Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1127391	1127415	25	23 [0]	[0] 24	rimJ	ribosomal‑protein‑S5‑alanine N‑acetyltransferase

TGGGGATGATTAACGAATTTCATAAACAAGGTTCAGCTTTCTACTTTGGCTTATTCGACCCGGAC  >  W3110S.gb/1127326‑1127390                                                                 | tGGGGATGATTAACGAATTTCATAAACAAGGTTCAGCTTTCTACTTTGGCTTATTCGACCCGGAc  <  1:2204242/65‑1 (MQ=255) tGGGGATGATTAACGAATTTCATAAACAAGGTTCAGCTTTCTACTTTGGCTTATTCGACCCGGAc  <  1:87844/65‑1 (MQ=255) tGGGGATGATTAACGAATTTCATAAACAAGGTTCAGCTTTCTACTTTGGCTTATTCGACCCGGAc  <  1:847500/65‑1 (MQ=255) tGGGGATGATTAACGAATTTCATAAACAAGGTTCAGCTTTCTACTTTGGCTTATTCGACCCGGAc  <  1:836479/65‑1 (MQ=255) tGGGGATGATTAACGAATTTCATAAACAAGGTTCAGCTTTCTACTTTGGCTTATTCGACCCGGAc  <  1:832326/65‑1 (MQ=255) tGGGGATGATTAACGAATTTCATAAACAAGGTTCAGCTTTCTACTTTGGCTTATTCGACCCGGAc  <  1:722592/65‑1 (MQ=255) tGGGGATGATTAACGAATTTCATAAACAAGGTTCAGCTTTCTACTTTGGCTTATTCGACCCGGAc  <  1:680961/65‑1 (MQ=255) tGGGGATGATTAACGAATTTCATAAACAAGGTTCAGCTTTCTACTTTGGCTTATTCGACCCGGAc  <  1:405778/65‑1 (MQ=255) tGGGGATGATTAACGAATTTCATAAACAAGGTTCAGCTTTCTACTTTGGCTTATTCGACCCGGAc  <  1:2522206/65‑1 (MQ=255) tGGGGATGATTAACGAATTTCATAAACAAGGTTCAGCTTTCTACTTTGGCTTATTCGACCCGGAc  <  1:2412097/65‑1 (MQ=255) tGGGGATGATTAACGAATTTCATAAACAAGGTTCAGCTTTCTACTTTGGCTTATTCGACCCGGAc  <  1:2275142/65‑1 (MQ=255) tGGGGATGATTAACGAATTTCATAAACAAGGTTCAGCTTTCTACTTTGGCTTATTCGACCCGGAc  <  1:225087/65‑1 (MQ=255) tGGGGATGATTAACGAATTTCATAAACAAGGTTCAGCTTTCTACTTTGGCTTATTCGACCCGGAc  <  1:2133233/65‑1 (MQ=255) tGGGGATGATTAACGAATTTCATAAACAAGGTTCAGCTTTCTACTTTGGCTTATTCGACCCGGAc  <  1:2067835/65‑1 (MQ=255) tGGGGATGATTAACGAATTTCATAAACAAGGTTCAGCTTTCTACTTTGGCTTATTCGACCCGGAc  <  1:1987940/65‑1 (MQ=255) tGGGGATGATTAACGAATTTCATAAACAAGGTTCAGCTTTCTACTTTGGCTTATTCGACCCGGAc  <  1:1983515/65‑1 (MQ=255) tGGGGATGATTAACGAATTTCATAAACAAGGTTCAGCTTTCTACTTTGGCTTATTCGACCCGGAc  <  1:1831217/65‑1 (MQ=255) tGGGGATGATTAACGAATTTCATAAACAAGGTTCAGCTTTCTACTTTGGCTTATTCGACCCGGAc  <  1:1591179/65‑1 (MQ=255) tGGGGATGATTAACGAATTTCATAAACAAGGTTCAGCTTTCTACTTTGGCTTATTCGACCCGGAc  <  1:1105525/65‑1 (MQ=255) tGGGGATGATAAACGAATTTCATAAACAAGGTTCAGCTTTCTACTTTGGCTTATTCGACCCGGAc  <  1:1048118/65‑1 (MQ=255)  ggggATGATTAACGAATTTCATAAACAAGGTTCAGCTTTCTACTTTGGCTTATTCGACCCGGAc  <  1:1862527/64‑1 (MQ=255)    ggATGATTAACGAATTTCATAAACAAGGTTCAGCTTTCTACTTTGGCTTATTCGACCCGGAc  <  1:1576869/62‑1 (MQ=255)                      aTAAACAAGGTTCAGCTTTCTACTTTGGCTTATTCGACCCGGAc  <  1:1890036/44‑1 (MQ=255)                                                                 | TGGGGATGATTAACGAATTTCATAAACAAGGTTCAGCTTTCTACTTTGGCTTATTCGACCCGGAC  >  W3110S.gb/1127326‑1127390

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑