Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1430360	1430384	25	31 [0]	[0] 28	lomR insH	ECK1366:JW5884+JW5904:b4570; Rac prophage region; hypothetical protein IS5 transposase and trans‑activator

CCGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCGGTCATATTCTGCCATGGCAGAATCTGCTCCAT  >  W3110S.gb/1430296‑1430359                                                                | ccGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCGGTCATATTCTGCCATGGCAGAATCTGCTCCAt  <  1:170530/64‑1 (MQ=255) ccGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCGGTCATATTCTGCCATGGCAGAATCTGCTCCAt  <  1:958283/64‑1 (MQ=255) ccGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCGGTCATATTCTGCCATGGCAGAATCTGCTCCAt  <  1:738110/64‑1 (MQ=255) ccGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCGGTCATATTCTGCCATGGCAGAATCTGCTCCAt  <  1:674635/64‑1 (MQ=255) ccGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCGGTCATATTCTGCCATGGCAGAATCTGCTCCAt  <  1:590185/64‑1 (MQ=255) ccGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCGGTCATATTCTGCCATGGCAGAATCTGCTCCAt  <  1:407887/64‑1 (MQ=255) ccGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCGGTCATATTCTGCCATGGCAGAATCTGCTCCAt  <  1:406492/64‑1 (MQ=255) ccGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCGGTCATATTCTGCCATGGCAGAATCTGCTCCAt  <  1:363557/64‑1 (MQ=255) ccGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCGGTCATATTCTGCCATGGCAGAATCTGCTCCAt  <  1:2389290/64‑1 (MQ=255) ccGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCGGTCATATTCTGCCATGGCAGAATCTGCTCCAt  <  1:22868/64‑1 (MQ=255) ccGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCGGTCATATTCTGCCATGGCAGAATCTGCTCCAt  <  1:2267832/64‑1 (MQ=255) ccGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCGGTCATATTCTGCCATGGCAGAATCTGCTCCAt  <  1:2227497/64‑1 (MQ=255) ccGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCGGTCATATTCTGCCATGGCAGAATCTGCTCCAt  <  1:2014391/64‑1 (MQ=255) ccGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCGGTCATATTCTGCCATGGCAGAATCTGCTCCAt  <  1:1940517/64‑1 (MQ=255) ccGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCGGTCATATTCTGCCATGGCAGAATCTGCTCCAt  <  1:1013957/64‑1 (MQ=255) ccGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCGGTCATATTCTGCCATGGCAGAATCTGCTCCAt  <  1:1643207/64‑1 (MQ=255) ccGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCGGTCATATTCTGCCATGGCAGAATCTGCTCCAt  <  1:1633727/64‑1 (MQ=255) ccGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCGGTCATATTCTGCCATGGCAGAATCTGCTCCAt  <  1:1623158/64‑1 (MQ=255) ccGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCGGTCATATTCTGCCATGGCAGAATCTGCTCCAt  <  1:1597399/64‑1 (MQ=255) ccGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCGGTCATATTCTGCCATGGCAGAATCTGCTCCAt  <  1:1491529/64‑1 (MQ=255) ccGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCGGTCATATTCTGCCATGGCAGAATCTGCTCCAt  <  1:1448865/64‑1 (MQ=255) ccGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCGGTCATATTCTGCCATGGCAGAATCTGCTCCAt  <  1:1363494/64‑1 (MQ=255) ccGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCGGTCATATTCTGCCATGGCAGAATCTGCTCCAt  <  1:130555/64‑1 (MQ=255) ccGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCGGTCATATTCTGCCATGGCAGAATCTGCTCCAt  <  1:1243759/64‑1 (MQ=255) ccGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCGGTCATATTCTGCCATGGCAGAATCTGCTCCAt  <  1:1217572/64‑1 (MQ=255) ccGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCGGTCATATTCTGCCATGGCAGAATCTGCTCCAt  <  1:1138075/64‑1 (MQ=255) ccGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCGGTCATATTCTGCCATGGCAGAATCTGCTCCAt  <  1:1100289/64‑1 (MQ=255) ccGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCGGTCATATTCTGCCATGGCAGAATCTGCTCCAt  <  1:1099596/64‑1 (MQ=255)  cGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCGGTCATATTCTGCCATGGCAGAATCTGCTCCAt  <  1:413037/63‑1 (MQ=255)  cGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCGGTCATATTCTGCCATGGCAGAATCTGCTCCAt  <  1:52077/63‑1 (MQ=255)   gCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCGGTCATATTCTGCCATGGCAGAATCTGCTCCAt  <  1:1431259/62‑1 (MQ=255)                                                                | CCGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCGGTCATATTCTGCCATGGCAGAATCTGCTCCAT  >  W3110S.gb/1430296‑1430359

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑