Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1277842	1277860	19	17 [0]	[0] 24	narX	sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with NarL

ACTCGCCTCCAGCGCCGGACGTAATCCAGGCTCGGTGAGCTGCAAGCGGA  >  W3110S.gb/1277792‑1277841                                                  | aCTCGCCTCCAGCGCCGGACGTAATCCAGGCTCGGTGAGCTGCAAGCGGa  <  1:1849523/50‑1 (MQ=255) aCTCGCCTCCAGCGCCGGACGTAATCCAGGCTCGGTGAGCTGCAAGCGGa  <  1:816382/50‑1 (MQ=255) aCTCGCCTCCAGCGCCGGACGTAATCCAGGCTCGGTGAGCTGCAAGCGGa  <  1:752538/50‑1 (MQ=255) aCTCGCCTCCAGCGCCGGACGTAATCCAGGCTCGGTGAGCTGCAAGCGGa  <  1:341685/50‑1 (MQ=255) aCTCGCCTCCAGCGCCGGACGTAATCCAGGCTCGGTGAGCTGCAAGCGGa  <  1:2457964/50‑1 (MQ=255) aCTCGCCTCCAGCGCCGGACGTAATCCAGGCTCGGTGAGCTGCAAGCGGa  <  1:2265974/50‑1 (MQ=255) aCTCGCCTCCAGCGCCGGACGTAATCCAGGCTCGGTGAGCTGCAAGCGGa  <  1:2196248/50‑1 (MQ=255) aCTCGCCTCCAGCGCCGGACGTAATCCAGGCTCGGTGAGCTGCAAGCGGa  <  1:2184426/50‑1 (MQ=255) aCTCGCCTCCAGCGCCGGACGTAATCCAGGCTCGGTGAGCTGCAAGCGGa  <  1:1065037/50‑1 (MQ=255) aCTCGCCTCCAGCGCCGGACGTAATCCAGGCTCGGTGAGCTGCAAGCGGa  <  1:1773602/50‑1 (MQ=255) aCTCGCCTCCAGCGCCGGACGTAATCCAGGCTCGGTGAGCTGCAAGCGGa  <  1:1675473/50‑1 (MQ=255) aCTCGCCTCCAGCGCCGGACGTAATCCAGGCTCGGTGAGCTGCAAGCGGa  <  1:1568294/50‑1 (MQ=255) aCTCGCCTCCAGCGCCGGACGTAATCCAGGCTCGGTGAGCTGCAAGCGGa  <  1:153776/50‑1 (MQ=255) aCTCGCCTCCAGCGCCGGACGTAATCCAGGCTCGGTGAGCTGCAAGCGGa  <  1:1344218/50‑1 (MQ=255) aCTCGCCTCCAGCGCCGGACGTAATCCAGGCTCGGTGAGCTGCAAGCGGa  <  1:1201546/50‑1 (MQ=255) aCTCGCCTCCAGCGCCGGACGTAATCCAGGCTCGGTGAGCTGCAAGCGGa  <  1:1095545/50‑1 (MQ=255) aCTCGCCTCCAGCGCCGGACGTAATCCAGGCTCGGAGAGCTGCAAGCGGa  <  1:2442738/50‑1 (MQ=255)                                                  | ACTCGCCTCCAGCGCCGGACGTAATCCAGGCTCGGTGAGCTGCAAGCGGA  >  W3110S.gb/1277792‑1277841

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑