Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1977973	1978033	61	12 [0]	[0] 11	motA	proton conductor component of flagella motor

GCCCCGTGGCTTTTGGCTTTGCGTCGTTTGACGACAATAATCGGATGCGCTTGATTCTTCATGCT  >  W3110S.gb/1977908‑1977972                                                                 | gcCCCGTGGCTTTTGGCTTTGCGTCGTTTGACGACAATAATCGGATGCGCTTGATTCTTCATGCt  >  1:1233024/1‑65 (MQ=255) gcCCCGTGGCTTTTGGCTTTGCGTCGTTTGACGACAATAATCGGATGCGCTTGATTCTTCATGCt  >  1:1339707/1‑65 (MQ=255) gcCCCGTGGCTTTTGGCTTTGCGTCGTTTGACGACAATAATCGGATGCGCTTGATTCTTCATGCt  >  1:1509731/1‑65 (MQ=255) gcCCCGTGGCTTTTGGCTTTGCGTCGTTTGACGACAATAATCGGATGCGCTTGATTCTTCATGCt  >  1:2019604/1‑65 (MQ=255) gcCCCGTGGCTTTTGGCTTTGCGTCGTTTGACGACAATAATCGGATGCGCTTGATTCTTCATGCt  >  1:2091048/1‑65 (MQ=255) gcCCCGTGGCTTTTGGCTTTGCGTCGTTTGACGACAATAATCGGATGCGCTTGATTCTTCATGCt  >  1:2246672/1‑65 (MQ=255) gcCCCGTGGCTTTTGGCTTTGCGTCGTTTGACGACAATAATCGGATGCGCTTGATTCTTCATGCt  >  1:2356430/1‑65 (MQ=255) gcCCCGTGGCTTTTGGCTTTGCGTCGTTTGACGACAATAATCGGATGCGCTTGATTCTTCATGCt  >  1:2358994/1‑65 (MQ=255) gcCCCGTGGCTTTTGGCTTTGCGTCGTTTGACGACAATAATCGGATGCGCTTGATTCTTCATGCt  >  1:2492411/1‑65 (MQ=255) gcCCCGTGGCTTTTGGCTTTGCGTCGTTTGACGACAATAATCGGATGCGCTTGATTCTTCATGCt  >  1:2538035/1‑65 (MQ=255) gcCCCGTGGCTTTTGGCTTTGCGTCGTTTGACGACAATAATCGGATGCGCTTGATTCTTCATGCt  >  1:909808/1‑65 (MQ=255) gcCCCGTGGCTTTTGGCTTTGCGTCGTTTGACGACAATAATCGGATGCGCTTGACTCTTCATGCt  >  1:1103307/1‑65 (MQ=255)                                                                 | GCCCCGTGGCTTTTGGCTTTGCGTCGTTTGACGACAATAATCGGATGCGCTTGATTCTTCATGCT  >  W3110S.gb/1977908‑1977972

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑