Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1960087	1960194	108	41 [0]	[0] 19	torY/cutC	TMAO reductase III (TorYZ), cytochrome c‑type subunit/copper homeostasis protein

TATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACA  >  W3110S.gb/1960022‑1960086                                                                 | tatTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGcaca  <  1:60255/65‑1 (MQ=255) tatTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGcaca  <  1:2387947/65‑1 (MQ=255) tatTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGcaca  <  1:2506729/65‑1 (MQ=255) tatTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGcaca  <  1:2526862/65‑1 (MQ=255) tatTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGcaca  <  1:2538518/65‑1 (MQ=255) tatTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGcaca  <  1:385973/65‑1 (MQ=255) tatTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGcaca  <  1:39874/65‑1 (MQ=255) tatTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGcaca  <  1:451651/65‑1 (MQ=255) tatTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGcaca  <  1:559993/65‑1 (MQ=255) tatTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGcaca  <  1:570863/65‑1 (MQ=255) tatTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGcaca  <  1:2337874/65‑1 (MQ=255) tatTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGcaca  <  1:730359/65‑1 (MQ=255) tatTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGcaca  <  1:775726/65‑1 (MQ=255) tatTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGcaca  <  1:789500/65‑1 (MQ=255) tatTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGcaca  <  1:80771/65‑1 (MQ=255) tatTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGcaca  <  1:808188/65‑1 (MQ=255) tatTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGcaca  <  1:819663/65‑1 (MQ=255) tatTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGcaca  <  1:839617/65‑1 (MQ=255) tatTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGcaca  <  1:947090/65‑1 (MQ=255) tatTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGcaca  <  1:968353/65‑1 (MQ=255) tatTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGcaca  <  1:1833401/65‑1 (MQ=255) tatTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGcaca  <  1:1093113/65‑1 (MQ=255) tatTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGcaca  <  1:1121880/65‑1 (MQ=255) tatTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGcaca  <  1:1177526/65‑1 (MQ=255) tatTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGcaca  <  1:1404145/65‑1 (MQ=255) tatTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGcaca  <  1:1444391/65‑1 (MQ=255) tatTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGcaca  <  1:1493470/65‑1 (MQ=255) tatTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGcaca  <  1:1789913/65‑1 (MQ=255) tatTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGcaca  <  1:1795834/65‑1 (MQ=255) tatTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGcaca  <  1:1075951/65‑1 (MQ=255) tatTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGcaca  <  1:1858854/65‑1 (MQ=255) tatTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGcaca  <  1:1973176/65‑1 (MQ=255) tatTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGcaca  <  1:2027649/65‑1 (MQ=255) tatTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGcaca  <  1:2052458/65‑1 (MQ=255) tatTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGcaca  <  1:2136756/65‑1 (MQ=255) tatTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGcaca  <  1:2259270/65‑1 (MQ=255) tatTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGcaca  <  1:2301030/65‑1 (MQ=255) tatTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGcaca  <  1:2305497/65‑1 (MQ=255) tatTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAACATATACAATATTTTTAGcaca  <  1:947544/65‑1 (MQ=255)   tttATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGcaca  <  1:2044703/63‑1 (MQ=255)   tttATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGcaca  <  1:1323858/63‑1 (MQ=255)                                                                 | TATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCACA  >  W3110S.gb/1960022‑1960086

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑