Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1210941	1210994	54	29 [0]	[0] 5	stfE	ECK1143:JW5172:b1157; e14 prophage region; predicted side tail fiber protein fragment

TCATCAAAATAGAAATTAATCGTTGCATCAGTCACAATCGTGGATCTTGACGGTAATCCATGAG  >  W3110S.gb/1210877‑1210940                                                                | tcatcaAAATAGAAATTAATCGTTGCATCAGTCACAATCGTGGATCTTGACGGTAATCCATGAg  <  1:2059812/64‑1 (MQ=255) tcatcaAAATAGAAATTAATCGTTGCATCAGTCACAATCGTGGATCTTGACGGTAATCCATGAg  <  1:960558/64‑1 (MQ=255) tcatcaAAATAGAAATTAATCGTTGCATCAGTCACAATCGTGGATCTTGACGGTAATCCATGAg  <  1:772358/64‑1 (MQ=255) tcatcaAAATAGAAATTAATCGTTGCATCAGTCACAATCGTGGATCTTGACGGTAATCCATGAg  <  1:76852/64‑1 (MQ=255) tcatcaAAATAGAAATTAATCGTTGCATCAGTCACAATCGTGGATCTTGACGGTAATCCATGAg  <  1:738101/64‑1 (MQ=255) tcatcaAAATAGAAATTAATCGTTGCATCAGTCACAATCGTGGATCTTGACGGTAATCCATGAg  <  1:600583/64‑1 (MQ=255) tcatcaAAATAGAAATTAATCGTTGCATCAGTCACAATCGTGGATCTTGACGGTAATCCATGAg  <  1:516059/64‑1 (MQ=255) tcatcaAAATAGAAATTAATCGTTGCATCAGTCACAATCGTGGATCTTGACGGTAATCCATGAg  <  1:467572/64‑1 (MQ=255) tcatcaAAATAGAAATTAATCGTTGCATCAGTCACAATCGTGGATCTTGACGGTAATCCATGAg  <  1:2526050/64‑1 (MQ=255) tcatcaAAATAGAAATTAATCGTTGCATCAGTCACAATCGTGGATCTTGACGGTAATCCATGAg  <  1:2430733/64‑1 (MQ=255) tcatcaAAATAGAAATTAATCGTTGCATCAGTCACAATCGTGGATCTTGACGGTAATCCATGAg  <  1:2413833/64‑1 (MQ=255) tcatcaAAATAGAAATTAATCGTTGCATCAGTCACAATCGTGGATCTTGACGGTAATCCATGAg  <  1:2285948/64‑1 (MQ=255) tcatcaAAATAGAAATTAATCGTTGCATCAGTCACAATCGTGGATCTTGACGGTAATCCATGAg  <  1:2165813/64‑1 (MQ=255) tcatcaAAATAGAAATTAATCGTTGCATCAGTCACAATCGTGGATCTTGACGGTAATCCATGAg  <  1:2164622/64‑1 (MQ=255) tcatcaAAATAGAAATTAATCGTTGCATCAGTCACAATCGTGGATCTTGACGGTAATCCATGAg  <  1:1076588/64‑1 (MQ=255) tcatcaAAATAGAAATTAATCGTTGCATCAGTCACAATCGTGGATCTTGACGGTAATCCATGAg  <  1:2031337/64‑1 (MQ=255) tcatcaAAATAGAAATTAATCGTTGCATCAGTCACAATCGTGGATCTTGACGGTAATCCATGAg  <  1:1956149/64‑1 (MQ=255) tcatcaAAATAGAAATTAATCGTTGCATCAGTCACAATCGTGGATCTTGACGGTAATCCATGAg  <  1:1953277/64‑1 (MQ=255) tcatcaAAATAGAAATTAATCGTTGCATCAGTCACAATCGTGGATCTTGACGGTAATCCATGAg  <  1:1905341/64‑1 (MQ=255) tcatcaAAATAGAAATTAATCGTTGCATCAGTCACAATCGTGGATCTTGACGGTAATCCATGAg  <  1:1839863/64‑1 (MQ=255) tcatcaAAATAGAAATTAATCGTTGCATCAGTCACAATCGTGGATCTTGACGGTAATCCATGAg  <  1:1651997/64‑1 (MQ=255) tcatcaAAATAGAAATTAATCGTTGCATCAGTCACAATCGTGGATCTTGACGGTAATCCATGAg  <  1:1651516/64‑1 (MQ=255) tcatcaAAATAGAAATTAATCGTTGCATCAGTCACAATCGTGGATCTTGACGGTAATCCATGAg  <  1:1641929/64‑1 (MQ=255) tcatcaAAATAGAAATTAATCGTTGCATCAGTCACAATCGTGGATCTTGACGGTAATCCATGAg  <  1:1483286/64‑1 (MQ=255) tcatcaAAATAGAAATTAATCGTTGCATCAGTCACAATCGTGGATCTTGACGGTAATCCATGAg  <  1:1457776/64‑1 (MQ=255) tcatcaAAATAGAAATTAATCGTTGCATCAGTCACAATCGTGGATCTTGACGGTAATCCATGAg  <  1:1438403/64‑1 (MQ=255) tcatcaAAATAGAAATTAATCGTTGCATCAGTCACAATCGTGGATCTTGACGGTAATCCATGAg  <  1:1253829/64‑1 (MQ=255) tcatcaAAATAGAAATTAATCGTTGCATCAGTCACAATCGTGGATCTTGACGGTAATCCATGAg  <  1:1158499/64‑1 (MQ=255)                          cATCAGTCACAATCGTGGATCTTGACGGTAATCCATGAg  <  1:827042/39‑1 (MQ=255)                                                                | TCATCAAAATAGAAATTAATCGTTGCATCAGTCACAATCGTGGATCTTGACGGTAATCCATGAG  >  W3110S.gb/1210877‑1210940

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑