Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1359343	1359354	12	33 [0]	[0] 10	ymjA	hypothetical protein

GTAGTGGGCCAGCGGTGTGCGTTCAGCCTCTGCGACAGGCTCTGCGCATTCGGTCGCGTACTCAT  >  W3110S.gb/1359278‑1359342                                                                 | gtagtGGGCCAGCGGTGTGCGTTCAGCCTCTGCGACAGGCTCTGCGCATTCGGTCGCGTACTTAt  <  1:322059/65‑1 (MQ=255) gtagtGGGCCAGCGGTGTGCGTTCAGCCTCTGCGACAGGCTCTGCGCATTCGGTCGCGTACTCAt  <  1:2207237/65‑1 (MQ=255) gtagtGGGCCAGCGGTGTGCGTTCAGCCTCTGCGACAGGCTCTGCGCATTCGGTCGCGTACTCAt  <  1:994234/65‑1 (MQ=255) gtagtGGGCCAGCGGTGTGCGTTCAGCCTCTGCGACAGGCTCTGCGCATTCGGTCGCGTACTCAt  <  1:992369/65‑1 (MQ=255) gtagtGGGCCAGCGGTGTGCGTTCAGCCTCTGCGACAGGCTCTGCGCATTCGGTCGCGTACTCAt  <  1:77446/65‑1 (MQ=255) gtagtGGGCCAGCGGTGTGCGTTCAGCCTCTGCGACAGGCTCTGCGCATTCGGTCGCGTACTCAt  <  1:540414/65‑1 (MQ=255) gtagtGGGCCAGCGGTGTGCGTTCAGCCTCTGCGACAGGCTCTGCGCATTCGGTCGCGTACTCAt  <  1:2495677/65‑1 (MQ=255) gtagtGGGCCAGCGGTGTGCGTTCAGCCTCTGCGACAGGCTCTGCGCATTCGGTCGCGTACTCAt  <  1:2337445/65‑1 (MQ=255) gtagtGGGCCAGCGGTGTGCGTTCAGCCTCTGCGACAGGCTCTGCGCATTCGGTCGCGTACTCAt  <  1:1038238/65‑1 (MQ=255) gtagtGGGCCAGCGGTGTGCGTTCAGCCTCTGCGACAGGCTCTGCGCATTCGGTCGCGTACTCAt  <  1:1939512/65‑1 (MQ=255) gtagtGGGCCAGCGGTGTGCGTTCAGCCTCTGCGACAGGCTCTGCGCATTCGGTCGCGTACTCAt  <  1:1906118/65‑1 (MQ=255) gtagtGGGCCAGCGGTGTGCGTTCAGCCTCTGCGACAGGCTCTGCGCATTCGGTCGCGTACTCAt  <  1:1708979/65‑1 (MQ=255) gtagtGGGCCAGCGGTGTGCGTTCAGCCTCTGCGACAGGCTCTGCGCATTCGGTCGCGTACTCAt  <  1:1046967/65‑1 (MQ=255) gtagtGGGCCAGCGGTGTGCGTTCAGCCTCTGCGACAGGCTCTGCGCATTCGGTCGCGTACTCAt  <  1:1244137/65‑1 (MQ=255) gtagtGGGCCAGCGGTGTGCGTTCAGCCTCTGCGACAGGCTCTGCGCATTCGGTCGCGTACTCAt  <  1:143527/65‑1 (MQ=255) gtagtGGGCCAGCGGTGTGCGTTCAGCCTCTGCGACAGGCTCTGCGCATTCGGTCGCGTACTCAt  <  1:1531508/65‑1 (MQ=255) gtagtGGGCCAGCGGTGTGCGTTCAGCCTCTGCGACAGGCTCTGCGCATTCGGTCGCGTACTCAt  <  1:1491006/65‑1 (MQ=255) gtagtGGGCCAGCGGTGTGCGTTCAGCCTCTGCGACAGGCACTGCGCATTCGGTCGCGTACTCAt  <  1:1833194/65‑1 (MQ=255)                        cAGCCTCTGCGACAGGCTCTGCGCATTCGGTCGCGTACTCAt  <  1:2384831/42‑1 (MQ=255)                        cAGCCTCTGCGACAGGCTCTGCGCATTCGGTCGCGTACTCAt  <  1:2428805/42‑1 (MQ=255)                        cAGCCTCTGCGACAGGCTCTGCGCATTCGGTCGCGTACTCAt  <  1:2080702/42‑1 (MQ=255)                        cAGCCTCTGCGACAGGCTCTGCGCATTCGGTCGCGTACTCAt  <  1:309564/42‑1 (MQ=255)                        cAGCCTCTGCGACAGGCTCTGCGCATTCGGTCGCGTACTCAt  <  1:1340421/42‑1 (MQ=255)                        cAGCCTCTGCGACAGGCTCTGCGCATTCGGTCGCGTACTCAt  <  1:446317/42‑1 (MQ=255)                        cAGCCTCTGCGACAGGCTCTGCGCATTCGGTCGCGTACTCAt  <  1:1305387/42‑1 (MQ=255)                        cAGCCTCTGCGACAGGCTCTGCGCATTCGGTCGCGTACTCAt  <  1:723130/42‑1 (MQ=255)                        cAGCCTCTGCGACAGGCTCTGCGCATTCGGTCGCGTACTCAt  <  1:765618/42‑1 (MQ=255)                        cAGCCTCTGCGACAGGCTCTGCGCATTCGGTCGCGTACTCAt  <  1:1573028/42‑1 (MQ=255)                        cAGCCTCTGCGACAGGCTCTGCGCATTCGGTCGCGTACTCAt  <  1:83543/42‑1 (MQ=255)                        cAGCCTCTGCGACAGGCTCTGCGCATTCGGTCGCGTACTCAt  <  1:870234/42‑1 (MQ=255)                        cAGCCTCTGCGACAGGCTCTGCGCATTCGGTCGCGTACTCAt  <  1:877789/42‑1 (MQ=255)                        cAGCCTCTGCGACAGGCTCTGCGCATTCGGTCGCGTACTCAt  <  1:1590781/42‑1 (MQ=255)                        cAGCCTCTGCGACAGGCTCTGAGCATTCGGTCGCGTACTCAt  <  1:1187672/42‑1 (MQ=255)                                                                 | GTAGTGGGCCAGCGGTGTGCGTTCAGCCTCTGCGACAGGCTCTGCGCATTCGGTCGCGTACTCAT  >  W3110S.gb/1359278‑1359342

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑