Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1172816	1172826	11	9 [0]	[0] 8	mfd	transcription‑repair coupling factor

AGACGTTTTTGTGCATCGGTAGTCATCGCTTTTGGATGCGGTGTCAGCAACCATGCATATGCC  >  W3110S.gb/1172753‑1172815                                                               | aGACGTTTTTGTGCATCGGTAGTCATCGCTTTTGGATGCGGTGTCAGCAACCATGCATATGcc  <  1:125452/63‑1 (MQ=255) aGACGTTTTTGTGCATCGGTAGTCATCGCTTTTGGATGCGGTGTCAGCAACCATGCATATGcc  <  1:1371210/63‑1 (MQ=255) aGACGTTTTTGTGCATCGGTAGTCATCGCTTTTGGATGCGGTGTCAGCAACCATGCATATGcc  <  1:1627449/63‑1 (MQ=255) aGACGTTTTTGTGCATCGGTAGTCATCGCTTTTGGATGCGGTGTCAGCAACCATGCATATGcc  <  1:2480798/63‑1 (MQ=255) aGACGTTTTTGTGCATCGGTAGTCATCGCTTTTGGATGCGGTGTCAGCAACCATGCATATGcc  <  1:2533533/63‑1 (MQ=255) aGACGTTTTTGTGCATCGGTAGTCATCGCTTTTGGATGCGGTGTCAGCAACCATGCATATGcc  <  1:566328/63‑1 (MQ=255) aGACGTTTTTGTGCATCGGTAGTCATCGCTTTTGGATGCGGTGTCAGCAACCATGCATATGcc  <  1:677856/63‑1 (MQ=255) aGACGTTTTTGTGCATCGGTAGTCATCGCTTTTGGATGCGGTGTCAGCAACCATGCATATGcc  <  1:934822/63‑1 (MQ=255) aGACGTTTTTGTGCATCGGTAGTCATCGCTTTTGGATGCGGTGTCAGCAACCATGCATATGcc  <  1:943698/63‑1 (MQ=255)                                                               | AGACGTTTTTGTGCATCGGTAGTCATCGCTTTTGGATGCGGTGTCAGCAACCATGCATATGCC  >  W3110S.gb/1172753‑1172815

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑