Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	59912	59961	50	19 [0]	[0] 15	rluA	pseudouridine synthase for 23S rRNA (position 746) and tRNAphe(position 32)

TGCACACGCAATTGATGCGAACGCCCGGTAATCGGTTTTAACACCACTCTTGCCGTGTTATCCGC  >  W3110S.gb/59847‑59911                                                                 | tGCACACGCAATTGATGCGAACGCCCGGTAATCGGTTTTAACACCACTCTTGCCGTGTTATccgc  <  1:2191404/65‑1 (MQ=255) tGCACACGCAATTGATGCGAACGCCCGGTAATCGGTTTTAACACCACTCTTGCCGTGTTATccgc  <  1:83623/65‑1 (MQ=255) tGCACACGCAATTGATGCGAACGCCCGGTAATCGGTTTTAACACCACTCTTGCCGTGTTATccgc  <  1:834354/65‑1 (MQ=255) tGCACACGCAATTGATGCGAACGCCCGGTAATCGGTTTTAACACCACTCTTGCCGTGTTATccgc  <  1:79242/65‑1 (MQ=255) tGCACACGCAATTGATGCGAACGCCCGGTAATCGGTTTTAACACCACTCTTGCCGTGTTATccgc  <  1:682727/65‑1 (MQ=255) tGCACACGCAATTGATGCGAACGCCCGGTAATCGGTTTTAACACCACTCTTGCCGTGTTATccgc  <  1:682352/65‑1 (MQ=255) tGCACACGCAATTGATGCGAACGCCCGGTAATCGGTTTTAACACCACTCTTGCCGTGTTATccgc  <  1:642228/65‑1 (MQ=255) tGCACACGCAATTGATGCGAACGCCCGGTAATCGGTTTTAACACCACTCTTGCCGTGTTATccgc  <  1:586229/65‑1 (MQ=255) tGCACACGCAATTGATGCGAACGCCCGGTAATCGGTTTTAACACCACTCTTGCCGTGTTATccgc  <  1:227041/65‑1 (MQ=255) tGCACACGCAATTGATGCGAACGCCCGGTAATCGGTTTTAACACCACTCTTGCCGTGTTATccgc  <  1:2206273/65‑1 (MQ=255) tGCACACGCAATTGATGCGAACGCCCGGTAATCGGTTTTAACACCACTCTTGCCGTGTTATccgc  <  1:1364853/65‑1 (MQ=255) tGCACACGCAATTGATGCGAACGCCCGGTAATCGGTTTTAACACCACTCTTGCCGTGTTATccgc  <  1:2092746/65‑1 (MQ=255) tGCACACGCAATTGATGCGAACGCCCGGTAATCGGTTTTAACACCACTCTTGCCGTGTTATccgc  <  1:1922189/65‑1 (MQ=255) tGCACACGCAATTGATGCGAACGCCCGGTAATCGGTTTTAACACCACTCTTGCCGTGTTATccgc  <  1:1845377/65‑1 (MQ=255) tGCACACGCAATTGATGCGAACGCCCGGTAATCGGTTTTAACACCACTCTTGCCGTGTTATccgc  <  1:1724788/65‑1 (MQ=255) tGCACACGCAATTGATGCGAACGCCCGGTAATCGGTTTTAACACCACTCTTGCCGTGTTATccgc  <  1:1648812/65‑1 (MQ=255) tGCACACGCAATTGATGCGAACGCCCGGTAATCGGTTTTAACACCACTCTTGCCGTGTTATccgc  <  1:161392/65‑1 (MQ=255) tGCACACGCAATTGATGCGAACGCCCGGTAATCGGTTTTAACACCACTCTTGCCGTGTTATccgc  <  1:1542330/65‑1 (MQ=255)                       gCCCGGTAATCGGTTTTAACACCACTCTTGCCGTGTTATccgc  <  1:1476908/43‑1 (MQ=255)                                                                 | TGCACACGCAATTGATGCGAACGCCCGGTAATCGGTTTTAACACCACTCTTGCCGTGTTATCCGC  >  W3110S.gb/59847‑59911

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑