Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1826722	1826806	85	19 [0]	[0] 13	ydjR/spy	conserved hypothetical protein/envelope stress induced periplasmic protein

CTCCCGGCCCGTTCTTTTCATTGTTATCGTTCAGGTAACCGTGGATGGTTATCGGCAACTCGGGT  >  W3110S.gb/1826657‑1826721                                                                 | cTCCCGGCCCGTTCTTTTCATTGTTATCGTTCAGGTAACCGTGGATGGTTATCGGCAACTCGGGt  >  1:1920094/1‑65 (MQ=255) cTCCCGGCCCGTTCTTTTCATTGTTATCGTTCAGGTAACCGTGGATGGTTATCGGCAACTCGGGt  >  1:799679/1‑65 (MQ=255) cTCCCGGCCCGTTCTTTTCATTGTTATCGTTCAGGTAACCGTGGATGGTTATCGGCAACTCGGGt  >  1:79128/1‑65 (MQ=255) cTCCCGGCCCGTTCTTTTCATTGTTATCGTTCAGGTAACCGTGGATGGTTATCGGCAACTCGGGt  >  1:750749/1‑65 (MQ=255) cTCCCGGCCCGTTCTTTTCATTGTTATCGTTCAGGTAACCGTGGATGGTTATCGGCAACTCGGGt  >  1:552802/1‑65 (MQ=255) cTCCCGGCCCGTTCTTTTCATTGTTATCGTTCAGGTAACCGTGGATGGTTATCGGCAACTCGGGt  >  1:462174/1‑65 (MQ=255) cTCCCGGCCCGTTCTTTTCATTGTTATCGTTCAGGTAACCGTGGATGGTTATCGGCAACTCGGGt  >  1:446549/1‑65 (MQ=255) cTCCCGGCCCGTTCTTTTCATTGTTATCGTTCAGGTAACCGTGGATGGTTATCGGCAACTCGGGt  >  1:286639/1‑65 (MQ=255) cTCCCGGCCCGTTCTTTTCATTGTTATCGTTCAGGTAACCGTGGATGGTTATCGGCAACTCGGGt  >  1:2035756/1‑65 (MQ=255) cTCCCGGCCCGTTCTTTTCATTGTTATCGTTCAGGTAACCGTGGATGGTTATCGGCAACTCGGGt  >  1:1151783/1‑65 (MQ=255) cTCCCGGCCCGTTCTTTTCATTGTTATCGTTCAGGTAACCGTGGATGGTTATCGGCAACTCGGGt  >  1:1832051/1‑65 (MQ=255) cTCCCGGCCCGTTCTTTTCATTGTTATCGTTCAGGTAACCGTGGATGGTTATCGGCAACTCGGGt  >  1:1681927/1‑65 (MQ=255) cTCCCGGCCCGTTCTTTTCATTGTTATCGTTCAGGTAACCGTGGATGGTTATCGGCAACTCGGGt  >  1:1505152/1‑65 (MQ=255) cTCCCGGCCCGTTCTTTTCATTGTTATCGTTCAGGTAACCGTGGATGGTTATCGGCAACTCGGGt  >  1:1452287/1‑65 (MQ=255) cTCCCGGCCCGTTCTTTTCATTGTTATCGTTCAGGTAACCGTGGATGGTTATCGGCAACTCGGGt  >  1:1416668/1‑65 (MQ=255) cTCCCGGCCCGTTCTTTTCATTGTTATCGTTCAGGTAACCGTGGATGGTTATCGGCAACTCGGGt  >  1:1416340/1‑65 (MQ=255) cTCCCGGCCCGTTCTTTTCATTGTTATCGTTCAGGTAACCGTGGATGGTTATCGGCAACTCGGGt  >  1:1299413/1‑65 (MQ=255) cTCCCGGCCCGTTCTTTTCATTGTTATCGTTCAGGTAACCGTGGATGGTTATAGGCAACTCGGGt  >  1:599492/1‑65 (MQ=255) atCCCGGCCCGTTCTTTTCATTGTTATCGTTCAGGTAACCGTGGATGGTTATCGGCAAATCGGGt  >  1:1190071/2‑65 (MQ=255)                                                                 | CTCCCGGCCCGTTCTTTTCATTGTTATCGTTCAGGTAACCGTGGATGGTTATCGGCAACTCGGGT  >  W3110S.gb/1826657‑1826721

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑