Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1976161	1976245	85	15 [0]	[0] 4	cheA	fused chemotactic sensory histidine kinase (soluble) in two‑component regulatory system with CheB and CheY

GGGCGTTACGTTGTAACTGCCCCATGCTGGTTATCAAATCACCATGATTAACCGGGTCCAGTTCG  >  W3110S.gb/1976096‑1976160                                                                 | gggCGTTACGTTGTAACTGCCCCATGCTGGTTATCAAATCACCATGATTAACCGGGTCCAGTTCg  <  1:1194823/65‑1 (MQ=255) gggCGTTACGTTGTAACTGCCCCATGCTGGTTATCAAATCACCATGATTAACCGGGTCCAGTTCg  <  1:1204392/65‑1 (MQ=255) gggCGTTACGTTGTAACTGCCCCATGCTGGTTATCAAATCACCATGATTAACCGGGTCCAGTTCg  <  1:1286604/65‑1 (MQ=255) gggCGTTACGTTGTAACTGCCCCATGCTGGTTATCAAATCACCATGATTAACCGGGTCCAGTTCg  <  1:1306619/65‑1 (MQ=255) gggCGTTACGTTGTAACTGCCCCATGCTGGTTATCAAATCACCATGATTAACCGGGTCCAGTTCg  <  1:2363166/65‑1 (MQ=255) gggCGTTACGTTGTAACTGCCCCATGCTGGTTATCAAATCACCATGATTAACCGGGTCCAGTTCg  <  1:2367788/65‑1 (MQ=255) gggCGTTACGTTGTAACTGCCCCATGCTGGTTATCAAATCACCATGATTAACCGGGTCCAGTTCg  <  1:2466457/65‑1 (MQ=255) gggCGTTACGTTGTAACTGCCCCATGCTGGTTATCAAATCACCATGATTAACCGGGTCCAGTTCg  <  1:2504604/65‑1 (MQ=255) gggCGTTACGTTGTAACTGCCCCATGCTGGTTATCAAATCACCATGATTAACCGGGTCCAGTTCg  <  1:306065/65‑1 (MQ=255) gggCGTTACGTTGTAACTGCCCCATGCTGGTTATCAAATCACCATGATTAACCGGGTCCAGTTCg  <  1:392195/65‑1 (MQ=255) gggCGTTACGTTGTAACTGCCCCATGCTGGTTATCAAATCACCATGATTAACCGGGTCCAGTTCg  <  1:509488/65‑1 (MQ=255) gggCGTTACGTTGTAACTGCCCCATGCTGGTTATCAAATCACCATGATTAACCGGGTCCAGTTCg  <  1:55378/65‑1 (MQ=255) gggCGTTACGTTGTAACTGCCCCATGCTGGTTATCAAATCACCATGATTAACCGGGTCCAGTTCg  <  1:761742/65‑1 (MQ=255) gggCGTTACGTTGTAACTGCCCCATGCTGGTTATCAAATCACCATGATTAACCGGGTCCAGTTCg  <  1:762900/65‑1 (MQ=255) gggCGTTACGTTGTAACTGCCCCATGCTGGTTATCAAATCACCATGATTAACCGGGTCCAGTTCg  <  1:915531/65‑1 (MQ=255)                                                                 | GGGCGTTACGTTGTAACTGCCCCATGCTGGTTATCAAATCACCATGATTAACCGGGTCCAGTTCG  >  W3110S.gb/1976096‑1976160

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑