Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1736608	1736619	12	35 [0]	[0] 16	ydhO	predicted lipoprotein

CGCACAAAGCGAAGGTGCAAAAAGCTACGAAAGTGGCAATGAATAAACTGATGCAGCAAATTGGT  >  W3110S.gb/1736543‑1736607                                                                 | cgcACAAAGCGAAGGTGCAAAAAGCTACGAAGGTGGCAATGAATAAACTGATGCAGCAAATTGGt  <  1:1124591/65‑1 (MQ=255) cgcACAAAGCGAAGGTGCAAAAAGCTACGAAAGTGGCAATGAATAAACTGATGCAGCAAATTGGt  <  1:2361292/65‑1 (MQ=255) cgcACAAAGCGAAGGTGCAAAAAGCTACGAAAGTGGCAATGAATAAACTGATGCAGCAAATTGGt  <  1:988032/65‑1 (MQ=255) cgcACAAAGCGAAGGTGCAAAAAGCTACGAAAGTGGCAATGAATAAACTGATGCAGCAAATTGGt  <  1:2541467/65‑1 (MQ=255) cgcACAAAGCGAAGGTGCAAAAAGCTACGAAAGTGGCAATGAATAAACTGATGCAGCAAATTGGt  <  1:394534/65‑1 (MQ=255) cgcACAAAGCGAAGGTGCAAAAAGCTACGAAAGTGGCAATGAATAAACTGATGCAGCAAATTGGt  <  1:41071/65‑1 (MQ=255) cgcACAAAGCGAAGGTGCAAAAAGCTACGAAAGTGGCAATGAATAAACTGATGCAGCAAATTGGt  <  1:482979/65‑1 (MQ=255) cgcACAAAGCGAAGGTGCAAAAAGCTACGAAAGTGGCAATGAATAAACTGATGCAGCAAATTGGt  <  1:527395/65‑1 (MQ=255) cgcACAAAGCGAAGGTGCAAAAAGCTACGAAAGTGGCAATGAATAAACTGATGCAGCAAATTGGt  <  1:543910/65‑1 (MQ=255) cgcACAAAGCGAAGGTGCAAAAAGCTACGAAAGTGGCAATGAATAAACTGATGCAGCAAATTGGt  <  1:633275/65‑1 (MQ=255) cgcACAAAGCGAAGGTGCAAAAAGCTACGAAAGTGGCAATGAATAAACTGATGCAGCAAATTGGt  <  1:738602/65‑1 (MQ=255) cgcACAAAGCGAAGGTGCAAAAAGCTACGAAAGTGGCAATGAATAAACTGATGCAGCAAATTGGt  <  1:746013/65‑1 (MQ=255) cgcACAAAGCGAAGGTGCAAAAAGCTACGAAAGTGGCAATGAATAAACTGATGCAGCAAATTGGt  <  1:822950/65‑1 (MQ=255) cgcACAAAGCGAAGGTGCAAAAAGCTACGAAAGTGGCAATGAATAAACTGATGCAGCAAATTGGt  <  1:824299/65‑1 (MQ=255) cgcACAAAGCGAAGGTGCAAAAAGCTACGAAAGTGGCAATGAATAAACTGATGCAGCAAATTGGt  <  1:893049/65‑1 (MQ=255) cgcACAAAGCGAAGGTGCAAAAAGCTACGAAAGTGGCAATGAATAAACTGATGCAGCAAATTGGt  <  1:909884/65‑1 (MQ=255) cgcACAAAGCGAAGGTGCAAAAAGCTACGAAAGTGGCAATGAATAAACTGATGCAGCAAATTGGt  <  1:1081761/65‑1 (MQ=255) cgcACAAAGCGAAGGTGCAAAAAGCTACGAAAGTGGCAATGAATAAACTGATGCAGCAAATTGGt  <  1:1496677/65‑1 (MQ=255) cgcACAAAGCGAAGGTGCAAAAAGCTACGAAAGTGGCAATGAATAAACTGATGCAGCAAATTGGt  <  1:1137641/65‑1 (MQ=255) cgcACAAAGCGAAGGTGCAAAAAGCTACGAAAGTGGCAATGAATAAACTGATGCAGCAAATTGGt  <  1:1159695/65‑1 (MQ=255) cgcACAAAGCGAAGGTGCAAAAAGCTACGAAAGTGGCAATGAATAAACTGATGCAGCAAATTGGt  <  1:1248914/65‑1 (MQ=255) cgcACAAAGCGAAGGTGCAAAAAGCTACGAAAGTGGCAATGAATAAACTGATGCAGCAAATTGGt  <  1:128894/65‑1 (MQ=255) cgcACAAAGCGAAGGTGCAAAAAGCTACGAAAGTGGCAATGAATAAACTGATGCAGCAAATTGGt  <  1:1334870/65‑1 (MQ=255) cgcACAAAGCGAAGGTGCAAAAAGCTACGAAAGTGGCAATGAATAAACTGATGCAGCAAATTGGt  <  1:1361226/65‑1 (MQ=255) cgcACAAAGCGAAGGTGCAAAAAGCTACGAAAGTGGCAATGAATAAACTGATGCAGCAAATTGGt  <  1:1499555/65‑1 (MQ=255) cgcACAAAGCGAAGGTGCAAAAAGCTACGAAAGTGGCAATGAATAAACTGATGCAGCAAATTGGt  <  1:1525987/65‑1 (MQ=255) cgcACAAAGCGAAGGTGCAAAAAGCTACGAAAGTGGCAATGAATAAACTGATGCAGCAAATTGGt  <  1:1936725/65‑1 (MQ=255) cgcACAAAGCGAAGGTGCAAAAAGCTACGAAAGTGGCAATGAATAAACTGATGCAGCAAATTGGt  <  1:2029421/65‑1 (MQ=255) cgcACAAAGCGAAGGTGCAAAAAGCTACGAAAGTGGCAATGAATAAACTGATGCAGCAAATTGGt  <  1:2196779/65‑1 (MQ=255) cgcACAAAGCGAAGGTGCAAAAAGCTACGAAAGTGGCAATGAATAAACTGATGCAGCAAATTGGt  <  1:2257078/65‑1 (MQ=255)  gcACAAAGCGAAGGTGCAAAAAGCTACGAAAGTGGCAATGAATAAACTGATGCAGCAAATTGGt  <  1:2297385/64‑1 (MQ=255)  gcACAAAGCGAAGGTGCAAAAAGCTACGAAAGTGGCAATGAATAAACTGATGCAGCAAATTGGt  <  1:1945351/64‑1 (MQ=255)     caAAGCGAAGGTGCAAAAAGCTACGAAAGTGTCAATGAATAAACTGATGCAGCAAATTGGt  <  1:1362192/61‑1 (MQ=255)                     aaaGCTACGAAAGTGGCAATGAATAAACTGATGCAGCAAATTGGt  <  1:341472/45‑1 (MQ=255)                      aaGCTACGAAAGTGGCAATGAATAAACTGATGCAGCAAATTGGt  <  1:639023/44‑1 (MQ=255)                                                                 | CGCACAAAGCGAAGGTGCAAAAAGCTACGAAAGTGGCAATGAATAAACTGATGCAGCAAATTGGT  >  W3110S.gb/1736543‑1736607

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑