Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	1208755	1208756	2	39 [0]	[0] 33	ymfQ	conserved hypothetical protein

TCTGCCGGATGAATGTATTCCGGCGGGAACGCAGACCCTTCGCCAGCGTCAGCAACGGCTGGATG  >  W3110S.gb/1208690‑1208754                                                                 | tCTGCCGGCTGAATGTATTCCGGCGGGAACGCAGACCCTTCGCCAGCGTCAGCAACGGCTGGATg  <  1:1380282/65‑1 (MQ=255) tCTGCCGGATGAATGTATTCCGGCGGGAACGCAGACCCTTCGCCAGCGTCAGCAACGGCTGGATg  <  1:469548/65‑1 (MQ=255) tCTGCCGGATGAATGTATTCCGGCGGGAACGCAGACCCTTCGCCAGCGTCAGCAACGGCTGGATg  <  1:1041683/65‑1 (MQ=255) tCTGCCGGATGAATGTATTCCGGCGGGAACGCAGACCCTTCGCCAGCGTCAGCAACGGCTGGATg  <  1:2376163/65‑1 (MQ=255) tCTGCCGGATGAATGTATTCCGGCGGGAACGCAGACCCTTCGCCAGCGTCAGCAACGGCTGGATg  <  1:2390410/65‑1 (MQ=255) tCTGCCGGATGAATGTATTCCGGCGGGAACGCAGACCCTTCGCCAGCGTCAGCAACGGCTGGATg  <  1:2410303/65‑1 (MQ=255) tCTGCCGGATGAATGTATTCCGGCGGGAACGCAGACCCTTCGCCAGCGTCAGCAACGGCTGGATg  <  1:2422495/65‑1 (MQ=255) tCTGCCGGATGAATGTATTCCGGCGGGAACGCAGACCCTTCGCCAGCGTCAGCAACGGCTGGATg  <  1:2482703/65‑1 (MQ=255) tCTGCCGGATGAATGTATTCCGGCGGGAACGCAGACCCTTCGCCAGCGTCAGCAACGGCTGGATg  <  1:269581/65‑1 (MQ=255) tCTGCCGGATGAATGTATTCCGGCGGGAACGCAGACCCTTCGCCAGCGTCAGCAACGGCTGGATg  <  1:319473/65‑1 (MQ=255) tCTGCCGGATGAATGTATTCCGGCGGGAACGCAGACCCTTCGCCAGCGTCAGCAACGGCTGGATg  <  1:359559/65‑1 (MQ=255) tCTGCCGGATGAATGTATTCCGGCGGGAACGCAGACCCTTCGCCAGCGTCAGCAACGGCTGGATg  <  1:2365505/65‑1 (MQ=255) tCTGCCGGATGAATGTATTCCGGCGGGAACGCAGACCCTTCGCCAGCGTCAGCAACGGCTGGATg  <  1:491117/65‑1 (MQ=255) tCTGCCGGATGAATGTATTCCGGCGGGAACGCAGACCCTTCGCCAGCGTCAGCAACGGCTGGATg  <  1:528059/65‑1 (MQ=255) tCTGCCGGATGAATGTATTCCGGCGGGAACGCAGACCCTTCGCCAGCGTCAGCAACGGCTGGATg  <  1:621694/65‑1 (MQ=255) tCTGCCGGATGAATGTATTCCGGCGGGAACGCAGACCCTTCGCCAGCGTCAGCAACGGCTGGATg  <  1:736407/65‑1 (MQ=255) tCTGCCGGATGAATGTATTCCGGCGGGAACGCAGACCCTTCGCCAGCGTCAGCAACGGCTGGATg  <  1:812886/65‑1 (MQ=255) tCTGCCGGATGAATGTATTCCGGCGGGAACGCAGACCCTTCGCCAGCGTCAGCAACGGCTGGATg  <  1:880269/65‑1 (MQ=255) tCTGCCGGATGAATGTATTCCGGCGGGAACGCAGACCCTTCGCCAGCGTCAGCAACGGCTGGATg  <  1:94835/65‑1 (MQ=255) tCTGCCGGATGAATGTATTCCGGCGGGAACGCAGACCCTTCGCCAGCGTCAGCAACGGCTGGATg  <  1:1648279/65‑1 (MQ=255) tCTGCCGGATGAATGTATTCCGGCGGGAACGCAGACCCTTCGCCAGCGTCAGCAACGGCTGGATg  <  1:1075140/65‑1 (MQ=255) tCTGCCGGATGAATGTATTCCGGCGGGAACGCAGACCCTTCGCCAGCGTCAGCAACGGCTGGATg  <  1:1295903/65‑1 (MQ=255) tCTGCCGGATGAATGTATTCCGGCGGGAACGCAGACCCTTCGCCAGCGTCAGCAACGGCTGGATg  <  1:1371729/65‑1 (MQ=255) tCTGCCGGATGAATGTATTCCGGCGGGAACGCAGACCCTTCGCCAGCGTCAGCAACGGCTGGATg  <  1:1393439/65‑1 (MQ=255) tCTGCCGGATGAATGTATTCCGGCGGGAACGCAGACCCTTCGCCAGCGTCAGCAACGGCTGGATg  <  1:139479/65‑1 (MQ=255) tCTGCCGGATGAATGTATTCCGGCGGGAACGCAGACCCTTCGCCAGCGTCAGCAACGGCTGGATg  <  1:1645321/65‑1 (MQ=255) tCTGCCGGATGAATGTATTCCGGCGGGAACGCAGACCCTTCGCCAGCGTCAGCAACGGCTGGATg  <  1:2340327/65‑1 (MQ=255) tCTGCCGGATGAATGTATTCCGGCGGGAACGCAGACCCTTCGCCAGCGTCAGCAACGGCTGGATg  <  1:165935/65‑1 (MQ=255) tCTGCCGGATGAATGTATTCCGGCGGGAACGCAGACCCTTCGCCAGCGTCAGCAACGGCTGGATg  <  1:1679137/65‑1 (MQ=255) tCTGCCGGATGAATGTATTCCGGCGGGAACGCAGACCCTTCGCCAGCGTCAGCAACGGCTGGATg  <  1:1794580/65‑1 (MQ=255) tCTGCCGGATGAATGTATTCCGGCGGGAACGCAGACCCTTCGCCAGCGTCAGCAACGGCTGGATg  <  1:2124501/65‑1 (MQ=255)  cTGCCGGATGAATGTATTCCGGCGGGAACGCAGACCCTTCGCCAGCGTCAGCAACGGCTGGATg  <  1:340168/64‑1 (MQ=255)  cTGCCGGATGAATGTATTCCGGCGGGAACGCAGACCCTTCGCCAGCGTCAGCAACGGCTGGATg  <  1:2496862/64‑1 (MQ=255)  cTGCCGGATGAATGTATTCCGGCGGGAACGCAGACCCTTCGCCAGCGTCAGCAACGGCTGGATg  <  1:1618812/64‑1 (MQ=255)  cTGCCGGATGAATGTATTCCGGCGGGAACGCAGACCCTTCGCCAGCGTCAGCAACGGCTGGATg  <  1:1571941/64‑1 (MQ=255)  cTGCCGGATGAATGTATTCCGGCGGGAACGCAGACCCTTCGCCAGCGTCAGCAACGGCTGGATg  <  1:896964/64‑1 (MQ=255)   tGCCGGATGAATGTATTCCGGCGGGAACGCAGACCCTTCGCCAGCGTCAGCAACGGCTGGATg  <  1:1685425/63‑1 (MQ=255)          tGAATGTATTCCGGCGGGAACGCAGACCCTTCGCCAGCGTCAGCAACGGCTGGATg  <  1:1825245/56‑1 (MQ=255)                   tCCGGCGGGAACGCAGACCCTTCGCCAGCGTCAGCAACGGCTGGATg  <  1:1703781/47‑1 (MQ=255)                                                                 | TCTGCCGGATGAATGTATTCCGGCGGGAACGCAGACCCTTCGCCAGCGTCAGCAACGGCTGGATG  >  W3110S.gb/1208690‑1208754

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑