Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1977562	1977609	48	28 [0]	[0] 20	motB	protein that enables flagellar motor rotation

CGATTCTGGCTATCGATGATCTGAATACGTAGACCTTCCTGGACCAGATCGATTTTGAGATGGGG  >  W3110S.gb/1977497‑1977561                                                                 | cGATTCTGGCTATCGATTATCTGAATACGTAGACCTTCCTGGACCAGATCGATTTTGAGATgggg  <  1:518268/65‑1 (MQ=255) cGATTCTGGCTATCGATGATCTGAATACGTAGACCTTCCTGGACCAGATCGATTTTGAGATgggg  <  1:1365727/65‑1 (MQ=255) cGATTCTGGCTATCGATGATCTGAATACGTAGACCTTCCTGGACCAGATCGATTTTGAGATgggg  <  1:967736/65‑1 (MQ=255) cGATTCTGGCTATCGATGATCTGAATACGTAGACCTTCCTGGACCAGATCGATTTTGAGATgggg  <  1:906533/65‑1 (MQ=255) cGATTCTGGCTATCGATGATCTGAATACGTAGACCTTCCTGGACCAGATCGATTTTGAGATgggg  <  1:81354/65‑1 (MQ=255) cGATTCTGGCTATCGATGATCTGAATACGTAGACCTTCCTGGACCAGATCGATTTTGAGATgggg  <  1:807931/65‑1 (MQ=255) cGATTCTGGCTATCGATGATCTGAATACGTAGACCTTCCTGGACCAGATCGATTTTGAGATgggg  <  1:705002/65‑1 (MQ=255) cGATTCTGGCTATCGATGATCTGAATACGTAGACCTTCCTGGACCAGATCGATTTTGAGATgggg  <  1:42240/65‑1 (MQ=255) cGATTCTGGCTATCGATGATCTGAATACGTAGACCTTCCTGGACCAGATCGATTTTGAGATgggg  <  1:2529331/65‑1 (MQ=255) cGATTCTGGCTATCGATGATCTGAATACGTAGACCTTCCTGGACCAGATCGATTTTGAGATgggg  <  1:2442737/65‑1 (MQ=255) cGATTCTGGCTATCGATGATCTGAATACGTAGACCTTCCTGGACCAGATCGATTTTGAGATgggg  <  1:230889/65‑1 (MQ=255) cGATTCTGGCTATCGATGATCTGAATACGTAGACCTTCCTGGACCAGATCGATTTTGAGATgggg  <  1:2302811/65‑1 (MQ=255) cGATTCTGGCTATCGATGATCTGAATACGTAGACCTTCCTGGACCAGATCGATTTTGAGATgggg  <  1:2255433/65‑1 (MQ=255) cGATTCTGGCTATCGATGATCTGAATACGTAGACCTTCCTGGACCAGATCGATTTTGAGATgggg  <  1:2189063/65‑1 (MQ=255) cGATTCTGGCTATCGATGATCTGAATACGTAGACCTTCCTGGACCAGATCGATTTTGAGATgggg  <  1:1959372/65‑1 (MQ=255) cGATTCTGGCTATCGATGATCTGAATACGTAGACCTTCCTGGACCAGATCGATTTTGAGATgggg  <  1:1923062/65‑1 (MQ=255) cGATTCTGGCTATCGATGATCTGAATACGTAGACCTTCCTGGACCAGATCGATTTTGAGATgggg  <  1:1905789/65‑1 (MQ=255) cGATTCTGGCTATCGATGATCTGAATACGTAGACCTTCCTGGACCAGATCGATTTTGAGATgggg  <  1:1749610/65‑1 (MQ=255) cGATTCTGGCTATCGATGATCTGAATACGTAGACCTTCCTGGACCAGATCGATTTTGAGATgggg  <  1:1746614/65‑1 (MQ=255) cGATTCTGGCTATCGATGATCTGAATACGTAGACCTTCCTGGACCAGATCGATTTTGAGATgggg  <  1:1613930/65‑1 (MQ=255) cGATTCTGGCTATCGATGATCTGAATACGTAGACCTTCCTGGACCAGATCGATTTTGAGATgggg  <  1:1598052/65‑1 (MQ=255) cGATTCTGGCTATCGATGATCTGAATACGTAGACCTTCCTGGACCAGATCGATTTTGAGATgggg  <  1:1553406/65‑1 (MQ=255) cGATTCTGGCTATCGATGATCTGAATACGTAGACCTTCCTGGACCAGATCGATTTTGAGATgggg  <  1:1521016/65‑1 (MQ=255) cGATTCTGGCTATCGATGATCTGAATACGTAGACCTTCCTGGACCAGATCGATTTTGAGATgggg  <  1:1492783/65‑1 (MQ=255) cGATTCTGGCTATCGATGATCTGAATACGTAGACCTTCCTGGACCAGATCGATTTTGAGATgggg  <  1:1442678/65‑1 (MQ=255) cGATTCTGGCTATCGATGATCTGAATACGTAGACCTTCCTGGACCAGATCGATTTTGAGATgggg  <  1:1030372/65‑1 (MQ=255)  gATTCTGGCTATCGATGATCTGAATACGTAGACCTTCCTGGACCAGATCGATTTTGAGATgggg  <  1:1925130/64‑1 (MQ=255)     tCTGGCTATCGATGATCTGAATACGTAGACCTTCCTGGACCAGATCGATTTTGAGATgggg  <  1:1959590/61‑1 (MQ=255)                                                                 | CGATTCTGGCTATCGATGATCTGAATACGTAGACCTTCCTGGACCAGATCGATTTTGAGATGGGG  >  W3110S.gb/1977497‑1977561

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑