Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1592321	1592323	3	35 [0]	[0] 22	yneL/hipA	predicted transcriptional regulator/regulator with hipB

CTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACA  >  W3110S.gb/1592256‑1592320                                                                 | ctcgATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCgaca  >  1:88674/4‑65 (MQ=255) cTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACATCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCgaca  >  1:2389184/1‑65 (MQ=255) cTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCgaca  >  1:64780/1‑65 (MQ=255) cTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCgaca  >  1:2294222/1‑65 (MQ=255) cTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCgaca  >  1:2341434/1‑65 (MQ=255) cTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCgaca  >  1:2404908/1‑65 (MQ=255) cTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCgaca  >  1:2412227/1‑65 (MQ=255) cTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCgaca  >  1:480321/1‑65 (MQ=255) cTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCgaca  >  1:584415/1‑65 (MQ=255) cTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCgaca  >  1:604788/1‑65 (MQ=255) cTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCgaca  >  1:2280753/1‑65 (MQ=255) cTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCgaca  >  1:67838/1‑65 (MQ=255) cTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCgaca  >  1:890571/1‑65 (MQ=255) cTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCgaca  >  1:909454/1‑65 (MQ=255) cTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCgaca  >  1:910485/1‑65 (MQ=255) cTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCgaca  >  1:925047/1‑65 (MQ=255) cTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCgaca  >  1:949934/1‑65 (MQ=255) cTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCgaca  >  1:998912/1‑65 (MQ=255) cTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCgaca  >  1:1856877/1‑65 (MQ=255) cTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCgaca  >  1:1234975/1‑65 (MQ=255) cTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCgaca  >  1:1322169/1‑65 (MQ=255) cTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCgaca  >  1:1353468/1‑65 (MQ=255) cTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCgaca  >  1:1553180/1‑65 (MQ=255) cTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCgaca  >  1:1643705/1‑65 (MQ=255) cTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCgaca  >  1:1731822/1‑65 (MQ=255) cTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCgaca  >  1:176141/1‑65 (MQ=255) cTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCgaca  >  1:177281/1‑65 (MQ=255) cTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCgaca  >  1:1106999/1‑65 (MQ=255) cTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCgaca  >  1:1895680/1‑65 (MQ=255) cTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCgaca  >  1:1916303/1‑65 (MQ=255) cTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCgaca  >  1:1938321/1‑65 (MQ=255) cTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCgaca  >  1:2009100/1‑65 (MQ=255) cTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCgaca  >  1:2011997/1‑65 (MQ=255) cTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCgaca  >  1:2150990/1‑65 (MQ=255) cTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCgaca  >  1:2196231/1‑65 (MQ=255)                                                                 | CTTGATCCGTCCTTAAATAAGTAACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACA  >  W3110S.gb/1592256‑1592320

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑