Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1519498	1519507	10	43 [0]	[1] 23	ydcY	hypothetical protein

CGAATTATTAATCGCCCTGAGCGATGACGCGGAGTTAAGTCGGGAAGATCGCTACACCCAGCAGC  >  W3110S.gb/1519433‑1519497                                                                 | cGAATTATTAATCGCCCTGGGCGATGACGCGGAGTTAAGTCGGGAAGATCGCTACACCCagcagc  >  1:434606/1‑65 (MQ=255) cGAATTATTAATCGCCCTGAGCGATGACGCGGAGTTAAGTCGGGAAGATCTCTACACCCagaagc  >  1:1644320/1‑65 (MQ=255) cGAATTATTAATCGCCCTGAGCGATGACGCGGAGTTAAGTCGGGAAGATCGCTACACCCagcggc  >  1:1540570/1‑65 (MQ=255) cGAATTATTAATCGCCCTGAGCGATGACGCGGAGTTAAGTCGGGAAGATCGCTACACCCagcagc  >  1:41593/1‑65 (MQ=255) cGAATTATTAATCGCCCTGAGCGATGACGCGGAGTTAAGTCGGGAAGATCGCTACACCCagcagc  >  1:2386588/1‑65 (MQ=255) cGAATTATTAATCGCCCTGAGCGATGACGCGGAGTTAAGTCGGGAAGATCGCTACACCCagcagc  >  1:2429315/1‑65 (MQ=255) cGAATTATTAATCGCCCTGAGCGATGACGCGGAGTTAAGTCGGGAAGATCGCTACACCCagcagc  >  1:2434389/1‑65 (MQ=255) cGAATTATTAATCGCCCTGAGCGATGACGCGGAGTTAAGTCGGGAAGATCGCTACACCCagcagc  >  1:2442733/1‑65 (MQ=255) cGAATTATTAATCGCCCTGAGCGATGACGCGGAGTTAAGTCGGGAAGATCGCTACACCCagcagc  >  1:2480828/1‑65 (MQ=255) cGAATTATTAATCGCCCTGAGCGATGACGCGGAGTTAAGTCGGGAAGATCGCTACACCCagcagc  >  1:2488452/1‑65 (MQ=255) cGAATTATTAATCGCCCTGAGCGATGACGCGGAGTTAAGTCGGGAAGATCGCTACACCCagcagc  >  1:2542762/1‑65 (MQ=255) cGAATTATTAATCGCCCTGAGCGATGACGCGGAGTTAAGTCGGGAAGATCGCTACACCCagcagc  >  1:342541/1‑65 (MQ=255) cGAATTATTAATCGCCCTGAGCGATGACGCGGAGTTAAGTCGGGAAGATCGCTACACCCagcagc  >  1:344899/1‑65 (MQ=255) cGAATTATTAATCGCCCTGAGCGATGACGCGGAGTTAAGTCGGGAAGATCGCTACACCCagcagc  >  1:372088/1‑65 (MQ=255) cGAATTATTAATCGCCCTGAGCGATGACGCGGAGTTAAGTCGGGAAGATCGCTACACCCagcagc  >  1:2047210/1‑65 (MQ=255) cGAATTATTAATCGCCCTGAGCGATGACGCGGAGTTAAGTCGGGAAGATCGCTACACCCagcagc  >  1:45923/1‑65 (MQ=255) cGAATTATTAATCGCCCTGAGCGATGACGCGGAGTTAAGTCGGGAAGATCGCTACACCCagcagc  >  1:606206/1‑65 (MQ=255) cGAATTATTAATCGCCCTGAGCGATGACGCGGAGTTAAGTCGGGAAGATCGCTACACCCagcagc  >  1:606888/1‑65 (MQ=255) cGAATTATTAATCGCCCTGAGCGATGACGCGGAGTTAAGTCGGGAAGATCGCTACACCCagcagc  >  1:625468/1‑65 (MQ=255) cGAATTATTAATCGCCCTGAGCGATGACGCGGAGTTAAGTCGGGAAGATCGCTACACCCagcagc  >  1:768371/1‑65 (MQ=255) cGAATTATTAATCGCCCTGAGCGATGACGCGGAGTTAAGTCGGGAAGATCGCTACACCCagcagc  >  1:842722/1‑65 (MQ=255) cGAATTATTAATCGCCCTGAGCGATGACGCGGAGTTAAGTCGGGAAGATCGCTACACCCagcagc  >  1:854923/1‑65 (MQ=255) cGAATTATTAATCGCCCTGAGCGATGACGCGGAGTTAAGTCGGGAAGATCGCTACACCCagcagc  >  1:896262/1‑65 (MQ=255) cGAATTATTAATCGCCCTGAGCGATGACGCGGAGTTAAGTCGGGAAGATCGCTACACCCagcagc  >  1:1567712/1‑65 (MQ=255) cGAATTATTAATCGCCCTGAGCGATGACGCGGAGTTAAGTCGGGAAGATCGCTACACCCagcagc  >  1:1114119/1‑65 (MQ=255) cGAATTATTAATCGCCCTGAGCGATGACGCGGAGTTAAGTCGGGAAGATCGCTACACCCagcagc  >  1:1146266/1‑65 (MQ=255) cGAATTATTAATCGCCCTGAGCGATGACGCGGAGTTAAGTCGGGAAGATCGCTACACCCagcagc  >  1:1269177/1‑65 (MQ=255) cGAATTATTAATCGCCCTGAGCGATGACGCGGAGTTAAGTCGGGAAGATCGCTACACCCagcagc  >  1:1275468/1‑65 (MQ=255) cGAATTATTAATCGCCCTGAGCGATGACGCGGAGTTAAGTCGGGAAGATCGCTACACCCagcagc  >  1:13797/1‑65 (MQ=255) cGAATTATTAATCGCCCTGAGCGATGACGCGGAGTTAAGTCGGGAAGATCGCTACACCCagcagc  >  1:144809/1‑65 (MQ=255) cGAATTATTAATCGCCCTGAGCGATGACGCGGAGTTAAGTCGGGAAGATCGCTACACCCagcagc  >  1:1493054/1‑65 (MQ=255) cGAATTATTAATCGCCCTGAGCGATGACGCGGAGTTAAGTCGGGAAGATCGCTACACCCagcagc  >  1:1518444/1‑65 (MQ=255) cGAATTATTAATCGCCCTGAGCGATGACGCGGAGTTAAGTCGGGAAGATCGCTACACCCagcagc  >  1:153883/1‑65 (MQ=255) cGAATTATTAATCGCCCTGAGCGATGACGCGGAGTTAAGTCGGGAAGATCGCTACACCCagcagc  >  1:2052378/1‑65 (MQ=255) cGAATTATTAATCGCCCTGAGCGATGACGCGGAGTTAAGTCGGGAAGATCGCTACACCCagcagc  >  1:1649090/1‑65 (MQ=255) cGAATTATTAATCGCCCTGAGCGATGACGCGGAGTTAAGTCGGGAAGATCGCTACACCCagcagc  >  1:1674922/1‑65 (MQ=255) cGAATTATTAATCGCCCTGAGCGATGACGCGGAGTTAAGTCGGGAAGATCGCTACACCCagcagc  >  1:1690795/1‑65 (MQ=255) cGAATTATTAATCGCCCTGAGCGATGACGCGGAGTTAAGTCGGGAAGATCGCTACACCCagcagc  >  1:1699660/1‑65 (MQ=255) cGAATTATTAATCGCCCTGAGCGATGACGCGGAGTTAAGTCGGGAAGATCGCTACACCCagcagc  >  1:1773064/1‑65 (MQ=255) cGAATTATTAATCGCCCTGAGCGATGACGCGGAGTTAAGTCGGGAAGATCGCTACACCCagcagc  >  1:1952070/1‑65 (MQ=255) cGAATTATTAATCGCCCTGAGCGATGACGCGGAGTTAAGTCGGGAAGATCGCTACACCCagcagc  >  1:2033643/1‑65 (MQ=255) cGAATTATTAATCGCCCTGAGCGATGACGCGGAGTTAAGTCGGGAAGATCGCTACACCCagcagc  >  1:10428/1‑65 (MQ=255) cGAATTATTAATCGCCCTGAGCGATAACGCGGAGTTAAGTCGGGAAGATCGCTACACCCagcagc  >  1:1620513/1‑65 (MQ=255)                                                                 | CGAATTATTAATCGCCCTGAGCGATGACGCGGAGTTAAGTCGGGAAGATCGCTACACCCAGCAGC  >  W3110S.gb/1519433‑1519497

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑