Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1964485	1964526	42	14 [0]	[3] 11	flhE	flagellar protein

GGTTCCGCTCTGCCCCTCTAATTCGACACAACGAGATTGCGAACACAAGCGAACCCGCAGTCCTG  >  W3110S.gb/1964420‑1964484                                                                 | ggtTCCGCTCTGCCCCTCTAATTCGACAGAACGAGATTGCGAACACAAGCGAACCCGCAGTCCTg  <  1:1019012/65‑1 (MQ=255) ggtTCCGCTCTGCCCCTCTAATTCGACACAACGAGATTGCGAACACAAGCGAACCCGCAGTCCTg  <  1:1327039/65‑1 (MQ=255) ggtTCCGCTCTGCCCCTCTAATTCGACACAACGAGATTGCGAACACAAGCGAACCCGCAGTCCTg  <  1:1498516/65‑1 (MQ=255) ggtTCCGCTCTGCCCCTCTAATTCGACACAACGAGATTGCGAACACAAGCGAACCCGCAGTCCTg  <  1:1518572/65‑1 (MQ=255) ggtTCCGCTCTGCCCCTCTAATTCGACACAACGAGATTGCGAACACAAGCGAACCCGCAGTCCTg  <  1:1709756/65‑1 (MQ=255) ggtTCCGCTCTGCCCCTCTAATTCGACACAACGAGATTGCGAACACAAGCGAACCCGCAGTCCTg  <  1:1731896/65‑1 (MQ=255) ggtTCCGCTCTGCCCCTCTAATTCGACACAACGAGATTGCGAACACAAGCGAACCCGCAGTCCTg  <  1:1885831/65‑1 (MQ=255) ggtTCCGCTCTGCCCCTCTAATTCGACACAACGAGATTGCGAACACAAGCGAACCCGCAGTCCTg  <  1:1945125/65‑1 (MQ=255) ggtTCCGCTCTGCCCCTCTAATTCGACACAACGAGATTGCGAACACAAGCGAACCCGCAGTCCTg  <  1:2193624/65‑1 (MQ=255) ggtTCCGCTCTGCCCCTCTAATTCGACACAACGAGATTGCGAACACAAGCGAACCCGCAGTCCTg  <  1:2225034/65‑1 (MQ=255) ggtTCCGCTCTGCCCCTCTAATTCGACACAACGAGATTGCGAACACAAGCGAACCCGCAGTCCTg  <  1:2485529/65‑1 (MQ=255) ggtTCCGCTCTGCCCCTCTAATTCGACACAACGAGATTGCGAACACAAGCGAACCCGCAGTCCTg  <  1:433179/65‑1 (MQ=255) ggtTCCGCTCTGCCCCTCTAATTCGACACAACGAGATTGCGAACACAAGCGAACCCGCAGTCCTg  <  1:966614/65‑1 (MQ=255)  gtTCCGCTCTGCCCCTCTAATTCGACACAACGAGATTGCGAACACAAGCGAACCCGCAGTCCTg  <  1:133248/64‑1 (MQ=255)                                                                 | GGTTCCGCTCTGCCCCTCTAATTCGACACAACGAGATTGCGAACACAAGCGAACCCGCAGTCCTG  >  W3110S.gb/1964420‑1964484

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑