Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1408139	1408154	16	31 [0]	[0] 18	ydaL	conserved hypothetical protein

AAATCGCATGCCAATATTGTCCGCAGCTATGTGGCGCGCTGGCTGACCGAATTTGATGATGTTCA  >  W3110S.gb/1408074‑1408138                                                                 | aaaTCGCATGCCAATATTGTCCGCAGCTATGTGGCGCGCTGGCTGACCGAATTTGATGATGTTCa  <  1:2353256/65‑1 (MQ=255) aaaTCGCATGCCAATATTGTCCGCAGCTATGTGGCGCGCTGGCTGACCGAATTTGATGATGTTCa  <  1:998760/65‑1 (MQ=255) aaaTCGCATGCCAATATTGTCCGCAGCTATGTGGCGCGCTGGCTGACCGAATTTGATGATGTTCa  <  1:879913/65‑1 (MQ=255) aaaTCGCATGCCAATATTGTCCGCAGCTATGTGGCGCGCTGGCTGACCGAATTTGATGATGTTCa  <  1:867997/65‑1 (MQ=255) aaaTCGCATGCCAATATTGTCCGCAGCTATGTGGCGCGCTGGCTGACCGAATTTGATGATGTTCa  <  1:816904/65‑1 (MQ=255) aaaTCGCATGCCAATATTGTCCGCAGCTATGTGGCGCGCTGGCTGACCGAATTTGATGATGTTCa  <  1:524783/65‑1 (MQ=255) aaaTCGCATGCCAATATTGTCCGCAGCTATGTGGCGCGCTGGCTGACCGAATTTGATGATGTTCa  <  1:510843/65‑1 (MQ=255) aaaTCGCATGCCAATATTGTCCGCAGCTATGTGGCGCGCTGGCTGACCGAATTTGATGATGTTCa  <  1:36680/65‑1 (MQ=255) aaaTCGCATGCCAATATTGTCCGCAGCTATGTGGCGCGCTGGCTGACCGAATTTGATGATGTTCa  <  1:351707/65‑1 (MQ=255) aaaTCGCATGCCAATATTGTCCGCAGCTATGTGGCGCGCTGGCTGACCGAATTTGATGATGTTCa  <  1:2481462/65‑1 (MQ=255) aaaTCGCATGCCAATATTGTCCGCAGCTATGTGGCGCGCTGGCTGACCGAATTTGATGATGTTCa  <  1:2417566/65‑1 (MQ=255) aaaTCGCATGCCAATATTGTCCGCAGCTATGTGGCGCGCTGGCTGACCGAATTTGATGATGTTCa  <  1:1130893/65‑1 (MQ=255) aaaTCGCATGCCAATATTGTCCGCAGCTATGTGGCGCGCTGGCTGACCGAATTTGATGATGTTCa  <  1:2213558/65‑1 (MQ=255) aaaTCGCATGCCAATATTGTCCGCAGCTATGTGGCGCGCTGGCTGACCGAATTTGATGATGTTCa  <  1:205853/65‑1 (MQ=255) aaaTCGCATGCCAATATTGTCCGCAGCTATGTGGCGCGCTGGCTGACCGAATTTGATGATGTTCa  <  1:1318885/65‑1 (MQ=255) aaaTCGCATGCCAATATTGTCCGCAGCTATGTGGCGCGCTGGCTGACCGAATTTGATGATGTTCa  <  1:1346742/65‑1 (MQ=255) aaaTCGCATGCCAATATTGTCCGCAGCTATGTGGCGCGCTGGCTGACCGAATTTGATGATGTTCa  <  1:1381137/65‑1 (MQ=255) aaaTCGCATGCCAATATTGTCCGCAGCTATGTGGCGCGCTGGCTGACCGAATTTGATGATGTTCa  <  1:1389840/65‑1 (MQ=255) aaaTCGCATGCCAATATTGTCCGCAGCTATGTGGCGCGCTGGCTGACCGAATTTGATGATGTTCa  <  1:1653325/65‑1 (MQ=255) aaaTCGCATGCCAATATTGTCCGCAGCTATGTGGCGCGCTGGCTGACCGAATTTGATGATGTTCa  <  1:1672107/65‑1 (MQ=255) aaaTCGCATGCCAATATTGTCCGCAGCTATGTGGCGCGCTGGCTGACCGAATTTGATGATGTTCa  <  1:1837886/65‑1 (MQ=255) aaaTCGCATGCCAATATTGTCCGCAGCTATGTGGCGCGCTGGCTGACCGAATTTGATGATGTTCa  <  1:1927299/65‑1 (MQ=255) aaaTCGCATGCCAATATTGTCCGCAGCTATGTGGCGCGCTGGCTGACCGAATTTGATGATGTTCa  <  1:2035204/65‑1 (MQ=255) aaaTCGCATGCCAATATTGTCCGCAGCTATGTGGCGCGCTGGCTGACCGAATTTGATGATGTTCa  <  1:2077208/65‑1 (MQ=255) aaaTCGCATGCCAATATTGTCCGCAGCTATGTGACGCGCTGGCTGACCGAATTTGATGATGTTCa  <  1:1564016/65‑1 (MQ=255)  aaTCGCATGCCAATATTGTCCGCAGCTATGTGGCGCGCTGGCTGACCGAATTTGATGATGTTCa  <  1:470611/64‑1 (MQ=255)  aaTCGCATGCCAATATTGTCCGCAGCTATGTGGCGCGCTGGCTGACCGAATTTGATGATGTTCa  <  1:500347/64‑1 (MQ=255)  aaTCGCATGCCAATATTGTCCGCAGCTATGTGGCGCGCTGGCTGACCGAATTTGATGATGTTCa  <  1:1646919/64‑1 (MQ=255)  aaTCGCATGCCAATATTGTCCGCAGCTATGTGGCGCGCTGGCTGACCGAATTTGATGATGTTCa  <  1:581070/64‑1 (MQ=255)  aaTCGCATGCCAATATTGTCCGCAGCTATGTGGCGCGCTGGCTGACCGAATTTGATGATGTTCa  <  1:777038/64‑1 (MQ=255)   aTCGCATGCCAATATTGTCCGCAGCTATGTGGCGCGCTGGCTGACCGAATTTGATGATGTTCa  <  1:610312/63‑1 (MQ=255)                                                                 | AAATCGCATGCCAATATTGTCCGCAGCTATGTGGCGCGCTGGCTGACCGAATTTGATGATGTTCA  >  W3110S.gb/1408074‑1408138

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑