Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1800149	1800354	206	28 [0]	[3] 12	pheS	phenylalanine tRNA synthetase, alpha subunit

GCCAGGCGCGATGATACGAATCGGTGGCTGCTGGGCTTTCATGGTGCGGATCTGTACGCCAGAGG  >  W3110S.gb/1800084‑1800148                                                                 | gCCAGGCGCGATGATACGAATCGGTGGCTGCTGGGCTTTCATGGTGCGGATCTGTACGCCAGAgg  <  1:2249481/65‑1 (MQ=255) gCCAGGCGCGATGATACGAATCGGTGGCTGCTGGGCTTTCATGGTGCGGATCTGTACGCCAGAgg  <  1:86250/65‑1 (MQ=255) gCCAGGCGCGATGATACGAATCGGTGGCTGCTGGGCTTTCATGGTGCGGATCTGTACGCCAGAgg  <  1:807137/65‑1 (MQ=255) gCCAGGCGCGATGATACGAATCGGTGGCTGCTGGGCTTTCATGGTGCGGATCTGTACGCCAGAgg  <  1:72856/65‑1 (MQ=255) gCCAGGCGCGATGATACGAATCGGTGGCTGCTGGGCTTTCATGGTGCGGATCTGTACGCCAGAgg  <  1:612505/65‑1 (MQ=255) gCCAGGCGCGATGATACGAATCGGTGGCTGCTGGGCTTTCATGGTGCGGATCTGTACGCCAGAgg  <  1:538901/65‑1 (MQ=255) gCCAGGCGCGATGATACGAATCGGTGGCTGCTGGGCTTTCATGGTGCGGATCTGTACGCCAGAgg  <  1:2519912/65‑1 (MQ=255) gCCAGGCGCGATGATACGAATCGGTGGCTGCTGGGCTTTCATGGTGCGGATCTGTACGCCAGAgg  <  1:2489172/65‑1 (MQ=255) gCCAGGCGCGATGATACGAATCGGTGGCTGCTGGGCTTTCATGGTGCGGATCTGTACGCCAGAgg  <  1:244556/65‑1 (MQ=255) gCCAGGCGCGATGATACGAATCGGTGGCTGCTGGGCTTTCATGGTGCGGATCTGTACGCCAGAgg  <  1:2252919/65‑1 (MQ=255) gCCAGGCGCGATGATACGAATCGGTGGCTGCTGGGCTTTCATGGTGCGGATCTGTACGCCAGAgg  <  1:2245704/65‑1 (MQ=255) gCCAGGCGCGATGATACGAATCGGTGGCTGCTGGGCTTTCATGGTGCGGATCTGTACGCCAGAgg  <  1:2159139/65‑1 (MQ=255) gCCAGGCGCGATGATACGAATCGGTGGCTGCTGGGCTTTCATGGTGCGGATCTGTACGCCAGAgg  <  1:2123925/65‑1 (MQ=255) gCCAGGCGCGATGATACGAATCGGTGGCTGCTGGGCTTTCATGGTGCGGATCTGTACGCCAGAgg  <  1:1919221/65‑1 (MQ=255) gCCAGGCGCGATGATACGAATCGGTGGCTGCTGGGCTTTCATGGTGCGGATCTGTACGCCAGAgg  <  1:1783808/65‑1 (MQ=255) gCCAGGCGCGATGATACGAATCGGTGGCTGCTGGGCTTTCATGGTGCGGATCTGTACGCCAGAgg  <  1:1604326/65‑1 (MQ=255) gCCAGGCGCGATGATACGAATCGGTGGCTGCTGGGCTTTCATGGTGCGGATCTGTACGCCAGAgg  <  1:136521/65‑1 (MQ=255) gCCAGGCGCGATGATACGAATCGGTGGCTGCTGGGCTTTCATGGTGCGGATCTGTACGCCAGAgg  <  1:1227707/65‑1 (MQ=255) gCCAGGCGCGATGATACGAATCGGTGGCTGCTGGGCTTTCATGGTGCGGATCTGTACGCCAGAgg  <  1:1157255/65‑1 (MQ=255) gCCAGGCGCGATGATACGAATCGGTGGCTGCTGGGCTTTCATGGTGCGGATCTGTACGCCAGAgg  <  1:114421/65‑1 (MQ=255) gCCAGGCGCGATGATACGAATCGGTGGCTGCTGGGCTTTCATGGTGCGGATCTGTACGCCAGAgg  <  1:1058676/65‑1 (MQ=255)  ccAGGCGCGATGATACGAATCGGTGGCTGCTGGGCTTTCATGGTGCGGATCTGTACGCCAGAgg  <  1:2010005/64‑1 (MQ=255)  ccAGGCGCGATGATACGAATCGGTGGCTGCTGGGCTTTCATGGTGCGGATCTGTACGCCAGAgg  <  1:1675106/64‑1 (MQ=255)  ccAGGCGCGATGATACGAATCGGTGGCTGCTGGGCTTTCATGGTGCGGATCTGTACGCCAGAgg  <  1:2510817/64‑1 (MQ=255)  ccAGGCGCGATGATACGAATCGGTGGCTGCTGGGCTTTCATGGTGCGGATCTGTACGCCAGAgg  <  1:487419/64‑1 (MQ=255)    aGGCGCGATGATACGAATCGGTGGCTGCTGGGCTTTCATGGTGCGGATCTGTACGCCAGAgg  <  1:1055463/62‑1 (MQ=255)                      cGGTGGCTGCTGGGCTTTCATGGTGCGGATCTGTACGCCAGAgg  <  1:2490615/44‑1 (MQ=255)                      cGGTGGCTGCTGGGCTTTCATGGTGCGGATCTGTACGCCAGAgg  <  1:38846/44‑1 (MQ=255)                                                                 | GCCAGGCGCGATGATACGAATCGGTGGCTGCTGGGCTTTCATGGTGCGGATCTGTACGCCAGAGG  >  W3110S.gb/1800084‑1800148

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑