Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1276959	1277045	87	27 [0]	[0] 4	narL	DNA‑binding response regulator in two‑component regulatory system with NarX (or NarQ)

CAAACCCTGGGCAATCAGCTTGAGAATATCGCGCTCGCGTGGGGTTAACTGGTTAACATCGCGCT  >  W3110S.gb/1276894‑1276958                                                                 | cAAACCCTGGTCAATCAGCTTGAGAATATCGCGCTCGCGTGGGGTTAACTGGTTAACATCGCGCt  <  1:632252/65‑1 (MQ=255) cAAACCCTGGGCAATCAGCTTGAGAATATCGCGCTCGCGTGGTGTTAACTGGTTAACATCGCGCt  <  1:2326926/65‑1 (MQ=255) cAAACCCTGGGCAATCAGCTTGAGAATATCGCGCTCGCGTGGGGTTAACTGGTTAACATCGctct  <  1:5278/65‑1 (MQ=255) cAAACCCTGGGCAATCAGCTTGAGAATATCGCGCTCGCGTGGGGTTAACTGGTTAACATCGCGCt  <  1:1726327/65‑1 (MQ=255) cAAACCCTGGGCAATCAGCTTGAGAATATCGCGCTCGCGTGGGGTTAACTGGTTAACATCGCGCt  <  1:886683/65‑1 (MQ=255) cAAACCCTGGGCAATCAGCTTGAGAATATCGCGCTCGCGTGGGGTTAACTGGTTAACATCGCGCt  <  1:822353/65‑1 (MQ=255) cAAACCCTGGGCAATCAGCTTGAGAATATCGCGCTCGCGTGGGGTTAACTGGTTAACATCGCGCt  <  1:785798/65‑1 (MQ=255) cAAACCCTGGGCAATCAGCTTGAGAATATCGCGCTCGCGTGGGGTTAACTGGTTAACATCGCGCt  <  1:524474/65‑1 (MQ=255) cAAACCCTGGGCAATCAGCTTGAGAATATCGCGCTCGCGTGGGGTTAACTGGTTAACATCGCGCt  <  1:505092/65‑1 (MQ=255) cAAACCCTGGGCAATCAGCTTGAGAATATCGCGCTCGCGTGGGGTTAACTGGTTAACATCGCGCt  <  1:411915/65‑1 (MQ=255) cAAACCCTGGGCAATCAGCTTGAGAATATCGCGCTCGCGTGGGGTTAACTGGTTAACATCGCGCt  <  1:31078/65‑1 (MQ=255) cAAACCCTGGGCAATCAGCTTGAGAATATCGCGCTCGCGTGGGGTTAACTGGTTAACATCGCGCt  <  1:2527075/65‑1 (MQ=255) cAAACCCTGGGCAATCAGCTTGAGAATATCGCGCTCGCGTGGGGTTAACTGGTTAACATCGCGCt  <  1:238930/65‑1 (MQ=255) cAAACCCTGGGCAATCAGCTTGAGAATATCGCGCTCGCGTGGGGTTAACTGGTTAACATCGCGCt  <  1:104469/65‑1 (MQ=255) cAAACCCTGGGCAATCAGCTTGAGAATATCGCGCTCGCGTGGGGTTAACTGGTTAACATCGCGCt  <  1:1487826/65‑1 (MQ=255) cAAACCCTGGGCAATCAGCTTGAGAATATCGCGCTCGCGTGGGGTTAACTGGTTAACATCGCGCt  <  1:1428193/65‑1 (MQ=255) cAAACCCTGGGCAATCAGCTTGAGAATATCGCGCTCGCGTGGGGTTAACTGGTTAACATCGCGCt  <  1:1428151/65‑1 (MQ=255) cAAACCCTGGGCAATCAGCTTGAGAATATCGCGCTCGCGTGGGGTTAACTGGTTAACATCGCGCt  <  1:1423226/65‑1 (MQ=255) cAAACCCTGGGCAATCAGCTTGAGAATATCGCGCTCGCGTGGGGTTAACTGGTTAACATCGCGCt  <  1:1366354/65‑1 (MQ=255) cAAACCCTGGGCAATCAGCTTGAGAATATCGCGCTCGCGTGGGGTTAACTGGTTAACATCGCGCt  <  1:1337363/65‑1 (MQ=255) cAAACCCTGGGCAATCAGCTTGAGAATATCGCGCTCGCGTGGGGTTAACTGGTTAACATCGCGCt  <  1:1326712/65‑1 (MQ=255) cAAACCCTGGGCAATCAGCTTGAGAATATCGCGCTCGCGTGGGGTTAACTGGTTAACATCGCGCt  <  1:1308853/65‑1 (MQ=255) cAAACCCTGGGCAATCAGCTTGAGAATATCGCGCTCGCGTGGGGTTAACTGGTTAACATCGCGCt  <  1:1306682/65‑1 (MQ=255) cAAACCCTGGGCAATCAGCTTGAGAATATCGCGCTCGCGTGGGGTTAACTGGTTAACATCGCGCt  <  1:1100391/65‑1 (MQ=255)  aaaCCCTGGGCAATCAGCTTGAGAATATCGCGCTCGCGTGGGGTTAACTGGTTAACATCGCGCt  <  1:2406080/64‑1 (MQ=255)  aaaCCCTGGGCAATCAGCTTGAGAATATCGCGCTCGCGTGGGGTTAACTGGTTAACATCGCGCt  <  1:110771/64‑1 (MQ=255)           gCAATCAGCTTGAGAATATCGCGCTCGCGTGTGGTTAACTGGTTAACATCGCGCt  <  1:1254754/55‑1 (MQ=255)                                                                 | CAAACCCTGGGCAATCAGCTTGAGAATATCGCGCTCGCGTGGGGTTAACTGGTTAACATCGCGCT  >  W3110S.gb/1276894‑1276958

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑