Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1967503	1967563	61	24 [0]	[0] 14	flhB	predicted flagellar export pore protein

GCCAACCAGGATGGTTTTCAAAATTGCTTTAAGCAACTCCGCGCCAGTCTGAGCCGAGAACATCC  >  W3110S.gb/1967438‑1967502                                                                 | gCCAACCAGGATGGTTTTCAAAATTGCTTTAAGCAACTCCGCGCCAGTCTGAGCCGAGAACATcc  <  1:1041947/65‑1 (MQ=255) gCCAACCAGGATGGTTTTCAAAATTGCTTTAAGCAACTCCGCGCCAGTCTGAGCCGAGAACATcc  <  1:854677/65‑1 (MQ=255) gCCAACCAGGATGGTTTTCAAAATTGCTTTAAGCAACTCCGCGCCAGTCTGAGCCGAGAACATcc  <  1:84284/65‑1 (MQ=255) gCCAACCAGGATGGTTTTCAAAATTGCTTTAAGCAACTCCGCGCCAGTCTGAGCCGAGAACATcc  <  1:788477/65‑1 (MQ=255) gCCAACCAGGATGGTTTTCAAAATTGCTTTAAGCAACTCCGCGCCAGTCTGAGCCGAGAACATcc  <  1:752230/65‑1 (MQ=255) gCCAACCAGGATGGTTTTCAAAATTGCTTTAAGCAACTCCGCGCCAGTCTGAGCCGAGAACATcc  <  1:74888/65‑1 (MQ=255) gCCAACCAGGATGGTTTTCAAAATTGCTTTAAGCAACTCCGCGCCAGTCTGAGCCGAGAACATcc  <  1:735294/65‑1 (MQ=255) gCCAACCAGGATGGTTTTCAAAATTGCTTTAAGCAACTCCGCGCCAGTCTGAGCCGAGAACATcc  <  1:704424/65‑1 (MQ=255) gCCAACCAGGATGGTTTTCAAAATTGCTTTAAGCAACTCCGCGCCAGTCTGAGCCGAGAACATcc  <  1:561141/65‑1 (MQ=255) gCCAACCAGGATGGTTTTCAAAATTGCTTTAAGCAACTCCGCGCCAGTCTGAGCCGAGAACATcc  <  1:46698/65‑1 (MQ=255) gCCAACCAGGATGGTTTTCAAAATTGCTTTAAGCAACTCCGCGCCAGTCTGAGCCGAGAACATcc  <  1:429083/65‑1 (MQ=255) gCCAACCAGGATGGTTTTCAAAATTGCTTTAAGCAACTCCGCGCCAGTCTGAGCCGAGAACATcc  <  1:391008/65‑1 (MQ=255) gCCAACCAGGATGGTTTTCAAAATTGCTTTAAGCAACTCCGCGCCAGTCTGAGCCGAGAACATcc  <  1:333020/65‑1 (MQ=255) gCCAACCAGGATGGTTTTCAAAATTGCTTTAAGCAACTCCGCGCCAGTCTGAGCCGAGAACATcc  <  1:2505716/65‑1 (MQ=255) gCCAACCAGGATGGTTTTCAAAATTGCTTTAAGCAACTCCGCGCCAGTCTGAGCCGAGAACATcc  <  1:2044915/65‑1 (MQ=255) gCCAACCAGGATGGTTTTCAAAATTGCTTTAAGCAACTCCGCGCCAGTCTGAGCCGAGAACATcc  <  1:1978768/65‑1 (MQ=255) gCCAACCAGGATGGTTTTCAAAATTGCTTTAAGCAACTCCGCGCCAGTCTGAGCCGAGAACATcc  <  1:1956530/65‑1 (MQ=255) gCCAACCAGGATGGTTTTCAAAATTGCTTTAAGCAACTCCGCGCCAGTCTGAGCCGAGAACATcc  <  1:1699769/65‑1 (MQ=255) gCCAACCAGGATGGTTTTCAAAATTGCTTTAAGCAACTCCGCGCCAGTCTGAGCCGAGAACATcc  <  1:1629175/65‑1 (MQ=255) gCCAACCAGGATGGTTTTCAAAATTGCTTTAAGCAACTCCGCGCCAGTCTGAGCCGAGAACATcc  <  1:1079900/65‑1 (MQ=255) gCCAACCAGGATGGTTTTCAAAATTGCTTTAAGCAACTCCGCGCCAGTCTGAGCCGAGAACATcc  <  1:1067056/65‑1 (MQ=255) gCCAACCAGGATGGTTTTCAAAATTGCTTTAAGCAACTCCGCGCCAGTCTGAGCCGAGAACATcc  <  1:1009357/65‑1 (MQ=255)           aTGGTTTTCAAAATTGCTTTAAGCAACTCCGCGCCAGTCTGAGCCGAGAACATcc  <  1:939951/55‑1 (MQ=255)            tGGTTTTCAAAATTGCTTTAAGCAACTCCGCGCCAGTCTGAGCCGAGAACATcc  <  1:1405455/54‑1 (MQ=255)                                                                 | GCCAACCAGGATGGTTTTCAAAATTGCTTTAAGCAACTCCGCGCCAGTCTGAGCCGAGAACATCC  >  W3110S.gb/1967438‑1967502

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑