Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1678105	1678107	3	31 [0]	[0] 33	pntA	pyridine nucleotide transhydrogenase, alpha subunit

ACAATGTATGCAGCTGTAACTAATCCTCCAGACATATGTTACCCCTTAATTTTTGCGGAACATTT  >  W3110S.gb/1678040‑1678104                                                                 | acaaTGTATGCAGCTTTAACTAATCCTCCAGACATATGTTACCCCTTAATTTTTGCGGAACAttt  <  1:2165022/65‑1 (MQ=255) acaaTGTATGCAGCTGTAACTAATCCTCCAGACATATGTTACCCCTTAATTTTTGCGGAACAttt  <  1:1994640/65‑1 (MQ=255) acaaTGTATGCAGCTGTAACTAATCCTCCAGACATATGTTACCCCTTAATTTTTGCGGAACAttt  <  1:987612/65‑1 (MQ=255) acaaTGTATGCAGCTGTAACTAATCCTCCAGACATATGTTACCCCTTAATTTTTGCGGAACAttt  <  1:939420/65‑1 (MQ=255) acaaTGTATGCAGCTGTAACTAATCCTCCAGACATATGTTACCCCTTAATTTTTGCGGAACAttt  <  1:832529/65‑1 (MQ=255) acaaTGTATGCAGCTGTAACTAATCCTCCAGACATATGTTACCCCTTAATTTTTGCGGAACAttt  <  1:81208/65‑1 (MQ=255) acaaTGTATGCAGCTGTAACTAATCCTCCAGACATATGTTACCCCTTAATTTTTGCGGAACAttt  <  1:795510/65‑1 (MQ=255) acaaTGTATGCAGCTGTAACTAATCCTCCAGACATATGTTACCCCTTAATTTTTGCGGAACAttt  <  1:72310/65‑1 (MQ=255) acaaTGTATGCAGCTGTAACTAATCCTCCAGACATATGTTACCCCTTAATTTTTGCGGAACAttt  <  1:61108/65‑1 (MQ=255) acaaTGTATGCAGCTGTAACTAATCCTCCAGACATATGTTACCCCTTAATTTTTGCGGAACAttt  <  1:447512/65‑1 (MQ=255) acaaTGTATGCAGCTGTAACTAATCCTCCAGACATATGTTACCCCTTAATTTTTGCGGAACAttt  <  1:406765/65‑1 (MQ=255) acaaTGTATGCAGCTGTAACTAATCCTCCAGACATATGTTACCCCTTAATTTTTGCGGAACAttt  <  1:340008/65‑1 (MQ=255) acaaTGTATGCAGCTGTAACTAATCCTCCAGACATATGTTACCCCTTAATTTTTGCGGAACAttt  <  1:2456037/65‑1 (MQ=255) acaaTGTATGCAGCTGTAACTAATCCTCCAGACATATGTTACCCCTTAATTTTTGCGGAACAttt  <  1:2253035/65‑1 (MQ=255) acaaTGTATGCAGCTGTAACTAATCCTCCAGACATATGTTACCCCTTAATTTTTGCGGAACAttt  <  1:1014573/65‑1 (MQ=255) acaaTGTATGCAGCTGTAACTAATCCTCCAGACATATGTTACCCCTTAATTTTTGCGGAACAttt  <  1:1917671/65‑1 (MQ=255) acaaTGTATGCAGCTGTAACTAATCCTCCAGACATATGTTACCCCTTAATTTTTGCGGAACAttt  <  1:1615312/65‑1 (MQ=255) acaaTGTATGCAGCTGTAACTAATCCTCCAGACATATGTTACCCCTTAATTTTTGCGGAACAttt  <  1:1581501/65‑1 (MQ=255) acaaTGTATGCAGCTGTAACTAATCCTCCAGACATATGTTACCCCTTAATTTTTGCGGAACAttt  <  1:1556906/65‑1 (MQ=255) acaaTGTATGCAGCTGTAACTAATCCTCCAGACATATGTTACCCCTTAATTTTTGCGGAACAttt  <  1:1539449/65‑1 (MQ=255) acaaTGTATGCAGCTGTAACTAATCCTCCAGACATATGTTACCCCTTAATTTTTGCGGAACAttt  <  1:1434566/65‑1 (MQ=255) acaaTGTATGCAGCTGTAACTAATCCTCCAGACATATGTTACCCCTTAATTTTTGCGGAACAttt  <  1:1405704/65‑1 (MQ=255) acaaTGTATGCAGCTGTAACTAATCCTCCAGACATATGTTACCCCTTAATTTTTGCGGAACAttt  <  1:1346299/65‑1 (MQ=255) acaaTGTATGCAGCTGTAACTAATCCTCCAGACATATGTTACCCCTTAATTTTTGCGGAACAttt  <  1:1129906/65‑1 (MQ=255) acaaTGTATGCAGCTGTAACTAATCCTCCAGACATATGTTACCCCTTAATTTTTGCGGAACAttt  <  1:1091564/65‑1 (MQ=255) acaaTGTATGCAGCTGTAACTAATCCTCCAGACATATGTTACCCCTTAATTTTTGCGGAACAttt  <  1:1080912/65‑1 (MQ=255) acaaTGTATGCAGCTGTAACTAATCCTCCAGACATATGTTACCCCTTAATTTTTGCGGAACAttt  <  1:1042869/65‑1 (MQ=255)  caaTGTATGCAGCTGTAACTAATCCTCCAGACATATGTTACCCCTTAATTTTTGCGGAACAttt  <  1:1987797/64‑1 (MQ=255)   aaTGTATGCAGCTGTAACTAATCCTCCAGACATATGTTACCCCTTAATTTTTGCGGAACAttt  <  1:664412/63‑1 (MQ=255)                      aaTCCTCCAGACATATGTTACCCCTTAATTTTTGCGGAACAttt  <  1:46580/44‑1 (MQ=255)                               gACATATGTTACCCCTTAATTTTTGCGGAACAttt  <  1:1577398/35‑1 (MQ=255)                                                                 | ACAATGTATGCAGCTGTAACTAATCCTCCAGACATATGTTACCCCTTAATTTTTGCGGAACATTT  >  W3110S.gb/1678040‑1678104

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑