Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1747284	1747305	22	24 [0]	[0] 21	ydhQ	conserved hypothetical protein

ACAATAGTGTCAGAGTCTTCACCACCGAGATTATTCATGGTGCCACCAGCAAGCAACGTATCACT  >  W3110S.gb/1747219‑1747283                                                                 | acaaTAGTGTCAGAGTCTTCACCACCGAGATTATTCATGGTGCCACCAGCAAGCAACGTATCACt  >  1:2342493/1‑65 (MQ=255) acaaTAGTGTCAGAGTCTTCACCACCGAGATTATTCATGGTGCCACCAGCAAGCAACGTATCACt  >  1:954487/1‑65 (MQ=255) acaaTAGTGTCAGAGTCTTCACCACCGAGATTATTCATGGTGCCACCAGCAAGCAACGTATCACt  >  1:907913/1‑65 (MQ=255) acaaTAGTGTCAGAGTCTTCACCACCGAGATTATTCATGGTGCCACCAGCAAGCAACGTATCACt  >  1:868243/1‑65 (MQ=255) acaaTAGTGTCAGAGTCTTCACCACCGAGATTATTCATGGTGCCACCAGCAAGCAACGTATCACt  >  1:503467/1‑65 (MQ=255) acaaTAGTGTCAGAGTCTTCACCACCGAGATTATTCATGGTGCCACCAGCAAGCAACGTATCACt  >  1:443732/1‑65 (MQ=255) acaaTAGTGTCAGAGTCTTCACCACCGAGATTATTCATGGTGCCACCAGCAAGCAACGTATCACt  >  1:346038/1‑65 (MQ=255) acaaTAGTGTCAGAGTCTTCACCACCGAGATTATTCATGGTGCCACCAGCAAGCAACGTATCACt  >  1:288062/1‑65 (MQ=255) acaaTAGTGTCAGAGTCTTCACCACCGAGATTATTCATGGTGCCACCAGCAAGCAACGTATCACt  >  1:2494064/1‑65 (MQ=255) acaaTAGTGTCAGAGTCTTCACCACCGAGATTATTCATGGTGCCACCAGCAAGCAACGTATCACt  >  1:2478572/1‑65 (MQ=255) acaaTAGTGTCAGAGTCTTCACCACCGAGATTATTCATGGTGCCACCAGCAAGCAACGTATCACt  >  1:2470539/1‑65 (MQ=255) acaaTAGTGTCAGAGTCTTCACCACCGAGATTATTCATGGTGCCACCAGCAAGCAACGTATCACt  >  1:2426777/1‑65 (MQ=255) acaaTAGTGTCAGAGTCTTCACCACCGAGATTATTCATGGTGCCACCAGCAAGCAACGTATCACt  >  1:1078815/1‑65 (MQ=255) acaaTAGTGTCAGAGTCTTCACCACCGAGATTATTCATGGTGCCACCAGCAAGCAACGTATCACt  >  1:2199043/1‑65 (MQ=255) acaaTAGTGTCAGAGTCTTCACCACCGAGATTATTCATGGTGCCACCAGCAAGCAACGTATCACt  >  1:2176274/1‑65 (MQ=255) acaaTAGTGTCAGAGTCTTCACCACCGAGATTATTCATGGTGCCACCAGCAAGCAACGTATCACt  >  1:19852/1‑65 (MQ=255) acaaTAGTGTCAGAGTCTTCACCACCGAGATTATTCATGGTGCCACCAGCAAGCAACGTATCACt  >  1:196080/1‑65 (MQ=255) acaaTAGTGTCAGAGTCTTCACCACCGAGATTATTCATGGTGCCACCAGCAAGCAACGTATCACt  >  1:1718846/1‑65 (MQ=255) acaaTAGTGTCAGAGTCTTCACCACCGAGATTATTCATGGTGCCACCAGCAAGCAACGTATCACt  >  1:1700149/1‑65 (MQ=255) acaaTAGTGTCAGAGTCTTCACCACCGAGATTATTCATGGTGCCACCAGCAAGCAACGTATCACt  >  1:1559737/1‑65 (MQ=255) acaaTAGTGTCAGAGTCTTCACCACCGAGATTATTCATGGTGCCACCAGCAAGCAACGTATCACt  >  1:1504364/1‑65 (MQ=255) acaaTAGTGTCAGAGTCTTCACCACCGAGATTATTCATGGTGCCACCAGCAAGCAACGTATCACt  >  1:1396758/1‑65 (MQ=255) acaaTAGTGTCAGAGTCTTCACCACCGAGATTATTCATGGTGCCACCAGCAAGCAACGTATCACt  >  1:1179471/1‑65 (MQ=255) acaaTAGTGTCAGAGTCTTCACCACCGAGATTATTCATGGTGCCACCAGCAAGCAACGTATCACt  >  1:1110633/1‑65 (MQ=255)                                                                 | ACAATAGTGTCAGAGTCTTCACCACCGAGATTATTCATGGTGCCACCAGCAAGCAACGTATCACT  >  W3110S.gb/1747219‑1747283

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑