Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	1561895	1561937	43	31 [0]	[0] 29	ddpB	D‑Ala‑D‑Ala transporter subunit

CGCCCAGCGCCAAACCCAATACGGTAATCGATGGGATCAACGCATTGGGTAGCGCATAACATAAA  >  W3110S.gb/1561830‑1561894                                                                 | tcgccAGCGCCAAACCCAATACGGTAATCGATGGGATCAACGCATTGGGTAGCGCATAACATaaa  <  1:17828/62‑1 (MQ=255) cGCCCAGCGCCAAACCCAATACGGTAATCGATGGGATCAACGCATTGGGTAGCGCGTAACATaaa  <  1:946860/65‑1 (MQ=255) cGCCCAGCGCCAAACCCAATACGGTAATCGATGGGATCAACGCATTGGGTAGCGCATAACATcaa  <  1:324804/65‑1 (MQ=255) cGCCCAGCGCCAAACCCAATACGGTAATCGATGGGATCAACGCATTGGGTAGCGCATAACATaaa  <  1:2281405/65‑1 (MQ=255) cGCCCAGCGCCAAACCCAATACGGTAATCGATGGGATCAACGCATTGGGTAGCGCATAACATaaa  <  1:981113/65‑1 (MQ=255) cGCCCAGCGCCAAACCCAATACGGTAATCGATGGGATCAACGCATTGGGTAGCGCATAACATaaa  <  1:7829/65‑1 (MQ=255) cGCCCAGCGCCAAACCCAATACGGTAATCGATGGGATCAACGCATTGGGTAGCGCATAACATaaa  <  1:757331/65‑1 (MQ=255) cGCCCAGCGCCAAACCCAATACGGTAATCGATGGGATCAACGCATTGGGTAGCGCATAACATaaa  <  1:54203/65‑1 (MQ=255) cGCCCAGCGCCAAACCCAATACGGTAATCGATGGGATCAACGCATTGGGTAGCGCATAACATaaa  <  1:535050/65‑1 (MQ=255) cGCCCAGCGCCAAACCCAATACGGTAATCGATGGGATCAACGCATTGGGTAGCGCATAACATaaa  <  1:466532/65‑1 (MQ=255) cGCCCAGCGCCAAACCCAATACGGTAATCGATGGGATCAACGCATTGGGTAGCGCATAACATaaa  <  1:287438/65‑1 (MQ=255) cGCCCAGCGCCAAACCCAATACGGTAATCGATGGGATCAACGCATTGGGTAGCGCATAACATaaa  <  1:265997/65‑1 (MQ=255) cGCCCAGCGCCAAACCCAATACGGTAATCGATGGGATCAACGCATTGGGTAGCGCATAACATaaa  <  1:2410689/65‑1 (MQ=255) cGCCCAGCGCCAAACCCAATACGGTAATCGATGGGATCAACGCATTGGGTAGCGCATAACATaaa  <  1:2363917/65‑1 (MQ=255) cGCCCAGCGCCAAACCCAATACGGTAATCGATGGGATCAACGCATTGGGTAGCGCATAACATaaa  <  1:2358086/65‑1 (MQ=255) cGCCCAGCGCCAAACCCAATACGGTAATCGATGGGATCAACGCATTGGGTAGCGCATAACATaaa  <  1:114218/65‑1 (MQ=255) cGCCCAGCGCCAAACCCAATACGGTAATCGATGGGATCAACGCATTGGGTAGCGCATAACATaaa  <  1:209894/65‑1 (MQ=255) cGCCCAGCGCCAAACCCAATACGGTAATCGATGGGATCAACGCATTGGGTAGCGCATAACATaaa  <  1:2087190/65‑1 (MQ=255) cGCCCAGCGCCAAACCCAATACGGTAATCGATGGGATCAACGCATTGGGTAGCGCATAACATaaa  <  1:1981271/65‑1 (MQ=255) cGCCCAGCGCCAAACCCAATACGGTAATCGATGGGATCAACGCATTGGGTAGCGCATAACATaaa  <  1:194798/65‑1 (MQ=255) cGCCCAGCGCCAAACCCAATACGGTAATCGATGGGATCAACGCATTGGGTAGCGCATAACATaaa  <  1:192972/65‑1 (MQ=255) cGCCCAGCGCCAAACCCAATACGGTAATCGATGGGATCAACGCATTGGGTAGCGCATAACATaaa  <  1:178438/65‑1 (MQ=255) cGCCCAGCGCCAAACCCAATACGGTAATCGATGGGATCAACGCATTGGGTAGCGCATAACATaaa  <  1:1743261/65‑1 (MQ=255) cGCCCAGCGCCAAACCCAATACGGTAATCGATGGGATCAACGCATTGGGTAGCGCATAACATaaa  <  1:1387494/65‑1 (MQ=255) cGCCCAGCGCCAAACCCAATACGGTAATCGATGGGATCAACGCATTGGGTAGCGCATAACATaaa  <  1:1372665/65‑1 (MQ=255) cGCCCAGCGCCAAACCCAATACGGTAATCGATGGGATCAACGCATTGGGTAGCGCATAACATaaa  <  1:1310299/65‑1 (MQ=255) cGCCCAGCGCCAAACCCAATACGGTAATCGATGGGATCAACGCATTGGGTAGCGCATAACATaaa  <  1:1277328/65‑1 (MQ=255) cGCCCAGCGCCAAACCCAATACGGTAATCGATGGGATCAACGCATTGGGTAGCGCATAACATaaa  <  1:1184879/65‑1 (MQ=255)  gCCCAGCGCCAAACCCAATACGGTAATCGATGGGATCAACGCATTGGGTAGCGCATAACATaaa  <  1:121254/64‑1 (MQ=255)                ccAATACGGTAATCGATGGGATCAACGCATTGGGTAGCGCATAACATaaa  <  1:770244/50‑1 (MQ=255)                            tCGATGGGATCAACGCATTGGGTAGCGCATAACATaaa  <  1:2351129/38‑1 (MQ=255)                                                                 | CGCCCAGCGCCAAACCCAATACGGTAATCGATGGGATCAACGCATTGGGTAGCGCATAACATAAA  >  W3110S.gb/1561830‑1561894

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑