Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1332261	1332269	9	21 [0]	[0] 31	yciN	hypothetical protein

CGGTGCTTTTGGCTGTTGGCAATCCTTGTTCATCTAAAAAGTAGTCGCCGGTAAATACCAGCACG  >  W3110S.gb/1332196‑1332260                                                                 | cgGTGCTTTTGGCTGTTGGCAATCCTTGTTCATCTAAAAAGTAGTCGCCGGTAAATACCAGCTCg  <  1:663/65‑1 (MQ=255) cgGTGCTTTTGGCTGTTGGCAATCCTTGTTCATCTAAAAAGTAGTCGCCGGTAAATACCAGCACg  <  1:1016757/65‑1 (MQ=255) cgGTGCTTTTGGCTGTTGGCAATCCTTGTTCATCTAAAAAGTAGTCGCCGGTAAATACCAGCACg  <  1:835157/65‑1 (MQ=255) cgGTGCTTTTGGCTGTTGGCAATCCTTGTTCATCTAAAAAGTAGTCGCCGGTAAATACCAGCACg  <  1:832071/65‑1 (MQ=255) cgGTGCTTTTGGCTGTTGGCAATCCTTGTTCATCTAAAAAGTAGTCGCCGGTAAATACCAGCACg  <  1:805544/65‑1 (MQ=255) cgGTGCTTTTGGCTGTTGGCAATCCTTGTTCATCTAAAAAGTAGTCGCCGGTAAATACCAGCACg  <  1:728749/65‑1 (MQ=255) cgGTGCTTTTGGCTGTTGGCAATCCTTGTTCATCTAAAAAGTAGTCGCCGGTAAATACCAGCACg  <  1:2130766/65‑1 (MQ=255) cgGTGCTTTTGGCTGTTGGCAATCCTTGTTCATCTAAAAAGTAGTCGCCGGTAAATACCAGCACg  <  1:2100595/65‑1 (MQ=255) cgGTGCTTTTGGCTGTTGGCAATCCTTGTTCATCTAAAAAGTAGTCGCCGGTAAATACCAGCACg  <  1:199530/65‑1 (MQ=255) cgGTGCTTTTGGCTGTTGGCAATCCTTGTTCATCTAAAAAGTAGTCGCCGGTAAATACCAGCACg  <  1:1901990/65‑1 (MQ=255) cgGTGCTTTTGGCTGTTGGCAATCCTTGTTCATCTAAAAAGTAGTCGCCGGTAAATACCAGCACg  <  1:184585/65‑1 (MQ=255) cgGTGCTTTTGGCTGTTGGCAATCCTTGTTCATCTAAAAAGTAGTCGCCGGTAAATACCAGCACg  <  1:1569410/65‑1 (MQ=255) cgGTGCTTTTGGCTGTTGGCAATCCTTGTTCATCTAAAAAGTAGTCGCCGGTAAATACCAGCACg  <  1:153492/65‑1 (MQ=255) cgGTGCTTTTGGCTGTTGGCAATCCTTGTTCATCTAAAAAGTAGTCGCCGGTAAATACCAGCACg  <  1:1526874/65‑1 (MQ=255) cgGTGCTTTTGGCTGTTGGCAATCCTTGTTCATCTAAAAAGTAGTCGCCGGTAAATACCAGCACg  <  1:1523419/65‑1 (MQ=255) cgGTGCTTTTGGCTGTTGGCAATCCTTGTTCATCTAAAAAGTAGTCGCCGGTAAATACCAGCACg  <  1:1392718/65‑1 (MQ=255) cgGTGCTTTTGGCTGTTGGCAATCCTTGTTCATCTAAAAAGTAGTCGCCGGTAAATACCAGCACg  <  1:1285278/65‑1 (MQ=255) cgGTGCTTTTGGCTGTTGGCAATCCTTGTTCATCTAAAAAGTAGTCGCCGGTAAATACCAGCACg  <  1:1220495/65‑1 (MQ=255) cgGTGCTTTTGGCTGTTGGCAATCCTTGTTCATCTAAAAAGTAGTCGCCGGTAAATACCAGCACg  <  1:1049060/65‑1 (MQ=255) cgGTGCTTTTGGCTGTTGGCAATCCTTGTTCATCTAAAAAGTAGTCGCCGGTAAATACCAGCACg  <  1:1001917/65‑1 (MQ=255)                  ggCAATCCTTGTTCATCTAAAAAGTAGTCGCCGGTAAATACCAGCACg  <  1:862513/48‑1 (MQ=255)                                                                 | CGGTGCTTTTGGCTGTTGGCAATCCTTGTTCATCTAAAAAGTAGTCGCCGGTAAATACCAGCACG  >  W3110S.gb/1332196‑1332260

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑