Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	1605244	1605262	19	37 [0]	[0] 25	lsrC	AI2 transporter

ACAGCTCTCCGCCCCGCTGCTGCTTGGCGTTTCAGCAATTGGTTGGTTGACGATAATTCTGGTGG  >  W3110S.gb/1605179‑1605243                                                                 | aCAGCTCTCCGCCCCGCTGCTGCTTGGCGTTTCAGCAATTGGTTGGTTGACGATAATTCtggtgg  <  1:329161/65‑1 (MQ=255) aCAGCTCTCCGCCCCGCTGCTGCTTGGCGTTTCAGCAATTGGTTGGTTGACGATAATTCtggtgg  <  1:1080911/65‑1 (MQ=255) aCAGCTCTCCGCCCCGCTGCTGCTTGGCGTTTCAGCAATTGGTTGGTTGACGATAATTCtggtgg  <  1:2038778/65‑1 (MQ=255) aCAGCTCTCCGCCCCGCTGCTGCTTGGCGTTTCAGCAATTGGTTGGTTGACGATAATTCtggtgg  <  1:2069988/65‑1 (MQ=255) aCAGCTCTCCGCCCCGCTGCTGCTTGGCGTTTCAGCAATTGGTTGGTTGACGATAATTCtggtgg  <  1:2130104/65‑1 (MQ=255) aCAGCTCTCCGCCCCGCTGCTGCTTGGCGTTTCAGCAATTGGTTGGTTGACGATAATTCtggtgg  <  1:2146740/65‑1 (MQ=255) aCAGCTCTCCGCCCCGCTGCTGCTTGGCGTTTCAGCAATTGGTTGGTTGACGATAATTCtggtgg  <  1:2210179/65‑1 (MQ=255) aCAGCTCTCCGCCCCGCTGCTGCTTGGCGTTTCAGCAATTGGTTGGTTGACGATAATTCtggtgg  <  1:245804/65‑1 (MQ=255) aCAGCTCTCCGCCCCGCTGCTGCTTGGCGTTTCAGCAATTGGTTGGTTGACGATAATTCtggtgg  <  1:2516002/65‑1 (MQ=255) aCAGCTCTCCGCCCCGCTGCTGCTTGGCGTTTCAGCAATTGGTTGGTTGACGATAATTCtggtgg  <  1:203630/65‑1 (MQ=255) aCAGCTCTCCGCCCCGCTGCTGCTTGGCGTTTCAGCAATTGGTTGGTTGACGATAATTCtggtgg  <  1:386483/65‑1 (MQ=255) aCAGCTCTCCGCCCCGCTGCTGCTTGGCGTTTCAGCAATTGGTTGGTTGACGATAATTCtggtgg  <  1:434623/65‑1 (MQ=255) aCAGCTCTCCGCCCCGCTGCTGCTTGGCGTTTCAGCAATTGGTTGGTTGACGATAATTCtggtgg  <  1:53104/65‑1 (MQ=255) aCAGCTCTCCGCCCCGCTGCTGCTTGGCGTTTCAGCAATTGGTTGGTTGACGATAATTCtggtgg  <  1:585076/65‑1 (MQ=255) aCAGCTCTCCGCCCCGCTGCTGCTTGGCGTTTCAGCAATTGGTTGGTTGACGATAATTCtggtgg  <  1:590774/65‑1 (MQ=255) aCAGCTCTCCGCCCCGCTGCTGCTTGGCGTTTCAGCAATTGGTTGGTTGACGATAATTCtggtgg  <  1:774627/65‑1 (MQ=255) aCAGCTCTCCGCCCCGCTGCTGCTTGGCGTTTCAGCAATTGGTTGGTTGACGATAATTCtggtgg  <  1:798186/65‑1 (MQ=255) aCAGCTCTCCGCCCCGCTGCTGCTTGGCGTTTCAGCAATTGGTTGGTTGACGATAATTCtggtgg  <  1:875897/65‑1 (MQ=255) aCAGCTCTCCGCCCCGCTGCTGCTTGGCGTTTCAGCAATTGGTTGGTTGACGATAATTCtggtgg  <  1:1616309/65‑1 (MQ=255) aCAGCTCTCCGCCCCGCTGCTGCTTGGCGTTTCAGCAATTGGTTGGTTGACGATAATTCtggtgg  <  1:1089450/65‑1 (MQ=255) aCAGCTCTCCGCCCCGCTGCTGCTTGGCGTTTCAGCAATTGGTTGGTTGACGATAATTCtggtgg  <  1:1219484/65‑1 (MQ=255) aCAGCTCTCCGCCCCGCTGCTGCTTGGCGTTTCAGCAATTGGTTGGTTGACGATAATTCtggtgg  <  1:1337262/65‑1 (MQ=255) aCAGCTCTCCGCCCCGCTGCTGCTTGGCGTTTCAGCAATTGGTTGGTTGACGATAATTCtggtgg  <  1:1338029/65‑1 (MQ=255) aCAGCTCTCCGCCCCGCTGCTGCTTGGCGTTTCAGCAATTGGTTGGTTGACGATAATTCtggtgg  <  1:1372476/65‑1 (MQ=255) aCAGCTCTCCGCCCCGCTGCTGCTTGGCGTTTCAGCAATTGGTTGGTTGACGATAATTCtggtgg  <  1:1399269/65‑1 (MQ=255) aCAGCTCTCCGCCCCGCTGCTGCTTGGCGTTTCAGCAATTGGTTGGTTGACGATAATTCtggtgg  <  1:1406339/65‑1 (MQ=255) aCAGCTCTCCGCCCCGCTGCTGCTTGGCGTTTCAGCAATTGGTTGGTTGACGATAATTCtggtgg  <  1:1554164/65‑1 (MQ=255) aCAGCTCTCCGCCCCGCTGCTGCTTGGCGTTTCAGCAATTGGTTGGTTGACGATAATTCtggtgg  <  1:2012694/65‑1 (MQ=255) aCAGCTCTCCGCCCCGCTGCTGCTTGGCGTTTCAGCAATTGGTTGGTTGACGATAATTCtggtgg  <  1:1666210/65‑1 (MQ=255) aCAGCTCTCCGCCCCGCTGCTGCTTGGCGTTTCAGCAATTGGTTGGTTGACGATAATTCtggtgg  <  1:1771425/65‑1 (MQ=255) aCAGCTCTCCGCCCCGCTGCTGCTTGGCGTTTCAGCAATTGGTTGGTTGACGATAATTCtggtgg  <  1:1796412/65‑1 (MQ=255) aCAGCTCTCCGCCCCGCTGCTGCTTGGCGTTTCAGCAATTGGTTGGTTGACGATAATTCtggtgg  <  1:1947488/65‑1 (MQ=255) aCAGCTCTCCGCCCCGCTGCTGCTTGGCGTTTCAGCAATTGGTTGGTTGACGATAATTCtggtgg  <  1:1999184/65‑1 (MQ=255) aCAGCTCTCCGCCCCGCTGCTGCTTGGCGTTTCAGCAATTGGTTGGTTGACGATAATTCtggtgg  <  1:1999535/65‑1 (MQ=255)  cAGCTCTCCGCCCCGCTGCTGCTTGGCGTTTCAGCAATTGGTTGGTTGACGATAATTCtggtgg  <  1:250313/64‑1 (MQ=255)  cAGCTCTCCGCCCCGCTGCTGCTTGGCGTTTCAGCAATTGGTTGGTTGACGATAATTCtggtgg  <  1:225727/64‑1 (MQ=255)       ctcCGCCCCGCTGCTGCTTGGCGTTTCAGCAATTGGTTGGTTGACGATAATTCtggtgg  <  1:1614772/59‑1 (MQ=255)                                                                 | ACAGCTCTCCGCCCCGCTGCTGCTTGGCGTTTCAGCAATTGGTTGGTTGACGATAATTCTGGTGG  >  W3110S.gb/1605179‑1605243

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑