Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1578643	1578668	26	30 [0]	[2] 30	yddB	predicted porin protein

CGCGCGGGTGATATCAGACTGGCGGCGCGATAAACCGGCGGTAACGCCGAAGTTATCAGCGAGTT  >  W3110S.gb/1578578‑1578642                                                                 | cgcgcgGGTGATATCAGACTGGCGGCGCGATAAACCGGCGGTAACGCCTAAGTTATCAGCGAGtt  <  1:956538/65‑1 (MQ=255) cgcgcgGGTGATATCAGACTGGCGGCGCGATAAACCGGCGGTAACGCCGAAGTTATCAGCGAGtt  <  1:2359075/65‑1 (MQ=255) cgcgcgGGTGATATCAGACTGGCGGCGCGATAAACCGGCGGTAACGCCGAAGTTATCAGCGAGtt  <  1:984061/65‑1 (MQ=255) cgcgcgGGTGATATCAGACTGGCGGCGCGATAAACCGGCGGTAACGCCGAAGTTATCAGCGAGtt  <  1:882534/65‑1 (MQ=255) cgcgcgGGTGATATCAGACTGGCGGCGCGATAAACCGGCGGTAACGCCGAAGTTATCAGCGAGtt  <  1:852134/65‑1 (MQ=255) cgcgcgGGTGATATCAGACTGGCGGCGCGATAAACCGGCGGTAACGCCGAAGTTATCAGCGAGtt  <  1:827608/65‑1 (MQ=255) cgcgcgGGTGATATCAGACTGGCGGCGCGATAAACCGGCGGTAACGCCGAAGTTATCAGCGAGtt  <  1:78211/65‑1 (MQ=255) cgcgcgGGTGATATCAGACTGGCGGCGCGATAAACCGGCGGTAACGCCGAAGTTATCAGCGAGtt  <  1:647282/65‑1 (MQ=255) cgcgcgGGTGATATCAGACTGGCGGCGCGATAAACCGGCGGTAACGCCGAAGTTATCAGCGAGtt  <  1:64669/65‑1 (MQ=255) cgcgcgGGTGATATCAGACTGGCGGCGCGATAAACCGGCGGTAACGCCGAAGTTATCAGCGAGtt  <  1:463783/65‑1 (MQ=255) cgcgcgGGTGATATCAGACTGGCGGCGCGATAAACCGGCGGTAACGCCGAAGTTATCAGCGAGtt  <  1:2526798/65‑1 (MQ=255) cgcgcgGGTGATATCAGACTGGCGGCGCGATAAACCGGCGGTAACGCCGAAGTTATCAGCGAGtt  <  1:2451129/65‑1 (MQ=255) cgcgcgGGTGATATCAGACTGGCGGCGCGATAAACCGGCGGTAACGCCGAAGTTATCAGCGAGtt  <  1:2406625/65‑1 (MQ=255) cgcgcgGGTGATATCAGACTGGCGGCGCGATAAACCGGCGGTAACGCCGAAGTTATCAGCGAGtt  <  1:2404652/65‑1 (MQ=255) cgcgcgGGTGATATCAGACTGGCGGCGCGATAAACCGGCGGTAACGCCGAAGTTATCAGCGAGtt  <  1:10206/65‑1 (MQ=255) cgcgcgGGTGATATCAGACTGGCGGCGCGATAAACCGGCGGTAACGCCGAAGTTATCAGCGAGtt  <  1:2221346/65‑1 (MQ=255) cgcgcgGGTGATATCAGACTGGCGGCGCGATAAACCGGCGGTAACGCCGAAGTTATCAGCGAGtt  <  1:2096633/65‑1 (MQ=255) cgcgcgGGTGATATCAGACTGGCGGCGCGATAAACCGGCGGTAACGCCGAAGTTATCAGCGAGtt  <  1:2021348/65‑1 (MQ=255) cgcgcgGGTGATATCAGACTGGCGGCGCGATAAACCGGCGGTAACGCCGAAGTTATCAGCGAGtt  <  1:1912027/65‑1 (MQ=255) cgcgcgGGTGATATCAGACTGGCGGCGCGATAAACCGGCGGTAACGCCGAAGTTATCAGCGAGtt  <  1:182484/65‑1 (MQ=255) cgcgcgGGTGATATCAGACTGGCGGCGCGATAAACCGGCGGTAACGCCGAAGTTATCAGCGAGtt  <  1:18152/65‑1 (MQ=255) cgcgcgGGTGATATCAGACTGGCGGCGCGATAAACCGGCGGTAACGCCGAAGTTATCAGCGAGtt  <  1:1718953/65‑1 (MQ=255) cgcgcgGGTGATATCAGACTGGCGGCGCGATAAACCGGCGGTAACGCCGAAGTTATCAGCGAGtt  <  1:1709817/65‑1 (MQ=255) cgcgcgGGTGATATCAGACTGGCGGCGCGATAAACCGGCGGTAACGCCGAAGTTATCAGCGAGtt  <  1:1708968/65‑1 (MQ=255) cgcgcgGGTGATATCAGACTGGCGGCGCGATAAACCGGCGGTAACGCCGAAGTTATCAGCGAGtt  <  1:1507852/65‑1 (MQ=255) cgcgcgGGTGATATCAGACTGGCGGCGCGATAAACCGGCGGTAACGCCGAAGTTATCAGCGAGtt  <  1:1459133/65‑1 (MQ=255) cgcgcgGGTGATATCAGACTGGCGGCGCGATAAACCGGCGGTAACGCCGAAGTTATCAGCGAGtt  <  1:1274443/65‑1 (MQ=255) cgcgcgGGTGATATCAGACTGGCGGCGCGATAAACCGGCGGTAACGCCGAAGTTATCAGCGAGtt  <  1:1252360/65‑1 (MQ=255) cgcgcgGGTGATATCAGACTGGCGGCGCGATAAACCGGCGGTAACGCCGAAGTTATCAGCGAGtt  <  1:1120429/65‑1 (MQ=255)    gcgGGTGATATCAGACTGGCGGCGCGATAAACCGGCGGTAACGCCGAAGTTATCAGCGAGtt  <  1:453963/62‑1 (MQ=255)                                                                 | CGCGCGGGTGATATCAGACTGGCGGCGCGATAAACCGGCGGTAACGCCGAAGTTATCAGCGAGTT  >  W3110S.gb/1578578‑1578642

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑