Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1138080	1138089	10	23 [0]	[0] 10	flgI	predicted flagellar basal body protein

GCCGTTTACCACACAAACGCTTAATAACATGCTCTCACAGCTGGGAATTACCGTTCCGACGGGCA  >  W3110S.gb/1138015‑1138079                                                                 | gCCGTTTACCACACAAACGCTTAATAACATGCTCTCACAGCTGGGAATTACCGTTCCGACGGGCa  <  1:1047506/65‑1 (MQ=255) gCCGTTTACCACACAAACGCTTAATAACATGCTCTCACAGCTGGGAATTACCGTTCCGACGGGCa  <  1:769023/65‑1 (MQ=255) gCCGTTTACCACACAAACGCTTAATAACATGCTCTCACAGCTGGGAATTACCGTTCCGACGGGCa  <  1:727839/65‑1 (MQ=255) gCCGTTTACCACACAAACGCTTAATAACATGCTCTCACAGCTGGGAATTACCGTTCCGACGGGCa  <  1:686876/65‑1 (MQ=255) gCCGTTTACCACACAAACGCTTAATAACATGCTCTCACAGCTGGGAATTACCGTTCCGACGGGCa  <  1:527575/65‑1 (MQ=255) gCCGTTTACCACACAAACGCTTAATAACATGCTCTCACAGCTGGGAATTACCGTTCCGACGGGCa  <  1:507541/65‑1 (MQ=255) gCCGTTTACCACACAAACGCTTAATAACATGCTCTCACAGCTGGGAATTACCGTTCCGACGGGCa  <  1:500161/65‑1 (MQ=255) gCCGTTTACCACACAAACGCTTAATAACATGCTCTCACAGCTGGGAATTACCGTTCCGACGGGCa  <  1:448075/65‑1 (MQ=255) gCCGTTTACCACACAAACGCTTAATAACATGCTCTCACAGCTGGGAATTACCGTTCCGACGGGCa  <  1:2542901/65‑1 (MQ=255) gCCGTTTACCACACAAACGCTTAATAACATGCTCTCACAGCTGGGAATTACCGTTCCGACGGGCa  <  1:2508429/65‑1 (MQ=255) gCCGTTTACCACACAAACGCTTAATAACATGCTCTCACAGCTGGGAATTACCGTTCCGACGGGCa  <  1:2115768/65‑1 (MQ=255) gCCGTTTACCACACAAACGCTTAATAACATGCTCTCACAGCTGGGAATTACCGTTCCGACGGGCa  <  1:2100036/65‑1 (MQ=255) gCCGTTTACCACACAAACGCTTAATAACATGCTCTCACAGCTGGGAATTACCGTTCCGACGGGCa  <  1:199121/65‑1 (MQ=255) gCCGTTTACCACACAAACGCTTAATAACATGCTCTCACAGCTGGGAATTACCGTTCCGACGGGCa  <  1:1806752/65‑1 (MQ=255) gCCGTTTACCACACAAACGCTTAATAACATGCTCTCACAGCTGGGAATTACCGTTCCGACGGGCa  <  1:1698643/65‑1 (MQ=255) gCCGTTTACCACACAAACGCTTAATAACATGCTCTCACAGCTGGGAATTACCGTTCCGACGGGCa  <  1:1587350/65‑1 (MQ=255) gCCGTTTACCACACAAACGCTTAATAACATGCTCTCACAGCTGGGAATTACCGTTCCGACGGGCa  <  1:1125366/65‑1 (MQ=255) gCCGTTTACCACACAAACGCTTAATAACATGCTCTCACAGCTGGGAATTACCGTTCCGACGGGCa  <  1:109590/65‑1 (MQ=255)  ccGTTTACCACACAAACGCTTAATAACATGCTCTCACAGCTGGGAATTACCGTTCCGCCGGGCa  <  1:1007078/64‑1 (MQ=255)  ccGTTTACCACACAAACGCTTAATAACATGCTCTCACAGCTGGGAATTACCGTTCCGACGGGCa  <  1:2300171/64‑1 (MQ=255)  ccGTTTACCACACAAACGCTTAATAACATGCTCTCACAGCTGGGAATTACCGTTCCGACGGGCa  <  1:2022286/64‑1 (MQ=255)  ccGTTTACCACACAAACGCTTAATAACATGCTCTCACAGCTGGGAATTACCGTTCCGACGGGCa  <  1:896728/64‑1 (MQ=255)                aaCGCTTAATAACATGCTCTCACAGCTGGGAATTACCGTTCCGACGGGCa  <  1:1677278/50‑1 (MQ=255)                                                                 | GCCGTTTACCACACAAACGCTTAATAACATGCTCTCACAGCTGGGAATTACCGTTCCGACGGGCA  >  W3110S.gb/1138015‑1138079

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑