Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1276194	1276235	42	33 [0]	[0] 17	ychP	predicted invasin

GTTGATTTGTTTAACTCTGGTACGGGTTATCACAATCCCGTCGCGTTGAGTCTGGGATTAAATTA  >  W3110S.gb/1276129‑1276193                                                                 | gtTGATTTGTTTAACTCTGGTACGGGTTATCACAATCCCGTCGCGTTGAGTCTGGGATTAAATTa  <  1:489240/65‑1 (MQ=255) gtTGATTTGTTTAACTCTGGTACGGGTTATCACAATCCCGTCGCGTTGAGTCTGGGATTAAATTa  <  1:2348650/65‑1 (MQ=255) gtTGATTTGTTTAACTCTGGTACGGGTTATCACAATCCCGTCGCGTTGAGTCTGGGATTAAATTa  <  1:2260544/65‑1 (MQ=255) gtTGATTTGTTTAACTCTGGTACGGGTTATCACAATCCCGTCGCGTTGAGTCTGGGATTAAATTa  <  1:454045/65‑1 (MQ=255) gtTGATTTGTTTAACTCTGGTACGGGTTATCACAATCCCGTCGCGTTGAGTCTGGGATTAAATTa  <  1:1975157/65‑1 (MQ=255) gtTGATTTGTTTAACTCTGGTACGGGTTATCACAATCCCGTCGCGTTGAGTCTGGGATTAAATTa  <  1:1834899/65‑1 (MQ=255) gtTGATTTGTTTAACTCTGGTACGGGTTATCACAATCCCGTCGCGTTGAGTCTGGGATTAAATTa  <  1:1826514/65‑1 (MQ=255) gtTGATTTGTTTAACTCTGGTACGGGTTATCACAATCCCGTCGCGTTGAGTCTGGGATTAAATTa  <  1:1748677/65‑1 (MQ=255) gtTGATTTGTTTAACTCTGGTACGGGTTATCACAATCCCGTCGCGTTGAGTCTGGGATTAAATTa  <  1:8785/65‑1 (MQ=255) gtTGATTTGTTTAACTCTGGTACGGGTTATCACAATCCCGTCGCGTTGAGTCTGGGATTAAATTa  <  1:1523920/65‑1 (MQ=255) gtTGATTTGTTTAACTCTGGTACGGGTTATCACAATCCCGTCGCGTTGAGTCTGGGATTAAATTa  <  1:903929/65‑1 (MQ=255) gtTGATTTGTTTAACTCTGGTACGGGTTATCACAATCCCGTCGCGTTGAGTCTGGGATTAAAATa  <  1:323086/65‑1 (MQ=255)  ttGATTTGTTTAACTCTGGTACTGGTTATCACAATCCCGTCGCGTTGAGTCTGGGATTAAATTa  >  1:586960/1‑64 (MQ=255)  ttGATTTGTTTAACTCTGGTACGGGTTATCACAATCCCGTCGCGTTGAGTCTGGGATTAAATTa  >  1:604024/1‑64 (MQ=255)  ttGATTTGTTTAACTCTGGTACGGGTTATCACAATCCCGTCGCGTTGAGTCTGGGATTAAATTa  >  1:553663/1‑64 (MQ=255)  ttGATTTGTTTAACTCTGGTACGGGTTATCACAATCCCGTCGCGTTGAGTCTGGGATTAAATTa  >  1:2204359/1‑64 (MQ=255)  ttGATTTGTTTAACTCTGGTACGGGTTATCACAATCCCGTCGCGTTGAGTCTGGGATTAAATTa  >  1:31927/1‑64 (MQ=255)  ttGATTTGTTTAACTCTGGTACGGGTTATCACAATCCCGTCGCGTTGAGTCTGGGATTAAATTa  >  1:2510020/1‑64 (MQ=255)  ttGATTTGTTTAACTCTGGTACGGGTTATCACAATCCCGTCGCGTTGAGTCTGGGATTAAATTa  >  1:2386440/1‑64 (MQ=255)  ttGATTTGTTTAACTCTGGTACGGGTTATCACAATCCCGTCGCGTTGAGTCTGGGATTAAATTa  >  1:2361061/1‑64 (MQ=255)  ttGATTTGTTTAACTCTGGTACGGGTTATCACAATCCCGTCGCGTTGAGTCTGGGATTAAATTa  >  1:2302982/1‑64 (MQ=255)  ttGATTTGTTTAACTCTGGTACGGGTTATCACAATCCCGTCGCGTTGAGTCTGGGATTAAATTa  >  1:1321302/1‑64 (MQ=255)  ttGATTTGTTTAACTCTGGTACGGGTTATCACAATCCCGTCGCGTTGAGTCTGGGATTAAATTa  >  1:2144239/1‑64 (MQ=255)  ttGATTTGTTTAACTCTGGTACGGGTTATCACAATCCCGTCGCGTTGAGTCTGGGATTAAATTa  >  1:2089818/1‑64 (MQ=255)  ttGATTTGTTTAACTCTGGTACGGGTTATCACAATCCCGTCGCGTTGAGTCTGGGATTAAATTa  >  1:1991901/1‑64 (MQ=255)  ttGATTTGTTTAACTCTGGTACGGGTTATCACAATCCCGTCGCGTTGAGTCTGGGATTAAATTa  >  1:1922281/1‑64 (MQ=255)  ttGATTTGTTTAACTCTGGTACGGGTTATCACAATCCCGTCGCGTTGAGTCTGGGATTAAATTa  >  1:189508/1‑64 (MQ=255)  ttGATTTGTTTAACTCTGGTACGGGTTATCACAATCCCGTCGCGTTGAGTCTGGGATTAAATTa  >  1:1893665/1‑64 (MQ=255)  ttGATTTGTTTAACTCTGGTACGGGTTATCACAATCCCGTCGCGTTGAGTCTGGGATTAAATTa  >  1:1819445/1‑64 (MQ=255)  ttGATTTGTTTAACTCTGGTACGGGTTATCACAATCCCGTCGCGTTGAGTCTGGGATTAAATTa  >  1:1592322/1‑64 (MQ=255)  ttGATTTGTTTAACTCTGGTACGGGTTATCACAATCCCGTCGCGTTGAGTCTGGGATTAAATTa  >  1:1452241/1‑64 (MQ=255)  ttGATTTGTTTAACTCTGGTACGGGTTATCACAATCCCGTCGCGTTGAGTCTGGGATTAAAATa  >  1:2201531/1‑64 (MQ=255)  ttGATTTGTTTAACTCTGGTACGGGTTATCACAATCCCGTCGCGTTGAGTCTGGGATTAAAATa  >  1:850999/1‑64 (MQ=255)                                                                 | GTTGATTTGTTTAACTCTGGTACGGGTTATCACAATCCCGTCGCGTTGAGTCTGGGATTAAATTA  >  W3110S.gb/1276129‑1276193

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑