Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1969145	1969156	12	14 [0]	[0] 15	[cheY]	[cheY]

CAGGTTACGCACTATGCGTCGCATGGTGGAAAAGTCATCCACAACCAAAAATTTAAGTTCTTTAT  >  W3110S.gb/1969080‑1969144                                                                 | cagGTTACGCACTATGCGTCGCATGTTGGAAAAGTCATCCACAACCAAAAATTTAAGTTCTTTAt  >  1:783518/1‑65 (MQ=255) cagGTTACGCACTATGCGTCGCATGGTGGAAAAGTCATCCACAACCAAAAATTTAAGTTCTTTAt  >  1:1202826/1‑65 (MQ=255) cagGTTACGCACTATGCGTCGCATGGTGGAAAAGTCATCCACAACCAAAAATTTAAGTTCTTTAt  >  1:1357884/1‑65 (MQ=255) cagGTTACGCACTATGCGTCGCATGGTGGAAAAGTCATCCACAACCAAAAATTTAAGTTCTTTAt  >  1:2034314/1‑65 (MQ=255) cagGTTACGCACTATGCGTCGCATGGTGGAAAAGTCATCCACAACCAAAAATTTAAGTTCTTTAt  >  1:2146162/1‑65 (MQ=255) cagGTTACGCACTATGCGTCGCATGGTGGAAAAGTCATCCACAACCAAAAATTTAAGTTCTTTAt  >  1:2149504/1‑65 (MQ=255) cagGTTACGCACTATGCGTCGCATGGTGGAAAAGTCATCCACAACCAAAAATTTAAGTTCTTTAt  >  1:2165320/1‑65 (MQ=255) cagGTTACGCACTATGCGTCGCATGGTGGAAAAGTCATCCACAACCAAAAATTTAAGTTCTTTAt  >  1:2224785/1‑65 (MQ=255) cagGTTACGCACTATGCGTCGCATGGTGGAAAAGTCATCCACAACCAAAAATTTAAGTTCTTTAt  >  1:2322099/1‑65 (MQ=255) cagGTTACGCACTATGCGTCGCATGGTGGAAAAGTCATCCACAACCAAAAATTTAAGTTCTTTAt  >  1:2421256/1‑65 (MQ=255) cagGTTACGCACTATGCGTCGCATGGTGGAAAAGTCATCCACAACCAAAAATTTAAGTTCTTTAt  >  1:2451505/1‑65 (MQ=255) cagGTTACGCACTATGCGTCGCATGGTGGAAAAGTCATCCACAACCAAAAATTTAAGTTCTTTAt  >  1:292638/1‑65 (MQ=255) cagGTTACGCACTATGCGTCGCATGGTGGAAAAGTCATCCACAACCAAAAATTTAAGTTCTTTAt  >  1:459726/1‑65 (MQ=255) cagGTTACGCACTATGCGTCGCATGGTGGAAAAGTCATCCACAACCAAAAATTTAAGTTCTTTAt  >  1:705959/1‑65 (MQ=255)                                                                 | CAGGTTACGCACTATGCGTCGCATGGTGGAAAAGTCATCCACAACCAAAAATTTAAGTTCTTTAT  >  W3110S.gb/1969080‑1969144

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑