Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1279077	1279093	17	12 [0]	[0] 11	narX	sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with NarL

CCAACAGACGGTAACTTTGCATGCGCAGCGATCCCGCTTTGTTGATCGCATGGGCGCTGCCCTGA  >  W3110S.gb/1279012‑1279076                                                                 | ccAACAGACGGTAACTTTGCATGCGCAGCGATCCCGCTTTGTTGATCGCATGGGCGCTGCCCTGa  <  1:1237574/65‑1 (MQ=255) ccAACAGACGGTAACTTTGCATGCGCAGCGATCCCGCTTTGTTGATCGCATGGGCGCTGCCCTGa  <  1:125103/65‑1 (MQ=255) ccAACAGACGGTAACTTTGCATGCGCAGCGATCCCGCTTTGTTGATCGCATGGGCGCTGCCCTGa  <  1:1337696/65‑1 (MQ=255) ccAACAGACGGTAACTTTGCATGCGCAGCGATCCCGCTTTGTTGATCGCATGGGCGCTGCCCTGa  <  1:1476629/65‑1 (MQ=255) ccAACAGACGGTAACTTTGCATGCGCAGCGATCCCGCTTTGTTGATCGCATGGGCGCTGCCCTGa  <  1:1596949/65‑1 (MQ=255) ccAACAGACGGTAACTTTGCATGCGCAGCGATCCCGCTTTGTTGATCGCATGGGCGCTGCCCTGa  <  1:1601987/65‑1 (MQ=255) ccAACAGACGGTAACTTTGCATGCGCAGCGATCCCGCTTTGTTGATCGCATGGGCGCTGCCCTGa  <  1:1972571/65‑1 (MQ=255) ccAACAGACGGTAACTTTGCATGCGCAGCGATCCCGCTTTGTTGATCGCATGGGCGCTGCCCTGa  <  1:2113641/65‑1 (MQ=255) ccAACAGACGGTAACTTTGCATGCGCAGCGATCCCGCTTTGTTGATCGCATGGGCGCTGCCCTGa  <  1:564378/65‑1 (MQ=255) ccAACAGACGGTAACTTTGCATGCGCAGCGATCCCGCTTTGTTGATCGCATGGGCGCTGCCCTGa  <  1:852166/65‑1 (MQ=255) ccAACAGACGGTAACTTTGCATGCGCAGCGATCCCGCTTTGTTGATCGCATGGGCGCTGCCCTGa  <  1:958366/65‑1 (MQ=255)    aCAGACGGTAACTTTGCATGCGCAGCGATCCCGCTTTGTTGATCGCATGGGCGCTGCCCTGa  <  1:1132349/62‑1 (MQ=255)                                                                 | CCAACAGACGGTAACTTTGCATGCGCAGCGATCCCGCTTTGTTGATCGCATGGGCGCTGCCCTGA  >  W3110S.gb/1279012‑1279076

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑