Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1223187	1223286	100	30 [0]	[0] 17	ycgH ycgH	ECK1157:JW5901+JW5176:b4491; hypothetical protein ECK1157:JW5176:b1170; hypothetical protein, C‑ter fragment

GTGATGGCTGGTTATGCCCGCGACTACAACTTAACTCATTCCAGCGTGTCGGATTATCGTTCGAA  >  W3110S.gb/1223122‑1223186                                                                 | gtgtTGGCTGGTTATGCCCGCGACTACAACTTAACTCATTCCAGCGTGTCGGATTATCGTTCGaa  <  1:1458214/65‑1 (MQ=255) gTGATGGCTGGTTATGCCCGCGACTACAACTTAACTCATTCGAGCGTGTCGGATTATCGTTCGaa  <  1:1512075/65‑1 (MQ=255) gTGATGGCTGGTTATGCCCGCGACTACAACTTAACTCATTCCAGCGTGTCGGATTATCGTTCGaa  <  1:113721/65‑1 (MQ=255) gTGATGGCTGGTTATGCCCGCGACTACAACTTAACTCATTCCAGCGTGTCGGATTATCGTTCGaa  <  1:846794/65‑1 (MQ=255) gTGATGGCTGGTTATGCCCGCGACTACAACTTAACTCATTCCAGCGTGTCGGATTATCGTTCGaa  <  1:771319/65‑1 (MQ=255) gTGATGGCTGGTTATGCCCGCGACTACAACTTAACTCATTCCAGCGTGTCGGATTATCGTTCGaa  <  1:586959/65‑1 (MQ=255) gTGATGGCTGGTTATGCCCGCGACTACAACTTAACTCATTCCAGCGTGTCGGATTATCGTTCGaa  <  1:481516/65‑1 (MQ=255) gTGATGGCTGGTTATGCCCGCGACTACAACTTAACTCATTCCAGCGTGTCGGATTATCGTTCGaa  <  1:275487/65‑1 (MQ=255) gTGATGGCTGGTTATGCCCGCGACTACAACTTAACTCATTCCAGCGTGTCGGATTATCGTTCGaa  <  1:2542586/65‑1 (MQ=255) gTGATGGCTGGTTATGCCCGCGACTACAACTTAACTCATTCCAGCGTGTCGGATTATCGTTCGaa  <  1:2322925/65‑1 (MQ=255) gTGATGGCTGGTTATGCCCGCGACTACAACTTAACTCATTCCAGCGTGTCGGATTATCGTTCGaa  <  1:2317454/65‑1 (MQ=255) gTGATGGCTGGTTATGCCCGCGACTACAACTTAACTCATTCCAGCGTGTCGGATTATCGTTCGaa  <  1:2290791/65‑1 (MQ=255) gTGATGGCTGGTTATGCCCGCGACTACAACTTAACTCATTCCAGCGTGTCGGATTATCGTTCGaa  <  1:2146314/65‑1 (MQ=255) gTGATGGCTGGTTATGCCCGCGACTACAACTTAACTCATTCCAGCGTGTCGGATTATCGTTCGaa  <  1:204824/65‑1 (MQ=255) gTGATGGCTGGTTATGCCCGCGACTACAACTTAACTCATTCCAGCGTGTCGGATTATCGTTCGaa  <  1:2015189/65‑1 (MQ=255) gTGATGGCTGGTTATGCCCGCGACTACAACTTAACTCATTCCAGCGTGTCGGATTATCGTTCGaa  <  1:1963930/65‑1 (MQ=255) gTGATGGCTGGTTATGCCCGCGACTACAACTTAACTCATTCCAGCGTGTCGGATTATCGTTCGaa  <  1:1960942/65‑1 (MQ=255) gTGATGGCTGGTTATGCCCGCGACTACAACTTAACTCATTCCAGCGTGTCGGATTATCGTTCGaa  <  1:1673634/65‑1 (MQ=255) gTGATGGCTGGTTATGCCCGCGACTACAACTTAACTCATTCCAGCGTGTCGGATTATCGTTCGaa  <  1:1641740/65‑1 (MQ=255) gTGATGGCTGGTTATGCCCGCGACTACAACTTAACTCATTCCAGCGTGTCGGATTATCGTTCGaa  <  1:1611653/65‑1 (MQ=255) gTGATGGCTGGTTATGCCCGCGACTACAACTTAACTCATTCCAGCGTGTCGGATTATCGTTCGaa  <  1:1570862/65‑1 (MQ=255) gTGATGGCTGGTTATGCCCGCGACTACAACTTAACTCATTCCAGCGTGTCGGATTATCGTTCGaa  <  1:1483082/65‑1 (MQ=255) gTGATGGCTGGTTATGCCCGCGACTACAACTTAACTCATTCCAGCGTGTCGGATTATCGTTCGaa  <  1:1271588/65‑1 (MQ=255) gTGATGGCTGGTTATGCCCGCGACTACAACTTAACTCATTCCAGCGTGTCGGATTATCGTTCGaa  <  1:1214289/65‑1 (MQ=255) gTGATGGCTGGTTATGCCCGCGACTACAACTTAACTCATTCCAGCGTGTCGGATTATCGTTCGaa  <  1:1159533/65‑1 (MQ=255) gTGATGGCTGGTTATGCCCGCGACTACAACTTAACTCATTCCAGCGTGTCGGATTATCGTTCGaa  <  1:106426/65‑1 (MQ=255)  tGATGGCTGGTTATGCCCGCGACTACAACTTAACTCATTCCAGCGTGTCGGATTATCGTTCGaa  <  1:505739/64‑1 (MQ=255)  tGATGGCTGGTTATGCCCGCGACTACAACTTAACTCATTCCAGCGTGTCGGATTATCGTTCGaa  <  1:860244/64‑1 (MQ=255)          ggTTATGCCCGCGACTACAACTTAACTCATTCCAGCGTGTCGGATTATCGTTCGaa  <  1:16513/56‑1 (MQ=255)            ttATGCCCGCGACTACAACTTAACTCATTCCAGCGTGTCGGATTATCGTTCGaa  <  1:1928843/54‑1 (MQ=255)                                                                 | GTGATGGCTGGTTATGCCCGCGACTACAACTTAACTCATTCCAGCGTGTCGGATTATCGTTCGAA  >  W3110S.gb/1223122‑1223186

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑