Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1684394	1684433	40	41 [0]	[0] 7	rstA	DNA‑bindng response regulator in two‑component regulatory system with RstB

GTCACCCTGGCTAACACTGAAATCTCGCTCTCGACAGCTGATTTCGAATTATTGTGGGAATTAGC  >  W3110S.gb/1684329‑1684393                                                                 | gTCACCCTGGCTAACACTGAAATCTCGCTCTCGACAGCTGATTTCGAATTATTGTTGGATTTAGc  <  1:1080894/65‑1 (MQ=255) gTCACCCTGGCTAACACTGAAATCTCGCTCTCGACAGCTGATTTCGAATTATTGTGGGAATTAGc  <  1:444149/65‑1 (MQ=255) gTCACCCTGGCTAACACTGAAATCTCGCTCTCGACAGCTGATTTCGAATTATTGTGGGAATTAGc  <  1:1961932/65‑1 (MQ=255) gTCACCCTGGCTAACACTGAAATCTCGCTCTCGACAGCTGATTTCGAATTATTGTGGGAATTAGc  <  1:1984518/65‑1 (MQ=255) gTCACCCTGGCTAACACTGAAATCTCGCTCTCGACAGCTGATTTCGAATTATTGTGGGAATTAGc  <  1:2050718/65‑1 (MQ=255) gTCACCCTGGCTAACACTGAAATCTCGCTCTCGACAGCTGATTTCGAATTATTGTGGGAATTAGc  <  1:2460383/65‑1 (MQ=255) gTCACCCTGGCTAACACTGAAATCTCGCTCTCGACAGCTGATTTCGAATTATTGTGGGAATTAGc  <  1:249034/65‑1 (MQ=255) gTCACCCTGGCTAACACTGAAATCTCGCTCTCGACAGCTGATTTCGAATTATTGTGGGAATTAGc  <  1:2531999/65‑1 (MQ=255) gTCACCCTGGCTAACACTGAAATCTCGCTCTCGACAGCTGATTTCGAATTATTGTGGGAATTAGc  <  1:346671/65‑1 (MQ=255) gTCACCCTGGCTAACACTGAAATCTCGCTCTCGACAGCTGATTTCGAATTATTGTGGGAATTAGc  <  1:368668/65‑1 (MQ=255) gTCACCCTGGCTAACACTGAAATCTCGCTCTCGACAGCTGATTTCGAATTATTGTGGGAATTAGc  <  1:437137/65‑1 (MQ=255) gTCACCCTGGCTAACACTGAAATCTCGCTCTCGACAGCTGATTTCGAATTATTGTGGGAATTAGc  <  1:186033/65‑1 (MQ=255) gTCACCCTGGCTAACACTGAAATCTCGCTCTCGACAGCTGATTTCGAATTATTGTGGGAATTAGc  <  1:476698/65‑1 (MQ=255) gTCACCCTGGCTAACACTGAAATCTCGCTCTCGACAGCTGATTTCGAATTATTGTGGGAATTAGc  <  1:553986/65‑1 (MQ=255) gTCACCCTGGCTAACACTGAAATCTCGCTCTCGACAGCTGATTTCGAATTATTGTGGGAATTAGc  <  1:651382/65‑1 (MQ=255) gTCACCCTGGCTAACACTGAAATCTCGCTCTCGACAGCTGATTTCGAATTATTGTGGGAATTAGc  <  1:656561/65‑1 (MQ=255) gTCACCCTGGCTAACACTGAAATCTCGCTCTCGACAGCTGATTTCGAATTATTGTGGGAATTAGc  <  1:742265/65‑1 (MQ=255) gTCACCCTGGCTAACACTGAAATCTCGCTCTCGACAGCTGATTTCGAATTATTGTGGGAATTAGc  <  1:856861/65‑1 (MQ=255) gTCACCCTGGCTAACACTGAAATCTCGCTCTCGACAGCTGATTTCGAATTATTGTGGGAATTAGc  <  1:931285/65‑1 (MQ=255) gTCACCCTGGCTAACACTGAAATCTCGCTCTCGACAGCTGATTTCGAATTATTGTGGGAATTAGc  <  1:933560/65‑1 (MQ=255) gTCACCCTGGCTAACACTGAAATCTCGCTCTCGACAGCTGATTTCGAATTATTGTGGGAATTAGc  <  1:1858964/65‑1 (MQ=255) gTCACCCTGGCTAACACTGAAATCTCGCTCTCGACAGCTGATTTCGAATTATTGTGGGAATTAGc  <  1:1077527/65‑1 (MQ=255) gTCACCCTGGCTAACACTGAAATCTCGCTCTCGACAGCTGATTTCGAATTATTGTGGGAATTAGc  <  1:1148395/65‑1 (MQ=255) gTCACCCTGGCTAACACTGAAATCTCGCTCTCGACAGCTGATTTCGAATTATTGTGGGAATTAGc  <  1:1214486/65‑1 (MQ=255) gTCACCCTGGCTAACACTGAAATCTCGCTCTCGACAGCTGATTTCGAATTATTGTGGGAATTAGc  <  1:1261299/65‑1 (MQ=255) gTCACCCTGGCTAACACTGAAATCTCGCTCTCGACAGCTGATTTCGAATTATTGTGGGAATTAGc  <  1:1277154/65‑1 (MQ=255) gTCACCCTGGCTAACACTGAAATCTCGCTCTCGACAGCTGATTTCGAATTATTGTGGGAATTAGc  <  1:139354/65‑1 (MQ=255) gTCACCCTGGCTAACACTGAAATCTCGCTCTCGACAGCTGATTTCGAATTATTGTGGGAATTAGc  <  1:1425517/65‑1 (MQ=255) gTCACCCTGGCTAACACTGAAATCTCGCTCTCGACAGCTGATTTCGAATTATTGTGGGAATTAGc  <  1:1452399/65‑1 (MQ=255) gTCACCCTGGCTAACACTGAAATCTCGCTCTCGACAGCTGATTTCGAATTATTGTGGGAATTAGc  <  1:1580400/65‑1 (MQ=255) gTCACCCTGGCTAACACTGAAATCTCGCTCTCGACAGCTGATTTCGAATTATTGTGGGAATTAGc  <  1:1628577/65‑1 (MQ=255) gTCACCCTGGCTAACACTGAAATCTCGCTCTCGACAGCTGATTTCGAATTATTGTGGGAATTAGc  <  1:1653505/65‑1 (MQ=255) gTCACCCTGGCTAACACTGAAATCTCGCTCTCGACAGCTGATTTCGAATTATTGTGGGAATTAGc  <  1:1664470/65‑1 (MQ=255) gTCACCCTGGCTAACACTGAAATCTCGCTCTCGACAGCTGATTTCGAATTATTGTGGGAATTAGc  <  1:1710030/65‑1 (MQ=255) gTCACCCTGGCTAACACTGAAATCTCGCTCTCGACAGCTGATTTCGAATTATTGTGGGAATTAGc  <  1:1739740/65‑1 (MQ=255) gTCACCCTGGCTAACACTGAAATCTCGCTCTCGACAGCTGATTTCGAATTATTGTGGGAATTAGc  <  1:1747753/65‑1 (MQ=255) gTCACCCTGGCTAACACTGAAATCTCGCTCTCGACAGCTGATTTCGAATTATTGTGGGAATTAGc  <  1:1805766/65‑1 (MQ=255) gTCACCCTGGCTAACACTGAAATCTCGCTCTCGACAGCTGATTTCGAATTATTGTGGGAATTAGc  <  1:1025964/65‑1 (MQ=255) gTCACCCTGGCTAACACTGAAATCTCGCTCTCGACAGCTGATTTCGAATTATTGTGGCAATTAGc  <  1:933234/65‑1 (MQ=255) gTCACCCTGGCTAACACTGAAATCTAGCTCTCGACAGCTGATTTCGAATTATTGTGGGAATTAGc  <  1:1033250/65‑1 (MQ=255)  tCACCCTGGCTAACACTGAAATCTCGCTCTCGACAGCTGATTTCGAATTATTGTGGGAACTAGc  <  1:67294/64‑1 (MQ=255)                                                                 | GTCACCCTGGCTAACACTGAAATCTCGCTCTCGACAGCTGATTTCGAATTATTGTGGGAATTAGC  >  W3110S.gb/1684329‑1684393

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑