Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1336555	1336574	20	28 [0]	[0] 8	cysB/yciX	DNA‑binding transcriptional dual regulator, O‑acetyl‑L‑serine‑binding/ECK1270:JW5198:b4522; hypothetical protein, N‑ter fragment

TCTAATGAAGAAATTGAGGTCATGTTTAAAGATATAAAACTGCCGGAAAAATAATTTCTTGCGTT  >  W3110S.gb/1336490‑1336554                                                                 | tctAATGAAGAAATTGAGGTCATGTTTAAAGATATAAAACTGCCGGAAAAATAATTTCTTGCGtt  >  1:2259039/1‑65 (MQ=255) tctAATGAAGAAATTGAGGTCATGTTTAAAGATATAAAACTGCCGGAAAAATAATTTCTTGCGtt  >  1:969580/1‑65 (MQ=255) tctAATGAAGAAATTGAGGTCATGTTTAAAGATATAAAACTGCCGGAAAAATAATTTCTTGCGtt  >  1:959718/1‑65 (MQ=255) tctAATGAAGAAATTGAGGTCATGTTTAAAGATATAAAACTGCCGGAAAAATAATTTCTTGCGtt  >  1:955194/1‑65 (MQ=255) tctAATGAAGAAATTGAGGTCATGTTTAAAGATATAAAACTGCCGGAAAAATAATTTCTTGCGtt  >  1:928001/1‑65 (MQ=255) tctAATGAAGAAATTGAGGTCATGTTTAAAGATATAAAACTGCCGGAAAAATAATTTCTTGCGtt  >  1:777585/1‑65 (MQ=255) tctAATGAAGAAATTGAGGTCATGTTTAAAGATATAAAACTGCCGGAAAAATAATTTCTTGCGtt  >  1:773422/1‑65 (MQ=255) tctAATGAAGAAATTGAGGTCATGTTTAAAGATATAAAACTGCCGGAAAAATAATTTCTTGCGtt  >  1:742367/1‑65 (MQ=255) tctAATGAAGAAATTGAGGTCATGTTTAAAGATATAAAACTGCCGGAAAAATAATTTCTTGCGtt  >  1:639602/1‑65 (MQ=255) tctAATGAAGAAATTGAGGTCATGTTTAAAGATATAAAACTGCCGGAAAAATAATTTCTTGCGtt  >  1:591442/1‑65 (MQ=255) tctAATGAAGAAATTGAGGTCATGTTTAAAGATATAAAACTGCCGGAAAAATAATTTCTTGCGtt  >  1:492638/1‑65 (MQ=255) tctAATGAAGAAATTGAGGTCATGTTTAAAGATATAAAACTGCCGGAAAAATAATTTCTTGCGtt  >  1:379681/1‑65 (MQ=255) tctAATGAAGAAATTGAGGTCATGTTTAAAGATATAAAACTGCCGGAAAAATAATTTCTTGCGtt  >  1:2451378/1‑65 (MQ=255) tctAATGAAGAAATTGAGGTCATGTTTAAAGATATAAAACTGCCGGAAAAATAATTTCTTGCGtt  >  1:10055/1‑65 (MQ=255) tctAATGAAGAAATTGAGGTCATGTTTAAAGATATAAAACTGCCGGAAAAATAATTTCTTGCGtt  >  1:2237364/1‑65 (MQ=255) tctAATGAAGAAATTGAGGTCATGTTTAAAGATATAAAACTGCCGGAAAAATAATTTCTTGCGtt  >  1:2234330/1‑65 (MQ=255) tctAATGAAGAAATTGAGGTCATGTTTAAAGATATAAAACTGCCGGAAAAATAATTTCTTGCGtt  >  1:2206988/1‑65 (MQ=255) tctAATGAAGAAATTGAGGTCATGTTTAAAGATATAAAACTGCCGGAAAAATAATTTCTTGCGtt  >  1:219347/1‑65 (MQ=255) tctAATGAAGAAATTGAGGTCATGTTTAAAGATATAAAACTGCCGGAAAAATAATTTCTTGCGtt  >  1:2178644/1‑65 (MQ=255) tctAATGAAGAAATTGAGGTCATGTTTAAAGATATAAAACTGCCGGAAAAATAATTTCTTGCGtt  >  1:2089470/1‑65 (MQ=255) tctAATGAAGAAATTGAGGTCATGTTTAAAGATATAAAACTGCCGGAAAAATAATTTCTTGCGtt  >  1:2014802/1‑65 (MQ=255) tctAATGAAGAAATTGAGGTCATGTTTAAAGATATAAAACTGCCGGAAAAATAATTTCTTGCGtt  >  1:1625955/1‑65 (MQ=255) tctAATGAAGAAATTGAGGTCATGTTTAAAGATATAAAACTGCCGGAAAAATAATTTCTTGCGtt  >  1:1326798/1‑65 (MQ=255) tctAATGAAGAAATTGAGGTCATGTTTAAAGATATAAAACTGCCGGAAAAATAATTTCTTGCGtt  >  1:11709/1‑65 (MQ=255) tctAATGAAGAAATTGAGGTCATGTTTAAAGATATAAAACTGCCGGAAAAATAATTTCTTGCGtt  >  1:1149224/1‑65 (MQ=255) tctAATGAAGAAATTGAGGTCATGTTTAAAGATATAAAACTGCCGGAAAAATAATTTCTTGCGtt  >  1:1105280/1‑65 (MQ=255) tctAATGAAGAAATTGAGGGCATGTTTAAAGATATAAAACTGCCGGAAAAATAATTTCTTGCGtt  >  1:2324979/1‑65 (MQ=255) tctAATGAAGAAATTCAGGTCATGTTTAAAGATATAAAACTGCCGGAAAAATAATTTCTTGCGtt  >  1:1036710/1‑65 (MQ=255)                                                                 | TCTAATGAAGAAATTGAGGTCATGTTTAAAGATATAAAACTGCCGGAAAAATAATTTCTTGCGTT  >  W3110S.gb/1336490‑1336554

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑