Missing coverage evidence...
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TCCTCAGGTTCGTAAGCTGTGAAGACAGCGACCTCCGTCTGGCCGGTTCGGATTCGTACCTCGCAG  >  W3110S.gb/1646837‑1646902                                                                  | tcctcAGGTTCGTAAGCTGTGAAGACA‑‑GACCTCCGTCTGGCCGGTTCGGATTCGTACCTCGCag  <  1:1475063/64‑1 (MQ=37)  cctcAGGTTCGTAAGCTGTGAAGACAGCGACCTCCGTCTGGCCGGTTCGGATTCGTACCTCGCag  <  1:234975/65‑1 (MQ=255)  cctcAGGTTCGTAAGCTGTGAAGACAGCGACCTCCGTCTGGCCGGTTCGGATTCGTACCTCGCag  <  1:987509/65‑1 (MQ=255)  cctcAGGTTCGTAAGCTGTGAAGACAGCGACCTCCGTCTGGCCGGTTCGGATTCGTACCTCGCag  <  1:872332/65‑1 (MQ=255)  cctcAGGTTCGTAAGCTGTGAAGACAGCGACCTCCGTCTGGCCGGTTCGGATTCGTACCTCGCag  <  1:846653/65‑1 (MQ=255)  cctcAGGTTCGTAAGCTGTGAAGACAGCGACCTCCGTCTGGCCGGTTCGGATTCGTACCTCGCag  <  1:275185/65‑1 (MQ=255)  cctcAGGTTCGTAAGCTGTGAAGACAGCGACCTCCGTCTGGCCGGTTCGGATTCGTACCTCGCag  <  1:260594/65‑1 (MQ=255)  cctcAGGTTCGTAAGCTGTGAAGACAGCGACCTCCGTCTGGCCGGTTCGGATTCGTACCTCGCag  <  1:2400384/65‑1 (MQ=255)  cctcAGGTTCGTAAGCTGTGAAGACAGCGACCTCCGTCTGGCCGGTTCGGATTCGTACCTCGCag  <  1:2391477/65‑1 (MQ=255)  cctcAGGTTCGTAAGCTGTGAAGACAGCGACCTCCGTCTGGCCGGTTCGGATTCGTACCTCGCag  <  1:2388628/65‑1 (MQ=255)  cctcAGGTTCGTAAGCTGTGAAGACAGCGACCTCCGTCTGGCCGGTTCGGATTCGTACCTCGCag  <  1:2350591/65‑1 (MQ=255)  cctcAGGTTCGTAAGCTGTGAAGACAGCGACCTCCGTCTGGCCGGTTCGGATTCGTACCTCGCag  <  1:1025864/65‑1 (MQ=255)  cctcAGGTTCGTAAGCTGTGAAGACAGCGACCTCCGTCTGGCCGGTTCGGATTCGTACCTCGCag  <  1:2273200/65‑1 (MQ=255)  cctcAGGTTCGTAAGCTGTGAAGACAGCGACCTCCGTCTGGCCGGTTCGGATTCGTACCTCGCag  <  1:2120372/65‑1 (MQ=255)  cctcAGGTTCGTAAGCTGTGAAGACAGCGACCTCCGTCTGGCCGGTTCGGATTCGTACCTCGCag  <  1:2094122/65‑1 (MQ=255)  cctcAGGTTCGTAAGCTGTGAAGACAGCGACCTCCGTCTGGCCGGTTCGGATTCGTACCTCGCag  <  1:1830373/65‑1 (MQ=255)  cctcAGGTTCGTAAGCTGTGAAGACAGCGACCTCCGTCTGGCCGGTTCGGATTCGTACCTCGCag  <  1:1797967/65‑1 (MQ=255)  cctcAGGTTCGTAAGCTGTGAAGACAGCGACCTCCGTCTGGCCGGTTCGGATTCGTACCTCGCag  <  1:1537256/65‑1 (MQ=255)  cctcAGGTTCGTAAGCTGTGAAGACAGCGACCTCCGTCTGGCCGGTTCGGATTCGTACCTCGCag  <  1:1431378/65‑1 (MQ=255)  cctcAGGTTCGTAAGCTGTGAAGACAGCGACCTCCGTCTGGCCGGTTCGGATTCGTACCTCGCag  <  1:1280140/65‑1 (MQ=255)  cctcAGGTTCGTAAGCTGTGAAGACAGCGACCTCCGTCTGGCCGGTTCGGATTCGTACCTCGCag  <  1:1235518/65‑1 (MQ=255)   ctcAGGTTCGTAAGCAGTGAAGACAGCGACCTCCGGCTGGCCGGATCGGAGTCGTACCTCGCag  <  1:548019/64‑1 (MQ=255)                                                                  | TCCTCAGGTTCGTAAGCTGTGAAGACAGCGACCTCCGTCTGGCCGGTTCGGATTCGTACCTCGCAG  >  W3110S.gb/1646837‑1646902

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑