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCGCTTCTTGAGTTGGCATGCGTATCCTCCTGTTGAAGATTAGCCGTTAAGTTTAACTGc  <  1:2491640/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCGCTTCTTGAGTTGGCATGCGTATCCTCCTGTTGAAGATTAGCCGTTAAGTTTAACTGc  <  1:24151/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCGCTTCTTGAGTTGGCATGCGTATCCTCCTGTTGAAGATTAGCCGTTAAGTTTAACTGc  <  1:1232878/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCGCTTCTTGAGTTGGCATGCGTATCCTCCTGTTGAAGATTAGCCGTTAAGTTTAACTGc  <  1:2119070/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCGCTTCTTGAGTTGGCATGCGTATCCTCCTGTTGAAGATTAGCCGTTAAGTTTAACTGc  <  1:2017933/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCGCTTCTTGAGTTGGCATGCGTATCCTCCTGTTGAAGATTAGCCGTTAAGTTTAACTGc  <  1:1973497/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCGCTTCTTGAGTTGGCATGCGTATCCTCCTGTTGAAGATTAGCCGTTAAGTTTAACTGc  <  1:1857818/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCGCTTCTTGAGTTGGCATGCGTATCCTCCTGTTGAAGATTAGCCGTTAAGTTTAACTGc  <  1:1750204/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCGCTTCTTGAGTTGGCATGCGTATCCTCCTGTTGAAGATTAGCCGTTAAGTTTAACTGc  <  1:1349012/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCGCTTCTTGAGTTGGCATGCGTATCCTCCTGTTGAAGATTAGCCGTTAAGTTTAACTGc  <  1:1729486/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCGCTTCTTGAGTTGGCATGCGTATCCTCCTGTTGAAGATTAGCCGTTAAGTTTAACTGc  <  1:1534591/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCGCTTCTTGAGTTGGCATGCGTATCCTCCTGTTGAAGATTAGCCGTTAAGTTTAACTGc  <  1:1447042/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCGCTTCTTGAGTTGGCATGCGTATCCTCCTGTTGAAGATTAGCCGTTAAGTTTAACTGc  <  1:1435110/65‑1 (MQ=255) aGCTTTCGCTTCTTGAGTTGGCATACGTATCCTCCTGTTGAAGATTAGCCGTTAAGTTTAACTGc  <  1:1919185/65‑1 (MQ=255)  gCTTTCGCTTCTTGAGTTGGCATGCGTATCCTCCTGTTGAAGATTAGCCGTTAAGTTTAACTGc  <  1:647053/64‑1 (MQ=255)  gCTTTCGCTTCTTGAGTTGGCATGCGTATCCTCCTGTTGAAGATTAGCCGTTAAGTTTAACTGc  <  1:125890/64‑1 (MQ=255)  gCTTTCGCTTCTTGAGTTGGCATGCGTATCCTCCTGTTGAAGATTAGCCGTTAAGTTTAACTGc  <  1:891855/64‑1 (MQ=255)  gCTTTCGCTTCTTGAGTTGGCATGCGTATCCTCCTGTTGAAGATTAGCCGTTAAGTTTAACTGc  <  1:735882/64‑1 (MQ=255)  gCTTTCGCTTCTTGAGTTGGCATGCGTATCCTCCTGTTGAAGATTAGCCGTTAAGTTTAACTGc  <  1:2111790/64‑1 (MQ=255)  gCTTTCGCTTCTTGAGTTGGCATGCGTATCCTCCTGTTGAAGATTAGCCGTTAAGTTTAACTGc  <  1:2351767/64‑1 (MQ=255)  gCTTTCGCTTCTTGAGTTGGCATGCGTATCCTCCTGTTGAAGATTAGCCGTTAAGTTTAACTGc  <  1:208338/64‑1 (MQ=255)                                                                 | AGCTTTCGCTTCTTGAGTTGGCATGCGTATCCTCCTGTTGAAGATTAGCCGTTAAGTTTAACTGC  >  W3110S.gb/1067490‑1067554

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑