Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1432817	1432852	36	33 [0]	[0] 19	stfR	predicted tail fiber protein

ACCTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGATTT  >  W3110S.gb/1432752‑1432816                                                                 | aCCTATAAGTTTGGGGCAACTAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGAttt  <  1:156530/65‑1 (MQ=255) aCCTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGAttt  <  1:455667/65‑1 (MQ=255) aCCTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGAttt  <  1:241240/65‑1 (MQ=255) aCCTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGAttt  <  1:2422107/65‑1 (MQ=255) aCCTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGAttt  <  1:2480305/65‑1 (MQ=255) aCCTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGAttt  <  1:2529563/65‑1 (MQ=255) aCCTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGAttt  <  1:354818/65‑1 (MQ=255) aCCTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGAttt  <  1:416782/65‑1 (MQ=255) aCCTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGAttt  <  1:423867/65‑1 (MQ=255) aCCTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGAttt  <  1:440150/65‑1 (MQ=255) aCCTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGAttt  <  1:2365727/65‑1 (MQ=255) aCCTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGAttt  <  1:471660/65‑1 (MQ=255) aCCTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGAttt  <  1:599690/65‑1 (MQ=255) aCCTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGAttt  <  1:721948/65‑1 (MQ=255) aCCTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGAttt  <  1:751392/65‑1 (MQ=255) aCCTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGAttt  <  1:910311/65‑1 (MQ=255) aCCTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGAttt  <  1:955877/65‑1 (MQ=255) aCCTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGAttt  <  1:1175209/65‑1 (MQ=255) aCCTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGAttt  <  1:2329645/65‑1 (MQ=255) aCCTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGAttt  <  1:2132048/65‑1 (MQ=255) aCCTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGAttt  <  1:2069067/65‑1 (MQ=255) aCCTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGAttt  <  1:203334/65‑1 (MQ=255) aCCTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGAttt  <  1:2012206/65‑1 (MQ=255) aCCTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGAttt  <  1:1985299/65‑1 (MQ=255) aCCTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGAttt  <  1:1566064/65‑1 (MQ=255) aCCTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGAttt  <  1:1553123/65‑1 (MQ=255) aCCTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGAttt  <  1:1527685/65‑1 (MQ=255) aCCTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGAttt  <  1:1392347/65‑1 (MQ=255) aCCTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGAttt  <  1:1238219/65‑1 (MQ=255) aCCTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGAttt  <  1:1197473/65‑1 (MQ=255)  ccTATAAGTTTGGGGCTACAAATCCGGCGACTGAATGTTTCGCGGCGGACGTTATCCTTGAttt  <  1:619973/64‑1 (MQ=255)        aGTTTGGGGCAACAAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGAttt  <  1:2365095/58‑1 (MQ=255)                         ccGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGAttt  <  1:2187284/41‑1 (MQ=255)                                                                 | ACCTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGATTT  >  W3110S.gb/1432752‑1432816

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑