Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1497711	1497770	60	49 [0]	[0] 9	ydcJ	conserved hypothetical protein

CTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTACGCTGGATATTGACCGGGTGCAGT  >  W3110S.gb/1497646‑1497710                                                                 | cTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTACGCTGGATATTGACCGGGTGCAGt  <  1:1164381/65‑1 (MQ=255) cTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTACGCTGGATATTGACCGGGTGCAGt  <  1:2384605/65‑1 (MQ=255) cTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTACGCTGGATATTGACCGGGTGCAGt  <  1:2434198/65‑1 (MQ=255) cTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTACGCTGGATATTGACCGGGTGCAGt  <  1:2250754/65‑1 (MQ=255) cTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTACGCTGGATATTGACCGGGTGCAGt  <  1:259017/65‑1 (MQ=255) cTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTACGCTGGATATTGACCGGGTGCAGt  <  1:2033835/65‑1 (MQ=255) cTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTACGCTGGATATTGACCGGGTGCAGt  <  1:2020039/65‑1 (MQ=255) cTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTACGCTGGATATTGACCGGGTGCAGt  <  1:1935566/65‑1 (MQ=255) cTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTACGCTGGATATTGACCGGGTGCAGt  <  1:1831899/65‑1 (MQ=255) cTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTACGCTGGATATTGACCGGGTGCAGt  <  1:1804720/65‑1 (MQ=255) cTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTACGCTGGATATTGACCGGGTGCAGt  <  1:1617243/65‑1 (MQ=255) cTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTACGCTGGATATTGACCGGGTGCAGt  <  1:1575618/65‑1 (MQ=255) cTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTACGCTGGATATTGACCGGGTGCAGt  <  1:582794/65‑1 (MQ=255) cTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTACGCTGGATATTGACCGGGTGCAGt  <  1:621877/65‑1 (MQ=255) cTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTACGCTGGATATTGACCGGGTGCAGt  <  1:1174231/65‑1 (MQ=255) cTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTACGCTGGATATTGACCGGGTGCAGt  <  1:911373/65‑1 (MQ=255) cTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTACGCTGGATATTGACCGGGTGCAGt  <  1:649016/65‑1 (MQ=255) cTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTACGCTGGATATTGACCGGGTGCAGt  <  1:147399/65‑1 (MQ=255) cTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTACGCTGGATATTGACCGGGTGCAGt  <  1:1463653/65‑1 (MQ=255) cTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTACGCTGGATATTGACCGGGTGCAGt  <  1:1394872/65‑1 (MQ=255)  tGTTTTCCTGTATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTACGCTGGATATTGACCGGGTGCAGt  <  1:892112/64‑1 (MQ=255)    ttttCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTACGCTGGATATTGACCGGGTGCAGt  <  1:2084175/62‑1 (MQ=255)    ttttCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTACGCTGGATATTGACCGGGTGCAGt  <  1:2462520/62‑1 (MQ=255)    ttttCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTACGCTGGATATTGACCGGGTGCAGt  <  1:2488625/62‑1 (MQ=255)    ttttCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTACGCTGGATATTGACCGGGTGCAGt  <  1:2506784/62‑1 (MQ=255)    ttttCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTACGCTGGATATTGACCGGGTGCAGt  <  1:297836/62‑1 (MQ=255)    ttttCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTACGCTGGATATTGACCGGGTGCAGt  <  1:669262/62‑1 (MQ=255)    ttttCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTACGCTGGATATTGACCGGGTGCAGt  <  1:382847/62‑1 (MQ=255)    ttttCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTACGCTGGATATTGACCGGGTGCAGt  <  1:385856/62‑1 (MQ=255)    ttttCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTACGCTGGATATTGACCGGGTGCAGt  <  1:452229/62‑1 (MQ=255)    ttttCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTACGCTGGATATTGACCGGGTGCAGt  <  1:237192/62‑1 (MQ=255)    ttttCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTACGCTGGATATTGACCGGGTGCAGt  <  1:1207681/62‑1 (MQ=255)    ttttCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTACGCTGGATATTGACCGGGTGCAGt  <  1:1365752/62‑1 (MQ=255)    ttttCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTACGCTGGATATTGACCGGGTGCAGt  <  1:1531682/62‑1 (MQ=255)    ttttCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTACGCTGGATATTGACCGGGTGCAGt  <  1:1546466/62‑1 (MQ=255)    ttttCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTACGCTGGATATTGACCGGGTGCAGt  <  1:1580520/62‑1 (MQ=255)    ttttCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTACGCTGGATATTGACCGGGTGCAGt  <  1:1618884/62‑1 (MQ=255)    ttttCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTACGCTGGATATTGACCGGGTGCAGt  <  1:1761750/62‑1 (MQ=255)    ttttCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTACGCTGGATATTGACCGGGTGCAGt  <  1:185745/62‑1 (MQ=255)    ttttCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTACGCTGGATATTGACCGGGTGCAGt  <  1:2076298/62‑1 (MQ=255)    ttttCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTACGCTGGATATTGACCGGGTGCAGt  <  1:1047364/62‑1 (MQ=255)    ttttCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTACGCTGGATATTGACCGGGTGCAGt  <  1:2135100/62‑1 (MQ=255)    ttttCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTACGCTGGATATTGACCGGGTGCAGt  <  1:223161/62‑1 (MQ=255)    ttttCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTACGCTGGATATTGACCGGGTGCAGt  <  1:2345709/62‑1 (MQ=255)    ttttCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTACGCTGGATATTGACCGGGTGCAGt  <  1:2381729/62‑1 (MQ=255)    ttttCCTGGATGACATATCAACCACCTGACGCCACGTACGCTGGATATTGACCGGGTGCAGt  <  1:1564795/62‑1 (MQ=255)     tttCCTGGATGCCATATGAACCCCCTGACGCCACGTACGCTGGATATTGACCGGGTGCAGt  <  1:998305/61‑1 (MQ=255)     tttCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTACGCTGGATATTGACCGGGTGCAGt  <  1:874027/61‑1 (MQ=255)                ccATATCAACCACCTGACGCCACGTACGCTGGATATTGACCGGGTGCAGt  <  1:1524230/50‑1 (MQ=255)                                                                 | CTGTTTTCCTGGATGCCATATCAACCACCTGACGCCACGTACGCTGGATATTGACCGGGTGCAGT  >  W3110S.gb/1497646‑1497710

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑