Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	96244	96261	18	39 [0]	[0] 5	mraY	phospho‑N‑acetylmuramoyl‑pentapeptide transferase

GACGGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGAC  >  W3110S.gb/96179‑96243                                                                 | gacgGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGTATTATGATCCTGAc  <  1:391885/65‑1 (MQ=255) gacgGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGAc  <  1:542001/65‑1 (MQ=255) gacgGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGAc  <  1:1019395/65‑1 (MQ=255) gacgGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGAc  <  1:2231911/65‑1 (MQ=255) gacgGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGAc  <  1:2286376/65‑1 (MQ=255) gacgGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGAc  <  1:2409654/65‑1 (MQ=255) gacgGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGAc  <  1:2439488/65‑1 (MQ=255) gacgGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGAc  <  1:2470923/65‑1 (MQ=255) gacgGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGAc  <  1:2480013/65‑1 (MQ=255) gacgGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGAc  <  1:286703/65‑1 (MQ=255) gacgGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGAc  <  1:2138837/65‑1 (MQ=255) gacgGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGAc  <  1:617589/65‑1 (MQ=255) gacgGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGAc  <  1:70847/65‑1 (MQ=255) gacgGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGAc  <  1:72167/65‑1 (MQ=255) gacgGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGAc  <  1:736894/65‑1 (MQ=255) gacgGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGAc  <  1:76213/65‑1 (MQ=255) gacgGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGAc  <  1:784842/65‑1 (MQ=255) gacgGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGAc  <  1:920343/65‑1 (MQ=255) gacgGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGAc  <  1:950028/65‑1 (MQ=255) gacgGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGAc  <  1:1530224/65‑1 (MQ=255) gacgGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGAc  <  1:1073125/65‑1 (MQ=255) gacgGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGAc  <  1:1077938/65‑1 (MQ=255) gacgGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGAc  <  1:1208589/65‑1 (MQ=255) gacgGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGAc  <  1:1246571/65‑1 (MQ=255) gacgGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGAc  <  1:1249781/65‑1 (MQ=255) gacgGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGAc  <  1:1355761/65‑1 (MQ=255) gacgGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGAc  <  1:1377878/65‑1 (MQ=255) gacgGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGAc  <  1:1386915/65‑1 (MQ=255) gacgGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGAc  <  1:1439137/65‑1 (MQ=255) gacgGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGAc  <  1:1718376/65‑1 (MQ=255) gacgGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGAc  <  1:1541290/65‑1 (MQ=255) gacgGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGAc  <  1:1572964/65‑1 (MQ=255) gacgGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGAc  <  1:1584668/65‑1 (MQ=255) gacgGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGAc  <  1:1587635/65‑1 (MQ=255) gacgGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGAc  <  1:1596084/65‑1 (MQ=255) gacgGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGAc  <  1:1639242/65‑1 (MQ=255) gacgGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGAc  <  1:1656500/65‑1 (MQ=255)      tCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGAc  <  1:2528336/60‑1 (MQ=255)       ccTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGAc  <  1:2169796/59‑1 (MQ=255)                                                                 | GACGGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGAC  >  W3110S.gb/96179‑96243

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑